Материалы:NC 003198

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_003198            4809037 bp    DNA     circular BCT 04-APR-2006
   DEFINITION  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18,
               complete genome.
   ACCESSION   NC_003198
   VERSION     NC_003198.1  GI:16758993
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
     ORGANISM  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Salmonella; Salmonella enterica subsp. enterica
               serovar Typhi.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4809037)
     AUTHORS   Parkhill,J., Dougan,G., James,K.D., Thomson,N.R., Pickard,D.,
               Wain,J., Churcher,C., Mungall,K.L., Bentley,S.D., Holden,M.T.G.,
               Sebaihia,M., Baker,S., Basham,D., Brooks,K., Chillingworth,T.,
               Connerton,P., Cronin,A., Davis,P., Davies,R.M., Dowd,L., White,N.,
               Farrar,J., Feltwell,T., Hamlin,N., Haque,A., Hien,T.T., Holroyd,S.,
               Jagels,K., Krogh,A., Larsen,T.S., Leather,S., Moule,S., O'Gaora,P.,
               Parry,C., Quail,M., Rutherford,K., Simmonds,M., Skelton,J.,
               Stevens,K., Whitehead,S. and Barrell,B.G.
     TITLE     Complete genome sequence of a multiple drug resistant Salmonella
               enterica serovar Typhi CT18
     JOURNAL   Nature 413 (6858), 848-852 (2001)
      PUBMED   11677608
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4809037)
     AUTHORS   Parkhill,J.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-OCT-2001) Submitted on behalf of the Salmonella
               sequencing team, Sanger Centre, Wellcome Trust Genome Campus,
               Hinxton, Cambridge CB10 1SA, UK
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4809037)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-OCT-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AL513382.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
287479	289020	+	1542	16758993	STYr001	-
289106	289181	+	76	16758993	STYt001	-	^{04 Glu tRNA}
289375	292380	+	3006	16758993	STYr002	-
292481	292600	+	120	16758993	STYr003	-
292653	292729	+	77	16758993	STYt002	-	^{06 Asp tRNA}
302092	302168	+	77	16758993	STYt003	-	^{06 Asp tRNA}
378099	378174	+	76	16758993	STYt004	-	^{12 Thr tRNA}
517260	517397	+	138	16758993	STYs001	-
517284	517398	+	115	16758993	STYr023	-	4.5S ribosomal RNA
605515	605591	+	77	16758993	STYt005	-	^{11 Arg tRNA}
714107	714181	-	75	16758993	STYt006	-	^{05 Gln tRNA}
714228	714304	-	77	16758993	STYt007	-	^{16 Met tRNA}
714320	714394	-	75	16758993	STYt008	-	^{05 Gln tRNA}
714430	714504	-	75	16758993	STYt009	-	^{05 Gln tRNA}
714528	714612	-	85	16758993	STYt010	-	^{15 Leu tRNA}
714621	714697	-	77	16758993	STYt011	-	^{16 Met tRNA}
793472	793547	+	76	16758993	STYt012	-	^{10 Lys tRNA}
793690	793765	+	76	16758993	STYt013	-	^{10 Lys tRNA}
793900	793975	+	76	16758993	STYt014	-	^{10 Lys tRNA}
937980	938067	-	88	16758993	STYt015	-	^{08 Ser tRNA}
1085068	1085155	+	88	16758993	STYt016	-	^{08 Ser tRNA}
1135018	1135105	-	88	16758993	STYt017	-	^{08 Ser tRNA}
1624920	1624996	+	77	16758993	STYt018	-	^{13 Val tRNA}
1625007	1625083	+	77	16758993	STYt019	-	^{13 Val tRNA}
1768237	1768313	-	77	16758993	STYt020	-	^{11 Arg tRNA}
1780696	1780772	-	77	16758993	STYt021	-	^{11 Arg tRNA}
1999588	1999674	-	87	16758993	STYt022	-	^{15 Leu tRNA}
1999686	1999759	-	74	16758993	STYt023	-	^{19 Cys tRNA}
1999812	1999887	-	76	16758993	STYt024	-	^{01 Gly tRNA}
2032272	2032352	-	81	16758993	STYs002	-
2045762	2045851	-	90	16758993	STYt025	-	^{08 Ser tRNA}
2046838	2046913	+	76	16758993	STYt026	-	^{07 Asn tRNA}
2047461	2047536	+	76	16758993	STYt027	-	^{07 Asn tRNA}
2050893	2050968	-	76	16758993	STYt028	-	^{07 Asn tRNA}
2052726	2052801	+	76	16758993	STYt029	-	^{07 Asn tRNA}
2297141	2297217	+	77	16758993	STYt030	-	^{03 Pro tRNA}
