Геном прокариот/Материалы:NC 007432

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 007432»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_007432            2127839 bp    DNA     circular BCT 30-MAR-2006
   DEFINITION  Streptococcus agalactiae A909, complete genome.
   ACCESSION   NC_007432
   VERSION     NC_007432.1  GI:76786714
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Streptococcus agalactiae A909
     ORGANISM  Streptococcus agalactiae A909
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Streptococcaceae;
               Streptococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2127839)
     AUTHORS   Tettelin,H., Masignani,V., Cieslewicz,M.J., Donati,C., Medini,D.,
               Ward,N.L., Angiuoli,S.V., Crabtree,J., Jones,A.L., Durkin,A.S.,
               Deboy,R.T., Davidsen,T.M., Mora,M., Scarselli,M., Margarit Y
               Ros,I., Peterson,J.D., Hauser,C.R., Sundaram,J.P., Nelson,W.C.,
               Madupu,R., Brinkac,L.M., Dodson,R.J., Rosovitz,M.J., Sullivan,S.A.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Selengut,J., Gwinn,M.L., Zhou,L.,
               Zafar,N., Khouri,H., Radune,D., Dimitrov,G., Watkins,K.,
               O'connor,K.J., Smith,S., Utterback,T.R., White,O., Rubens,C.E.,
               Grandi,G., Madoff,L.C., Kasper,D.L., Telford,J.L., Wessels,M.R.,
               Rappuoli,R. and Fraser,C.M.
     TITLE     Genome analysis of multiple pathogenic isolates of Streptococcus
               agalactiae: Implications for the microbial 'pan-genome'
     JOURNAL   (er) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102 (39), 13950-13955 (2005)
      PUBMED   16172379
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2127839)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-OCT-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2127839)
     AUTHORS   Tettelin,H., Masignani,V., Cieslewicz,M.J., Donati,C., Medini,D.,
               Ward,N.L., Angiuoli,S.V., Crabtree,J., Jones,A.L., Durkin,A.S.,
               Deboy,R.T., Davidsen,T.M., Mora,M., Scarselli,M., Margarit Y
               Ros,I., Peterson,J.D., Hauser,C.R., Sundaram,J.P., Nelson,W.C.,
               Madupu,R., Brinkac,L.M., Dodson,R.J., Rosovitz,M.J., Sullivan,S.A.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Selengut,J., Gwinn,M.L., Zhou,L.,
               Zafar,N., Khouri,H., Radune,D., Dimitrov,G., Watkins,K.,
               O'connor,K.J., Smith,S., Utterback,T.R., White,O., Rubens,C.E.,
               Grandi,G., Madoff,L.C., Kasper,D.L., Telford,J.L., Wessels,M.R.,
               Rappuoli,R. and Fraser,C.M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (30-AUG-2005) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000114.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
16406 17912 + 1507 76786714 SAK_0016 - 16S ribosomal RNA
18002 18074 + 73 76786714 SAK_0017 - 02 Ala tRNA
18229 21131 + 2903 76786714 SAK_0018 - 23S ribosomal RNA
21206 21321 + 116 76786714 SAK_0019 - 5S ribosomal RNA
21325 21397 + 73 76786714 SAK_0020 - 13 Val tRNA
21400 21472 + 73 76786714 SAK_0021 - 06 Asp tRNA
21475 21547 + 73 76786714 SAK_0022 - 10 Lys tRNA
21557 21638 + 82 76786714 SAK_0023 - 15 Leu tRNA
21649 21721 + 73 76786714 SAK_0024 - 12 Thr tRNA
21755 21826 + 72 76786714 SAK_0025 - 01 Gly tRNA
21835 21919 + 85 76786714 SAK_0026 - 15 Leu tRNA
21931 22004 + 74 76786714 SAK_0027 - 11 Arg tRNA
22012 22085 + 74 76786714 SAK_0028 - 03 Pro tRNA
22238 23744 + 1507 76786714 SAK_0029 - 16S ribosomal RNA
23834 23906 + 73 76786714 SAK_0030 - 02 Ala tRNA
24061 26963 + 2903 76786714 SAK_0031 - 23S ribosomal RNA
27038 27153 + 116 76786714 SAK_0032 - 5S ribosomal RNA
27157 27229 + 73 76786714 SAK_0033 - 13 Val tRNA
27232 27304 + 73 76786714 SAK_0034 - 06 Asp tRNA
27307 27379 + 73 76786714 SAK_0035 - 10 Lys tRNA
27389 27470 + 82 76786714 SAK_0036 - 15 Leu tRNA
27481 27553 + 73 76786714 SAK_0037 - 12 Thr tRNA
27587 27658 + 72 76786714 SAK_0038 - 01 Gly tRNA
27667 27751 + 85 76786714 SAK_0039 - 15 Leu tRNA
