Геном прокариот/Материалы:NC 007295

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 007295»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_007295             897405 bp    DNA     circular BCT 03-DEC-2005
   DEFINITION  Mycoplasma hyopneumoniae J, complete genome.
   ACCESSION   NC_007295
   VERSION     NC_007295.1  GI:71893359
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Mycoplasma hyopneumoniae J
     ORGANISM  Mycoplasma hyopneumoniae J
               Bacteria; Firmicutes; Mollicutes; Mycoplasmataceae; Mycoplasma.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 897405)
     AUTHORS   Vasconcelos,A.T., Ferreira,H.B., Bizarro,C.V., Bonatto,S.L.,
               Carvalho,M.O., Pinto,P.M., Almeida,D.F., Almeida,L.G., Almeida,R.,
               Alves-Filho,L., Assuncao,E.N., Azevedo,V.A., Bogo,M.R.,
               Brigido,M.M., Brocchi,M., Burity,H.A., Camargo,A.A., Camargo,S.S.,
               Carepo,M.S., Carraro,D.M., de Mattos Cascardo,J.C., Castro,L.A.,
               Cavalcanti,G., Chemale,G., Collevatti,R.G., Cunha,C.W.,
               Dallagiovanna,B., Dambros,B.P., Dellagostin,O.A., Falcao,C.,
               Fantinatti-Garboggini,F., Felipe,M.S., Fiorentin,L., Franco,G.R.,
               Freitas,N.S., Frias,D., Grangeiro,T.B., Grisard,E.C.,
               Guimaraes,C.T., Hungria,M., Jardim,S.N., Krieger,M.A.,
               Laurino,J.P., Lima,L.F., Lopes,M.I., Loreto,E.L., Madeira,H.M.,
               Manfio,G.P., Maranhao,A.Q., Martinkovics,C.T., Medeiros,S.R.,
               Moreira,M.A., Neiva,M., Ramalho-Neto,C.E., Nicolas,M.F.,
               Oliveira,S.C., Paixao,R.F., Pedrosa,F.O., Pena,S.D., Pereira,M.,
               Pereira-Ferrari,L., Piffer,I., Pinto,L.S., Potrich,D.P.,
               Salim,A.C., Santos,F.R., Schmitt,R., Schneider,M.P., Schrank,A.,
               Schrank,I.S., Schuck,A.F., Seuanez,H.N., Silva,D.W., Silva,R.,
               Silva,S.C., Soares,C.M., Souza,K.R., Souza,R.C., Staats,C.C.,
               Steffens,M.B., Teixeira,S.M., Urmenyi,T.P., Vainstein,M.H.,
               Zuccherato,L.W., Simpson,A.J. and Zaha,A.
     TITLE     Swine and Poultry Pathogens: the Complete Genome Sequences of Two
               Strains of Mycoplasma hyopneumoniae and a Strain of Mycoplasma
               synoviae
     JOURNAL   J. Bacteriol. 187 (16), 5568-5577 (2005)
      PUBMED   16077101
   REFERENCE   2  (bases 1 to 897405)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-AUG-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 897405)
     AUTHORS   Vasconcelos,A.T.R., Ferreira,H.B., Bizarro,C.V., Bonatto,S.L.,
               Carvalho,M.O., Pinto,P.M., de Almeida,D.F., de Almeida,L.G.P., de
               Almeida,R., Junior,L.A., de Assuncao,E.N., de Carvalho,V.A.,
               Bogo,M., Brigido,M.M., Brocchi,M., Burity,H.A., Camargo,A.A.,
               Camargo,S.S., Carepo,M.S., Carraro,D.M., Matos Cascardo,J.C., de
               Castro,L.A., Cavalcanti,G., Chemale,G., Collevantti,R.G., da
               Cunha,C.W., Dallagiovanna,B., Dambros,B.P., Dellagostin,O.A.,