2323599	2323955	+	357	16758993	STYs003	-
2460793	2460867	+	75	16758993	STYt031	-	^{11 Arg tRNA}
2489548	2489623	-	76	16758993	STYt032	-	^{02 Ala tRNA}
2489666	2489741	-	76	16758993	STYt033	-	^{02 Ala tRNA}
2492446	2492521	+	76	16758993	STYt034	-	^{13 Val tRNA}
2492567	2492642	+	76	16758993	STYt035	-	^{13 Val tRNA}
2492684	2492759	+	76	16758993	STYt036	-	^{13 Val tRNA}
2492764	2492839	+	76	16758993	STYt037	-	^{10 Lys tRNA}
2712258	2712377	-	120	16758993	STYr004	-
2712478	2715483	-	3006	16758993	STYr005	-
2715666	2715741	-	76	16758993	STYt038	-	^{02 Ala tRNA}
2715853	2715929	-	77	16758993	STYt039	-	^{14 Ile tRNA}
2715999	2717540	-	1542	16758993	STYr006	-
2759156	2759622	+	467	16758993	STYs004	-
2822822	2822898	-	77	16758993	STYt040	-	^{11 Arg tRNA}
2823095	2823171	-	77	16758993	STYt041	-	^{11 Arg tRNA}
2823234	2823310	-	77	16758993	STYt042	-	^{11 Arg tRNA}
2823373	2823450	-	78	16758993	STYt043	-	^{11 Arg tRNA}
2823454	2823546	-	93	16758993	STYt044	-	^{08 Ser tRNA}
2972232	2972587	-	356	16758993	STYs005	-
2996601	2996677	+	77	16758993	STYt045	-	^{16 Met tRNA}
2996707	2996783	+	77	16758993	STYt046	-	^{16 Met tRNA}
3059944	3060017	-	74	16758993	STYt047	-	^{01 Gly tRNA}
3084623	3084805	+	183	16758993	STYs006	-
3132530	3132605	+	76	16758993	STYt048	-	^{17 Phe tRNA}
3236504	3236579	+	76	16758993	STYt049	-	^{16 Met tRNA}
3271959	3272334	-	376	16758993	STYs007	-
3314314	3314390	-	77	16758993	STYt050	-	^{16 Met tRNA}
3316275	3316361	-	87	16758993	STYt051	-	^{15 Leu tRNA}
3417939	3418058	-	120	16758993	STYr007	-
3418096	3418171	-	76	16758993	STYt052	-	^{12 Thr tRNA}
3418320	3418439	-	120	16758993	STYr008	-
3418540	3421545	-	3006	16758993	STYr009	-
3421739	3421814	-	76	16758993	STYt053	-	^{04 Glu tRNA}
3421900	3423441	-	1542	16758993	STYr010	-
3479632	3479708	-	77	16758993	STYt054	-	^{03 Pro tRNA}
3479751	3479837	-	87	16758993	STYt055	-	^{15 Leu tRNA}
3479858	3479933	-	76	16758993	STYt056	-	^{09 His tRNA}
3479988	3480064	-	77	16758993	STYt057	-	^{11 Arg tRNA}
3552518	3552593	-	76	16758993	STYt058	-	^{20 Trp tRNA}
3552602	3552678	-	77	16758993	STYt059	-	^{06 Asp tRNA}
3552731	3552850	-	120	16758993	STYr011	-
3552951	3555956	-	3006	16758993	STYr012	-
3556150	3556225	-	76	16758993	STYt060	-	^{04 Glu tRNA}
3556311	3557853	-	1543	16758993	STYr013	-
3590722	3590797	-	76	16758993	STYt061	-	^{12 Thr tRNA}
3590804	3590878	-	75	16758993	STYt062	-	^{01 Gly tRNA}
3590995	3591079	-	85	16758993	STYt063	-	^{18 Tyr tRNA}
3591088	3591163	-	76	16758993	STYt064	-	^{12 Thr tRNA}
3594786	3594905	-	120	16758993	STYr014	-
3595006	3598011	-	3006	16758993	STYr015	-
3598194	3598269	-	76	16758993	STYt065	-	^{02 Ala tRNA}
3598381	3598457	-	77	16758993	STYt066	-	^{14 Ile tRNA}
3598527	3600068	-	1542	16758993	STYr016	-
3608162	3608344	+	183	16758993	STYs008	-
3736162	3736271	-	110	16758993	STYs009	-
3743787	3743906	-	120	16758993	STYr017	-
3744007	3747012	-	3006	16758993	STYr018	-
3747195	3747270	-	76	16758993	STYt067	-	^{02 Ala tRNA}
3747382	3747458	-	77	16758993	STYt068	-	^{14 Ile tRNA}
3747528	3749069	-	1542	16758993	STYr019	-
3900463	3900553	-	91	16758993	STYt069	-	^{03 Pro tRNA}
4022738	4022814	+	77	16758993	STYt070	-	^{03 Pro tRNA}
4257492	4259033	+	1542	16758993	STYr020	-
4259119	4259194	+	76	16758993	STYt071	-	^{04 Glu tRNA}
4259388	4262393	+	3006	16758993	STYr021	-
4262494	4262613	+	120	16758993	STYr022	-
4409511	4409574	-	64	16758993	STYt072	-	^{17 Phe tRNA}
4543073	4543148	-	76	16758993	STYt073	-	^{17 Phe tRNA}
4573001	4573076	+	76	16758993	STYt074	-	^{01 Gly tRNA}
4573233	4573308	+	76	16758993	STYt075	-	^{01 Gly tRNA}
4683605	4683689	+	85	16758993	STYt076	-	^{15 Leu tRNA}
4767194	4767280	-	87	16758993	STYt077	-	^{15 Leu tRNA}
4767312	4767398	-	87	16758993	STYt078	-	^{15 Leu tRNA}
4767426	4767512	-	87	16758993	STYt079	-	^{15 Leu tRNA}