27763 27836 + 74 76786714 SAK_0040 - 11 Arg tRNA
27844 27917 + 74 76786714 SAK_0041 - 03 Pro tRNA
27933 28006 + 74 76786714 SAK_0042 - 16 Met tRNA
28026 28099 + 74 76786714 SAK_0043 - 16 Met tRNA
28115 28204 + 90 76786714 SAK_0044 - 08 Ser tRNA
28215 28288 + 74 76786714 SAK_0045 - 16 Met tRNA
28291 28363 + 73 76786714 SAK_0046 - 17 Phe tRNA
28383 28453 + 71 76786714 SAK_0047 - 01 Gly tRNA
28488 28561 + 74 76786714 SAK_0048 - 14 Ile tRNA
28575 28662 + 88 76786714 SAK_0049 - 08 Ser tRNA
90927 92433 + 1507 76786714 SAK_0118 - 16S ribosomal RNA
92523 92595 + 73 76786714 SAK_0119 - 02 Ala tRNA
92752 95654 + 2903 76786714 SAK_0120 - 23S ribosomal RNA
95729 95844 + 116 76786714 SAK_0121 - 5S ribosomal RNA
95848 95920 + 73 76786714 SAK_0122 - 13 Val tRNA
95923 95995 + 73 76786714 SAK_0123 - 06 Asp tRNA
95998 96070 + 73 76786714 SAK_0124 - 10 Lys tRNA
96080 96161 + 82 76786714 SAK_0125 - 15 Leu tRNA
96172 96244 + 73 76786714 SAK_0126 - 12 Thr tRNA
96273 96349 + 77 76786714 SAK_0127 - 14 Ile tRNA
96357 96428 + 72 76786714 SAK_0128 - 04 Glu tRNA
96442 96531 + 90 76786714 SAK_0129 - 08 Ser tRNA
96542 96615 + 74 76786714 SAK_0130 - 16 Met tRNA
96618 96690 + 73 76786714 SAK_0131 - 17 Phe tRNA
96702 96782 + 81 76786714 SAK_0132 - 18 Tyr tRNA
96789 96859 + 71 76786714 SAK_0133 - 20 Trp tRNA
96874 96946 + 73 76786714 SAK_0134 - 09 His tRNA
96953 97024 + 72 76786714 SAK_0135 - 05 Gln tRNA
97035 97118 + 84 76786714 SAK_0136 - 15 Leu tRNA
118300 118385 + 86 76786714 SAK_0159 - 15 Leu tRNA
175172 176678 + 1507 76786714 SAK_0211 - 16S ribosomal RNA
176768 176840 + 73 76786714 SAK_0212 - 02 Ala tRNA
176997 179899 + 2903 76786714 SAK_0213 - 23S ribosomal RNA
179974 180089 + 116 76786714 SAK_0214 - 5S ribosomal RNA
180095 180168 + 74 76786714 SAK_0215 - 07 Asn tRNA
259761 261267 + 1507 76786714 SAK_0304 - 16S ribosomal RNA
261357 261429 + 73 76786714 SAK_0305 - 02 Ala tRNA
261584 264486 + 2903 76786714 SAK_0306 - 23S ribosomal RNA
264561 264676 + 116 76786714 SAK_0307 - 5S ribosomal RNA
264680 264752 + 73 76786714 SAK_0308 - 13 Val tRNA
264758 264828 + 71 76786714 SAK_0309 - 01 Gly tRNA
264865 264941 + 77 76786714 SAK_0310 - 14 Ile tRNA
264949 265020 + 72 76786714 SAK_0311 - 04 Glu tRNA
265034 265123 + 90 76786714 SAK_0312 - 08 Ser tRNA
265134 265207 + 74 76786714 SAK_0313 - 16 Met tRNA
265210 265282 + 73 76786714 SAK_0314 - 17 Phe tRNA
265294 265374 + 81 76786714 SAK_0315 - 18 Tyr tRNA
265381 265451 + 71 76786714 SAK_0316 - 20 Trp tRNA
265466 265538 + 73 76786714 SAK_0317 - 09 His tRNA
265545 265616 + 72 76786714 SAK_0318 - 05 Gln tRNA
265627 265710 + 84 76786714 SAK_0319 - 15 Leu tRNA
358663 360169 + 1507 76786714 SAK_0409 - 16S ribosomal RNA
360259 360331 + 73 76786714 SAK_0410 - 02 Ala tRNA
360486 363388 + 2903 76786714 SAK_0411 - 23S ribosomal RNA
363463 363578 + 116 76786714 SAK_0412 - 5S ribosomal RNA
363584 363657 + 74 76786714 SAK_0413 - 07 Asn tRNA
395439 395526 + 88 76786714 SAK_0450 - 08 Ser tRNA
427806 429312 + 1507 76786714 SAK_0484 - 16S ribosomal RNA
429402 429474 + 73 76786714 SAK_0485 - 02 Ala tRNA
429629 432531 + 2903 76786714 SAK_0486 - 23S ribosomal RNA
432606 432721 + 116 76786714 SAK_0487 - 5S ribosomal RNA
432725 432797 + 73 76786714 SAK_0488 - 13 Val tRNA
432803 432873 + 71 76786714 SAK_0489 - 01 Gly tRNA
432910 432986 + 77 76786714 SAK_0490 - 14 Ile tRNA
432994 433065 + 72 76786714 SAK_0491 - 04 Glu tRNA
463511 463581 - 71 76786714 SAK_0519 - 12 Thr tRNA
627462 627533 + 72 76786714 SAK_0693 - 11 Arg tRNA
999967 1000313 - 347 76786714 SAK_1030 - sRNA
1208372 1208443 - 72 76786714 SAK_1236 - 11 Arg tRNA
1209841 1209915 - 75 76786714 SAK_1238 - 05 Gln tRNA
1209921 1210001 - 81 76786714 SAK_1239 - 18 Tyr tRNA
1373462 1373533 - 72 76786714 SAK_1387 - 04 Glu tRNA
1373542 1373613 - 72 76786714 SAK_1388 - 05 Gln tRNA
1851295 1851365 + 71 76786714 SAK_1855 - 19 Cys tRNA
1939018 1939093 + 76 76786714 SAK_1939 - 10 Lys tRNA
2124438 2124511 - 74 76786714 SAK_2131 - 07 Asn tRNA
2124541 2124612 - 72 76786714 SAK_2132 - 04 Glu tRNA
2124805 2124878 + 74 76786714 SAK_2133 - 11 Arg tRNA