Геном прокариот/Материалы:NC 004567

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 004567»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_004567            3308274 bp    DNA     circular BCT 21-JUN-2007
   DEFINITION  Lactobacillus plantarum WCFS1, complete genome.
   ACCESSION   NC_004567
   VERSION     NC_004567.1  GI:28376974
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Lactobacillus plantarum WCFS1
     ORGANISM  Lactobacillus plantarum WCFS1
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Lactobacillaceae;
               Lactobacillus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3308274)
     AUTHORS   Kleerebezem,M., Boekhorst,J., van Kranenburg,R., Molenaar,D.,
               Kuipers,O.P., Leer,R., Tarchini,R., Peters,S.A., Sandbrink,H.M.,
               Fiers,M.W., Stiekema,W., Lankhorst,R.M., Bron,P.A., Hoffer,S.M.,
               Groot,M.N., Kerkhoven,R., de Vries,M., Ursing,B., de Vos,W.M. and
               Siezen,R.J.
     TITLE     Complete genome sequence of Lactobacillus plantarum WCFS1
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (4), 1990-1995 (2004)
      PUBMED   12566566
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3308274)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3308274)
     CONSRTM   NCBI Microbial Genomes Annotation Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-JUN-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AL935263.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
37371 37446 - 76 28376974 lp_tRNA01 - 10 Lys tRNA
502863 504433 + 1571 28376974 lp_rRNA01 - 16S ribosomal RNA
504518 504592 + 75 28376974 lp_tRNA02 - 14 Ile tRNA
504634 504706 + 73 28376974 lp_tRNA03 - 02 Ala tRNA
504868 507787 + 2920 28376974 lp_rRNA02 - 23S ribosomal RNA
507858 507976 + 119 28376974 lp_rRNA03 - 5S ribosomal RNA
507981 508053 + 73 28376974 lp_tRNA04 - 07 Asn tRNA
508099 508171 + 73 28376974 lp_tRNA05 - 12 Thr tRNA
511258 511340 + 83 28376974 lp_tRNA06 - 18 Tyr tRNA
511350 511421 + 72 28376974 lp_tRNA07 - 05 Gln tRNA
531682 531769 + 88 28376974 lp_tRNA08 - 15 Leu tRNA
591410 591480 - 71 28376974 lp_tRNA09 - 01 Gly tRNA
593365 593450 - 86 28376974 lp_tRNA10 - 14 Ile tRNA
606324 606396 + 73 28376974 lp_tRNA11 - 07 Asn tRNA
722170 722244 - 75 28376974 lp_tRNA12 - 11 Arg tRNA
774992 775063 + 72 28376974 lp_tRNA13 - 07 Asn tRNA
934819 934900 + 82 28376974 lp_tRNA14 - 15 Leu tRNA
934904 934976 + 73 28376974 lp_tRNA15 - 12 Thr tRNA
935001 935072 + 72 28376974 lp_tRNA16 - 01 Gly tRNA
935081 935166 + 86 28376974 lp_tRNA17 - 15 Leu tRNA
935177 935250 + 74 28376974 lp_tRNA18 - 11 Arg tRNA
935258 935331 + 74 28376974 lp_tRNA19 - 03 Pro tRNA
935382 935455 + 74 28376974 lp_tRNA20 - 03 Pro tRNA
1061664 1061736 + 73 28376974 lp_tRNA21 - 11 Arg tRNA
1169165 1170735 + 1571 28376974 lp_rRNA04 - 16S ribosomal RNA
1170820 1170894 + 75 28376974 lp_tRNA22 - 14 Ile tRNA
1170936 1171008 + 73 28376974 lp_tRNA23 - 02 Ala tRNA
1171170 1174089 + 2920 28376974 lp_rRNA05 - 23S ribosomal RNA
1174160 1174278 + 119 28376974 lp_rRNA06 - 5S ribosomal RNA
1174283 1174355 + 73 28376974 lp_tRNA24 - 07 Asn tRNA
