Геном прокариот/Материалы:NC 007626

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 007626»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_007626            4967148 bp    DNA     circular BCT 29-JUN-2007
   DEFINITION  Magnetospirillum magneticum AMB-1, complete genome.
   ACCESSION   NC_007626
   VERSION     NC_007626.1  GI:83309099
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Magnetospirillum magneticum AMB-1
     ORGANISM  Magnetospirillum magneticum AMB-1
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales;
               Rhodospirillaceae; Magnetospirillum.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Matsunaga,T., Okamura,Y., Fukuda,Y., Wahyudi,A.T., Murase,Y. and
               Takeyama,H.
     TITLE     Complete Genome Sequence of the Facultative Anaerobic Magnetotactic
               Bacterium Magnetospirillum sp. strain AMB-1
     JOURNAL   DNA Res. 12 (3), 157-166 (2005)
      PUBMED   16303747
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4967148)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-DEC-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4967148)
     AUTHORS   Matsunaga,T., Okamura,Y., Fukuda,Y. and Takeyama,H.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-SEP-2004) Tadashi Matsunaga, Tokyo University of
               Agriculture and Technology, Department of Biotechnology; Naka-cho
               2-24-16, Koganei, Tokyo 184-8588, Japan
               (E-mail:tmatsuna@cc.tuat.ac.jp, Tel:81-42-388-7020)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP007255.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
6801 6875 - 75 83309099 amb_t01 - 01 Gly tRNA
380430 380519 + 90 83309099 amb_t02 - 08 Ser tRNA
454640 454732 + 93 83309099 amb_t03 - 08 Ser tRNA
468938 469023 - 86 83309099 amb_t04 - 15 Leu tRNA
521007 521082 - 76 83309099 amb_t05 - 02 Ala tRNA
747571 747647 - 77 83309099 amb_t06 - 09 His tRNA
751005 751080 - 76 83309099 amb_t07 - 16 Met tRNA
781888 781974 - 87 83309099 amb_t08 - 15 Leu tRNA
960223 960299 + 77 83309099 amb_t09 - 03 Pro tRNA
964910 966386 + 1477 83309099 amb_r01 - 16S ribosomal RNA
966396 969771 - 3376 83309099 amb_r05 - 5S ribosomal RNA
966491 966567 + 77 83309099 amb_t10 - 14 Ile tRNA
966937 969688 + 2752 83309099 amb_r02 - 23S ribosomal RNA
969994 970070 + 77 83309099 amb_t11 - 16 Met tRNA
1103090 1103163 + 74 83309099 amb_t12 - Xaa tRNA
1279532 1279623 - 92 83309099 amb_t13 - 08 Ser tRNA
1657719 1657794 - 76 83309099 amb_t14 - 12 Thr tRNA
1827136 1828612 + 1477 83309099 amb_r03 - 16S ribosomal RNA
1828717 1828793 + 77 83309099 amb_t15 - 14 Ile tRNA
1829163 1831914 + 2752 83309099 amb_r04 - 23S ribosomal RNA
1831997 1832119 + 123 83309099 amb_r06 - 5S ribosomal RNA
1832220 1832296 + 77 83309099 amb_t16 - 16 Met tRNA
2128333 2128409 - 77 83309099 amb_t17 - 06 Asp tRNA
2358551 2358625 - 75 83309099 amb_t18 - 13 Val tRNA
2446435 2446509 - 75 83309099 amb_t19 - 07 Asn tRNA
2446585 2446658 - 74 83309099 amb_t20 - 19 Cys tRNA
2560530 2560606 + 77 83309099 amb_t21 - 03 Pro tRNA
2592241 2592316 + 76 83309099 amb_t22 - 10 Lys tRNA
2632831 2632918 + 88 83309099 amb_t23 - 08 Ser tRNA
2973818 2973894 - 77 83309099 amb_t24 - 06 Asp tRNA
2976418 2976493 - 76 83309099 amb_t25 - 13 Val tRNA
3061495 3061569 + 75 83309099 amb_t26 - 13 Val tRNA
3263309 3263385 - 77 83309099 amb_t27 - 16 Met tRNA
3397235 3397310 - 76 83309099 amb_t28 - 20 Trp tRNA
3398704 3398777 - 74 83309099 amb_t29 - 01 Gly tRNA
3398881 3398966 - 86 83309099 amb_t30 - 18 Tyr tRNA
3400204 3400279 + 76 83309099 amb_t31 - 12 Thr tRNA
3449745 3449820 - 76 83309099 amb_t32 - 04 Glu tRNA
3531676 3531752 + 77 83309099 amb_t33 - 11 Arg tRNA
3628950 3629025 - 76 83309099 amb_t34 - 17 Phe tRNA
3776263 3776339 - 77 83309099 amb_t35 - 11 Arg tRNA
3998396 3998472 + 77 83309099 amb_t36 - 03 Pro tRNA
4105661 4105736 + 76 83309099 amb_t37 - 04 Glu tRNA
4160540 4160613 - 74 83309099 amb_t38 - 05 Gln tRNA
4310019 4310103 - 85 83309099 amb_t39 - 15 Leu tRNA
4343468 4343554 + 87 83309099 amb_t40 - 15 Leu tRNA
4450976 4451049 - 74 83309099 amb_t41 - 01 Gly tRNA
4561170 4561245 - 76 83309099 amb_t42 - 12 Thr tRNA
4667424 4667500 - 77 83309099 amb_t43 - 11 Arg tRNA
4675393 4675468 + 76 83309099 amb_t44 - 02 Ala tRNA
4692954 4693030 + 77 83309099 amb_t45 - 11 Arg tRNA
4843587 4843661 - 75 83309099 amb_t46 - 05 Gln tRNA