Материалы:NC 004605

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_004605            1877212 bp    DNA     circular BCT 17-JAN-2006
   DEFINITION  Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome II, complete
               sequence.
   ACCESSION   NC_004605
   VERSION     NC_004605.1  GI:28899855
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
     ORGANISM  Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales;
               Vibrionaceae; Vibrio.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Makino,K., Oshima,K., Kurokawa,K., Yokoyama,K., Uda,T.,
               Tagomori,K., Iijima,Y., Najima,M., Nakano,M., Yamashita,A.,
               Kubota,Y., Kimura,S., Yasunaga,T., Honda,T., Shinagawa,H.,
               Hattori,M. and Iida,T.
     TITLE     Genome sequence of Vibrio parahaemolyticus: a pathogenic mechanism
               distinct from that of V cholerae
     JOURNAL   Lancet 361 (9359), 743-749 (2003)
      PUBMED   12620739
   REFERENCE   2
     AUTHORS   Nasu,H., Iida,T., Sugahara,T., Yamaichi,Y., Park,K.S., Yokoyama,K.,
               Makino,K., Shinagawa,H. and Honda,T.
     TITLE     A filamentous phage associated with recent pandemic Vibrio
               parahaemolyticus O3:K6 strains
     JOURNAL   J. Clin. Microbiol. 38 (6), 2156-2161 (2000)
      PUBMED   10834969
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1877212)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-MAR-2003) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   4  (bases 1 to 1877212)
     AUTHORS   Oshima,K., Kurokawa,K., Makino,K., Yokoyama,K., Yasunaga,T.,
               Honda,T., Shinagawa,H., Hattori,M. and Iida,T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (09-APR-2002) Ken Kurokawa, Osaka University, Genome
               Information Research Center; 3-1, Yamadaoka, Suita, Osaka 565-0871,
               Japan (E-mail:ken@gen-info.osaka-u.ac.jp,
               URL:http://www.gen-info.osaka-u.ac.jp/, Tel:81-6-6879-8365,
               Fax:81-6-6879-2047)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BA000032.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
132915	134385	+	1471	28899855	VPAr01	-	16S ribosomal RNA
134557	134632	+	76	28899855	VPAt01	-	^{04 Glu tRNA}
134635	134710	+	76	28899855	VPAt02	-	^{10 Lys tRNA}
134725	134800	+	76	28899855	VPAt03	-	^{02 Ala tRNA}
134814	134889	+	76	28899855	VPAt04	-	^{13 Val tRNA}
135166	138056	+	2891	28899855	VPAr02	-	23S ribosomal RNA
138146	138265	+	120	28899855	VPAr03	-	5S ribosomal RNA
138333	138423	+	91	28899855	VPAt05	-	^{08 Ser tRNA}
192979	193062	-	84	28899855	VPAt06	-	^{15 Leu tRNA}
605006	605096	-	91	28899855	VPAt07	-	^{08 Ser tRNA}
1040086	1040159	-	74	28899855	VPAt08	-	^{19 Cys tRNA}
1040232	1040318	-	87	28899855	VPAt09	-	^{15 Leu tRNA}
1052570	1052643	-	74	28899855	VPAt10	-	^{19 Cys tRNA}
1052717	1052803	-	87	28899855	VPAt11	-	^{15 Leu tRNA}
1060973	1061048	-	76	28899855	VPAt12	-	^{01 Gly tRNA}
1061052	1061125	-	74	28899855	VPAt13	-	^{19 Cys tRNA}
1156216	1156290	+	75	28899855	VPAt14	-	^{01 Gly tRNA}