1174374 1174463 + 90 28376974 lp_tRNA25 - 08 Ser tRNA
1174485 1174557 + 73 28376974 lp_tRNA26 - 04 Glu tRNA
1174562 1174634 + 73 28376974 lp_tRNA27 - 13 Val tRNA
1174690 1174762 + 73 28376974 lp_tRNA28 - 17 Phe tRNA
1174768 1174850 + 83 28376974 lp_tRNA29 - 18 Tyr tRNA
1174859 1174932 + 74 28376974 lp_tRNA30 - 20 Trp tRNA
1174938 1175010 + 73 28376974 lp_tRNA31 - 09 His tRNA
1175018 1175089 + 72 28376974 lp_tRNA32 - 05 Gln tRNA
1175112 1175182 + 71 28376974 lp_tRNA33 - 19 Cys tRNA
1175238 1175325 + 88 28376974 lp_tRNA34 - 15 Leu tRNA
1252319 1252391 - 73 28376974 lp_tRNA35 - 09 His tRNA
1252780 1252863 - 84 28376974 lp_tRNA36 - 15 Leu tRNA
1271644 1271714 + 71 28376974 lp_tRNA37 - 01 Gly tRNA
1271771 1271848 + 78 28376974 lp_tRNA38 - 06 Asp tRNA
1448543 1448616 - 74 28376974 lp_tRNA39 - 11 Arg tRNA
1876412 1876499 + 88 28376974 lp_tRNA40 - 08 Ser tRNA
2013685 2013762 - 78 28376974 lp_tRNA41 - 06 Asp tRNA
2013765 2013838 - 74 28376974 lp_tRNA42 - 16 Met tRNA
2013848 2013920 - 73 28376974 lp_tRNA43 - 04 Glu tRNA
2013940 2014027 - 88 28376974 lp_tRNA44 - 08 Ser tRNA
2014032 2014106 - 75 28376974 lp_tRNA45 - 14 Ile tRNA
2014113 2014183 - 71 28376974 lp_tRNA46 - 01 Gly tRNA
2014196 2014268 - 73 28376974 lp_tRNA47 - 17 Phe tRNA
2014298 2014372 - 75 28376974 lp_tRNA48 - 06 Asp tRNA
2014376 2014449 - 74 28376974 lp_tRNA49 - 16 Met tRNA
2014456 2014545 - 90 28376974 lp_tRNA50 - 08 Ser tRNA
2014585 2014658 - 74 28376974 lp_tRNA51 - 16 Met tRNA
2014674 2014747 - 74 28376974 lp_tRNA52 - 16 Met tRNA
2014779 2014852 - 74 28376974 lp_tRNA53 - 03 Pro tRNA
2014858 2014931 - 74 28376974 lp_tRNA54 - 11 Arg tRNA
2014942 2015027 - 86 28376974 lp_tRNA55 - 15 Leu tRNA
2015043 2015114 - 72 28376974 lp_tRNA56 - 01 Gly tRNA
2015131 2015203 - 73 28376974 lp_tRNA57 - 12 Thr tRNA
2015298 2015370 - 73 28376974 lp_tRNA58 - 10 Lys tRNA
2015372 2015447 - 76 28376974 lp_tRNA59 - 13 Val tRNA
2015452 2015570 - 119 28376974 lp_rRNA16 - 5S ribosomal RNA
2015625 2015697 - 73 28376974 lp_tRNA60 - 10 Lys tRNA
2015699 2015774 - 76 28376974 lp_tRNA61 - 13 Val tRNA
2015779 2015897 - 119 28376974 lp_rRNA07 - 5S ribosomal RNA
2015968 2018887 - 2920 28376974 lp_rRNA08 - 23S ribosomal RNA
2019093 2020663 - 1571 28376974 lp_rRNA09 - 16S ribosomal RNA
2186916 2186987 - 72 28376974 lp_tRNA62 - 20 Trp tRNA
2187057 2187129 - 73 28376974 lp_tRNA63 - 07 Asn tRNA
2199001 2199086 + 86 28376974 lp_tRNA64 - 14 Ile tRNA
2199699 2199772 + 74 28376974 lp_tRNA65 - 16 Met tRNA
2199778 2199848 + 71 28376974 lp_tRNA66 - 01 Gly tRNA
2204049 2204121 - 73 28376974 lp_tRNA67 - 04 Glu tRNA
2204512 2204584 + 73 28376974 lp_tRNA68 - 05 Gln tRNA
2498504 2498576 - 73 28376974 lp_tRNA69 - 12 Thr tRNA
2498679 2498797 - 119 28376974 lp_rRNA10 - 5S ribosomal RNA
2498868 2501787 - 2920 28376974 lp_rRNA11 - 23S ribosomal RNA
2501993 2503563 - 1571 28376974 lp_rRNA12 - 16S ribosomal RNA
2941615 2941733 - 119 28376974 lp_rRNA13 - 5S ribosomal RNA
2941804 2944723 - 2920 28376974 lp_rRNA14 - 23S ribosomal RNA
2944929 2946499 - 1571 28376974 lp_rRNA15 - 16S ribosomal RNA
3039279 3039351 + 73 28376974 lp_tRNA70 - 02 Ala tRNA