               Falcao,C., Fantinatti-Garboggini,F., Felipe,M.S.S., Fiorentin,L.,
               Franco,G.R., de Freitas,N.S.A., Frias,D., Grangeiro,T.B.,
               Grisard,E.C., Guimaraes,C.T., Hungria,M., Jardim,S.N.,
               Krieger,M.A., Laurino,J.P., Lima,L.F.A., Lopes,M.I., Loreto,E.L.S.,
               Madeira,H.M.F., Manfio,G.P., Maranhao,A.Q., Martinkovics,C.T., de
               Medeiros,S.R.B., Moreira,M.A.M., Neiva,M., Ramalho-Neto,C.E.,
               Nicolas,M.F., Oliveira,S.C., Paixao,R.F.C., Pedrosa,F.O.,
               Pena,S.D.J., Pereira,M., Pereira-Ferrari,L., Piffer,I., Pinto,L.S.,
               Potrich,D.P., Salim,A.C.M., Santos,F.R., Schmitt,R.,
               Schneider,M.P.C., Schrank,A., Schrank,I.S., Schuck,A.F.,
               Silva,D.W., Silva,R., da Silva,S.C., Soares,C.M.A., de
               Souza,K.R.L., Souza,R.C., Staats,C.C., Steffens,M.B.R.,
               Teixeira,S.M.R., Urmenyi,T.P., Vainstein,M.H., Zuccherato,L.W.,
               Simpson,A.J.G. and Zaha,A.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-SEP-2004) Labinfo, LNCC - Laboratorio Nacional de
               Computacao Cientifica, Rua Getulio Vargas 333, Petropolis, RJ
               25651070, Brazil
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE017243.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
103911 103986 - 76 71893359 MHJ_0677 - 17 Phe tRNA
103988 104063 - 76 71893359 MHJ_0678 - 06 Asp tRNA
104066 104140 - 75 71893359 MHJ_0679 - 16 Met tRNA
104192 104282 - 91 71893359 MHJ_0680 - 08 Ser tRNA
104287 104362 - 76 71893359 MHJ_0681 - 16 Met tRNA
104418 104494 - 77 71893359 MHJ_0682 - 16 Met tRNA
104499 104575 - 77 71893359 MHJ_0683 - 02 Ala tRNA
104582 104658 - 77 71893359 MHJ_0684 - 03 Pro tRNA
104740 104816 - 77 71893359 MHJ_0685 - 11 Arg tRNA
119748 119821 + 74 71893359 MHJ_0686 - 20 Trp tRNA
147056 147131 - 76 71893359 MHJ_0687 - 10 Lys tRNA
147135 147220 - 86 71893359 MHJ_0688 - 15 Leu tRNA
153303 153378 - 76 71893359 MHJ_0689 - 09 His tRNA
170425 170508 - 84 71893359 MHJ_0690 - 15 Leu tRNA
178384 178458 - 75 71893359 MHJ_0691 - 20 Trp tRNA
321929 322003 + 75 71893359 MHJ_0692 - 07 Asn tRNA
322007 322082 + 76 71893359 MHJ_0693 - 04 Glu tRNA
322090 322165 + 76 71893359 MHJ_0694 - 13 Val tRNA
322170 322246 + 77 71893359 MHJ_0695 - 12 Thr tRNA
322282 322365 + 84 71893359 MHJ_0696 - 15 Leu tRNA
416629 416705 - 77 71893359 MHJ_0697 - 11 Arg tRNA
416715 416789 - 75 71893359 MHJ_0698 - 19 Cys tRNA
471023 471097 - 75 71893359 MHJ_0699 - 05 Gln tRNA
471102 471185 - 84 71893359 MHJ_0700 - 18 Tyr tRNA
565222 565297 - 76 71893359 MHJ_0701 - 12 Thr tRNA
579923 580007 - 85 71893359 MHJ_0702 - 15 Leu tRNA
580013 580105 - 93 71893359 MHJ_0703 - 08 Ser tRNA
783228 783415 + 188 71893359 MHJ_0704 - 5S ribosomal RNA
792299 792372 + 74 71893359 MHJ_0705 - 01 Gly tRNA
837781 837871 + 91 71893359 MHJ_0706 - 08 Ser tRNA
852944 853020 - 77 71893359 MHJ_0707 - 14 Ile tRNA
877699 880600 - 2902 71893359 MHJ_0708 - 23S ribosomal RNA
881092 882628 - 1537 71893359 MHJ_0709 - 16S ribosomal RNA