Материалы:NC 005139

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_005139            3354505 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2006
   DEFINITION  Vibrio vulnificus YJ016 chromosome I, complete sequence.
   ACCESSION   NC_005139
   VERSION     NC_005139.1  GI:37678184
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Vibrio vulnificus YJ016
     ORGANISM  Vibrio vulnificus YJ016
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Vibrionales;
               Vibrionaceae; Vibrio.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3354505)
     AUTHORS   Chen,C.Y., Wu,K.M., Chang,Y.C., Chang,C.H., Tsai,H.C., Liao,T.L.,
               Liu,Y.M., Chen,H.J., Shen,A.B., Li,J.C., Su,T.L., Shao,C.P.,
               Lee,C.T., Hor,L.I. and Tsai,S.F.
     TITLE     Comparative genome analysis of Vibrio vulnificus, a marine pathogen
     JOURNAL   Genome Res. 13 (12), 2577-2587 (2003)
      PUBMED   14656965
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3354505)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3354505)
     CONSRTM   NCBI Microbial Genomes Annotation Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (29-MAY-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BA000037.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
32728	34262	+	1535	37678184	VVr001	-	16S ribosomal RNA
34326	34402	+	77	37678184	VVt001	-	^{14 Ile tRNA}
34413	34488	+	76	37678184	VVt002	-	^{02 Ala tRNA}
34770	37657	+	2888	37678184	VVr002	-	23S ribosomal RNA
37812	37929	+	118	37678184	VVr003	-	5S ribosomal RNA
38032	38122	+	91	37678184	VVt003	-	^{08 Ser tRNA}
49176	49252	+	77	37678184	VVt004	-	^{11 Arg tRNA}
49291	49366	+	76	37678184	VVt005	-	^{09 His tRNA}
49393	49469	+	77	37678184	VVt006	-	^{03 Pro tRNA}
49544	49619	+	76	37678184	VVt007	-	^{09 His tRNA}
49644	49720	+	77	37678184	VVt008	-	^{03 Pro tRNA}
177895	179429	+	1535	37678184	VVr004	-	16S ribosomal RNA
179498	179573	+	76	37678184	VVt009	-	^{04 Glu tRNA}
179575	179650	+	76	37678184	VVt010	-	^{10 Lys tRNA}
179665	179740	+	76	37678184	VVt011	-	^{02 Ala tRNA}
179755	179830	+	76	37678184	VVt012	-	^{13 Val tRNA}
180171	183058	+	2888	37678184	VVr005	-	23S ribosomal RNA
183180	183297	+	118	37678184	VVr006	-	5S ribosomal RNA
183328	183404	+	77	37678184	VVt013	-	^{06 Asp tRNA}
542304	542379	-	76	37678184	VVt014	-	^{16 Met tRNA}
589305	589747	+	443	37678184	VVs001	-	RNA subunit of RNase P
717240	718774	+	1535	37678184	VVr007	-	16S ribosomal RNA
718843	718918	+	76	37678184	VVt015	-	^{04 Glu tRNA}
718920	718995	+	76	37678184	VVt016	-	^{10 Lys tRNA}
719024	719099	+	76	37678184	VVt017	-	^{13 Val tRNA}
719439	722326	+	2888	37678184	VVr008	-	23S ribosomal RNA
722447	722564	+	118	37678184	VVr009	-	5S ribosomal RNA
