Геном прокариот/Материалы:NC 004842

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 004842»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_004842            1197687 bp    DNA     circular BCT 09-AUG-2007
   DEFINITION  Anaplasma marginale str. St. Maries, complete genome.
   ACCESSION   NC_004842
   VERSION     NC_004842.2  GI:56416370
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Anaplasma marginale str. St. Maries
     ORGANISM  Anaplasma marginale str. St. Maries
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rickettsiales;
               Anaplasmataceae; Anaplasma.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1197687)
     AUTHORS   Brayton,K.A., Kappmeyer,L.S., Herndon,D.R., Dark,M.J.,
               Tibbals,D.L., Palmer,G.H., McGuire,T.C. and Knowles,D.P. Jr.
     TITLE     Complete genome sequencing of Anaplasma marginale reveals that the
               surface is skewed to two superfamilies of outer membrane proteins
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (3), 844-849 (2005)
      PUBMED   15618402
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1197687)
     AUTHORS   Brayton,K.A., Kappmeyer,L.S., Herndon,D.R., Dark,M.J.,
               Tibbals,D.L., Palmer,G.H., McGuire,T.C. and Knowles,D.P. Jr.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (12-OCT-2004) Veterinary Microbiology and Pathology,
               Washington State University, College of Veterinary Medicine,
               Pullman, WA 99164-7040, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1197687)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (17-JUN-2003) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000030.
               On Dec 8, 2004 this sequence version replaced gi:31871288.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
4916 4993 + 78 56416370 tRNA-Pro-1 - 03 Pro tRNA
6822 6908 + 87 56416370 tRNA-Ser-1 - 08 Ser tRNA
30979 31051 + 73 56416370 tRNA-His-1 - 09 His tRNA
61301 61373 - 73 56416370 tRNA-Ala-1 - 02 Ala tRNA
81179 83945 + 2767 56416370 AMr1 - 23S ribosomal RNA
84031 84151 + 121 56416370 AMr2 - 5S ribosomal RNA
153914 153989 - 76 56416370 tRNA-Val-1 - 13 Val tRNA
212711 212784 - 74 56416370 tRNA-Trp-1 - 20 Trp tRNA
229502 229575 - 74 56416370 tRNA-Arg-1 - 11 Arg tRNA
247468 248989 + 1522 56416370 AMr3 - 16S ribosomal RNA
256088 256173 - 86 56416370 tRNA-Leu-1 - 15 Leu tRNA
259474 259543 - 70 56416370 tRNA-Lys-1 - 10 Lys tRNA
259675 259757 - 83 56416370 tRNA-Leu-2 - 15 Leu tRNA
265796 265868 - 73 56416370 tRNA-Met-1 - 16 Met tRNA
339807 339878 - 72 56416370 tRNA-Gly-1 - 01 Gly tRNA
339934 340005 - 72 56416370 tRNA-Gly-2 - 01 Gly tRNA
388354 388427 - 74 56416370 tRNA-Asp-1 - 06 Asp tRNA
459905 459976 - 72 56416370 tRNA-Asn-1 - 07 Asn tRNA
463417 463487 - 71 56416370 tRNA-Phe-1 - 17 Phe tRNA
473076 473149 - 74 56416370 tRNA-Arg-2 - 11 Arg tRNA
516769 516860 - 92 56416370 tRNA-Ser-2 - 08 Ser tRNA
518359 518432 - 74 56416370 tRNA-Thr-1 - 12 Thr tRNA
537017 537091 - 75 56416370 tRNA-Met-2 - 16 Met tRNA
542494 542569 - 76 56416370 tRNA-Ile-1 - 14 Ile tRNA
605594 605676 - 83 56416370 tRNA-Leu-3 - 15 Leu tRNA
607462 607535 - 74 56416370 tRNA-Pro-2 - 03 Pro tRNA
705062 705135 - 74 56416370 tRNA-Thr-2 - 12 Thr tRNA
754892 754966 - 75 56416370 tRNA-Arg-3 - 11 Arg tRNA
794916 794988 - 73 56416370 tRNA-Glu-1 - 04 Glu tRNA
833419 833489 - 71 56416370 tRNA-Gly-3 - 01 Gly tRNA
833498 833580 - 83 56416370 tRNA-Tyr-1 - 18 Tyr tRNA
1009196 1009280 - 85 56416370 tRNA-Ser-3 - 08 Ser tRNA
1017048 1017120 - 73 56416370 tRNA-Val-2 - 13 Val tRNA
1067571 1067642 - 72 56416370 tRNA-Cys-1 - 19 Cys tRNA
1073752 1073823 - 72 56416370 tRNA-Lys-2 - 10 Lys tRNA
1137941 1138018 - 78 56416370 tRNA-Arg-4 - 11 Arg tRNA
1139858 1139929 - 72 56416370 tRNA-Gln-1 - 05 Gln tRNA
1162563 1162651 - 89 56416370 tRNA-Leu-4 - 15 Leu tRNA
1183118 1183194 - 77 56416370 tRNA-Met-3 - 16 Met tRNA
1192658 1192741 - 84 56416370 tRNA-Leu-5 - 15 Leu tRNA