722596	722672	+	77	37678184	VVt018	-	^{06 Asp tRNA}
722742	722818	+	77	37678184	VVt019	-	^{20 Trp tRNA}
823056	823422	-	367	37678184	VVs002	-	tmRNA
923519	923603	-	85	37678184	VVt020	-	^{15 Leu tRNA}
923648	923722	-	75	37678184	VVt021	-	^{05 Gln tRNA}
923779	923863	-	85	37678184	VVt022	-	^{15 Leu tRNA}
923909	923983	-	75	37678184	VVt023	-	^{05 Gln tRNA}
924039	924123	-	85	37678184	VVt024	-	^{15 Leu tRNA}
924168	924242	-	75	37678184	VVt025	-	^{05 Gln tRNA}
924297	924381	-	85	37678184	VVt026	-	^{15 Leu tRNA}
924426	924502	-	77	37678184	VVt027	-	^{16 Met tRNA}
924514	924598	-	85	37678184	VVt028	-	^{15 Leu tRNA}
924644	924718	-	75	37678184	VVt029	-	^{05 Gln tRNA}
924776	924860	-	85	37678184	VVt030	-	^{15 Leu tRNA}
924903	924979	-	77	37678184	VVt031	-	^{16 Met tRNA}
925057	925131	-	75	37678184	VVt032	-	^{05 Gln tRNA}
925142	925226	-	85	37678184	VVt033	-	^{15 Leu tRNA}
925265	925341	-	77	37678184	VVt034	-	^{16 Met tRNA}
940448	940524	+	77	37678184	VVt035	-	^{03 Pro tRNA}
952546	952622	-	77	37678184	VVt036	-	^{11 Arg tRNA}
1067577	1067653	-	77	37678184	VVt037	-	^{03 Pro tRNA}
1135031	1135115	-	85	37678184	VVt038	-	^{18 Tyr tRNA}
1150964	1151074	+	111	37678184	VVs003	-	signal recognition particle RNA
1179024	1179114	-	91	37678184	VVt039	-	^{08 Ser tRNA}
1208714	1208789	-	76	37678184	VVt040	-	^{07 Asn tRNA}
1249797	1249870	+	74	37678184	VVt041	-	^{19 Cys tRNA}
1249874	1249949	+	76	37678184	VVt042	-	^{01 Gly tRNA}
1250010	1250096	+	87	37678184	VVt043	-	^{15 Leu tRNA}
1250122	1250197	+	76	37678184	VVt044	-	^{01 Gly tRNA}
1535714	1535790	+	77	37678184	VVt045	-	^{13 Val tRNA}
1535826	1535902	+	77	37678184	VVt046	-	^{13 Val tRNA}
2281999	2282086	-	88	37678184	VVt047	-	^{08 Ser tRNA}
2426246	2426322	-	77	37678184	VVt048	-	^{11 Arg tRNA}
2751165	2751241	-	77	37678184	VVt049	-	^{16 Met tRNA}
2751299	2751382	-	84	37678184	VVt050	-	^{15 Leu tRNA}
2857088	2857164	-	77	37678184	VVt051	-	^{11 Arg tRNA}
2857207	2857283	-	77	37678184	VVt052	-	^{11 Arg tRNA}
2857373	2857449	-	77	37678184	VVt053	-	^{11 Arg tRNA}
2857494	2857570	-	77	37678184	VVt054	-	^{11 Arg tRNA}
2857661	2857737	-	77	37678184	VVt055	-	^{11 Arg tRNA}
2857822	2857913	-	92	37678184	VVt056	-	^{08 Ser tRNA}
2857937	2858013	-	77	37678184	VVt057	-	^{11 Arg tRNA}
2858043	2858134	-	92	37678184	VVt058	-	^{08 Ser tRNA}
2938124	2938199	+	76	37678184	VVt059	-	^{17 Phe tRNA}
2938254	2938329	+	76	37678184	VVt060	-	^{12 Thr tRNA}
2938344	2938419	+	76	37678184	VVt061	-	^{07 Asn tRNA}
2940513	2940588	+	76	37678184	VVt062	-	^{17 Phe tRNA}
2940647	2940722	+	76	37678184	VVt063	-	^{12 Thr tRNA}
2940730	2940805	+	76	37678184	VVt064	-	^{17 Phe tRNA}
2940845	2940920	+	76	37678184	VVt065	-	^{07 Asn tRNA}
2940956	2941031	+	76	37678184	VVt066	-	^{12 Thr tRNA}
2941072	2941147	+	76	37678184	VVt067	-	^{07 Asn tRNA}
2942997	2943073	-	77	37678184	VVt068	-	^{06 Asp tRNA}
2943137	2943254	-	118	37678184	VVr010	-	5S ribosomal RNA
2943261	2943336	-	76	37678184	VVt069	-	^{12 Thr tRNA}
2943386	2943503	-	118	37678184	VVr011	-	5S ribosomal RNA
2943624	2946511	-	2888	37678184	VVr012	-	23S ribosomal RNA
2946788	2946863	-	76	37678184	VVt070	-	^{04 Glu tRNA}
2946932	2948466	-	1535	37678184	VVr013	-	16S ribosomal RNA
2948802	2948919	-	118	37678184	VVr014	-	5S ribosomal RNA
2949041	2951928	-	2888	37678184	VVr015	-	23S ribosomal RNA
2952269	2952344	-	76	37678184	VVt071	-	^{13 Val tRNA}
2952359	2952434	-	76	37678184	VVt072	-	^{02 Ala tRNA}
2952449	2952524	-	76	37678184	VVt073	-	^{10 Lys tRNA}
2952526	2952601	-	76	37678184	VVt074	-	^{04 Glu tRNA}
2952670	2954200	-	1531	37678184	VVr016	-	16S ribosomal RNA
2963615	2963699	-	85	37678184	VVt075	-	^{15 Leu tRNA}
3037536	3037612	-	77	37678184	VVt076	-	^{20 Trp tRNA}
3037666	3037742	-	77	37678184	VVt077	-	^{06 Asp tRNA}
3037774	3037891	-	118	37678184	VVr017	-	5S ribosomal RNA
3038013	3040900	-	2888	37678184	VVr018	-	23S ribosomal RNA
3041180	3041255	-	76	37678184	VVt078	-	^{02 Ala tRNA}
3041266	3041342	-	77	37678184	VVt079	-	^{14 Ile tRNA}
3041406	3042940	-	1535	37678184	VVr019	-	16S ribosomal RNA
3160255	3160331	-	77	37678184	VVt080	-	^{16 Met tRNA}
3160374	3160450	-	77	37678184	VVt081	-	^{16 Met tRNA}
3160492	3160568	-	77	37678184	VVt082	-	^{16 Met tRNA}
3160611	3160687	-	77	37678184	VVt083	-	^{16 Met tRNA}
3160741	3160816	-	76	37678184	VVt084	-	^{01 Gly tRNA}
3160851	3160927	-	77	37678184	VVt085	-	^{16 Met tRNA}
3160982	3161057	-	76	37678184	VVt086	-	^{01 Gly tRNA}
3161154	3161229	-	76	37678184	VVt087	-	^{01 Gly tRNA}
3161325	3161400	-	76	37678184	VVt088	-	^{01 Gly tRNA}
3161434	3161509	-	76	37678184	VVt089	-	^{01 Gly tRNA}
3161620	3161695	-	76	37678184	VVt090	-	^{01 Gly tRNA}
3251167	3251242	-	76	37678184	VVt091	-	^{12 Thr tRNA}
3251257	3251331	-	75	37678184	VVt092	-	^{01 Gly tRNA}
3251367	3251451	-	85	37678184	VVt093	-	^{18 Tyr tRNA}
3251499	3251574	-	76	37678184	VVt094	-	^{12 Thr tRNA}
3257793	3257869	-	77	37678184	VVt095	-	^{06 Asp tRNA}
3257901	3258018	-	118	37678184	VVr020	-	5S ribosomal RNA
3258139	3261026	-	2888	37678184	VVr021	-	23S ribosomal RNA
3261303	3261378	-	76	37678184	VVt096	-	^{13 Val tRNA}
3261407	3261482	-	76	37678184	VVt097	-	^{10 Lys tRNA}
3261484	3261559	-	76	37678184	VVt098	-	^{04 Glu tRNA}
3261628	3263162	-	1535	37678184	VVr022	-	16S ribosomal RNA
3299776	3299852	-	77	37678184	VVt099	-	^{06 Asp tRNA}
3299884	3300001	-	118	37678184	VVr023	-	5S ribosomal RNA
3300125	3303012	-	2888	37678184	VVr024	-	23S ribosomal RNA
3303289	3303364	-	76	37678184	VVt100	-	^{04 Glu tRNA}
3303433	3304967	-	1535	37678184	VVr025	-	16S ribosomal RNA