Материалы:NC 008313

Материал из Викиверситета
Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_008313            4052032 bp    DNA     circular BCT 27-JUN-2007
   DEFINITION  Ralstonia eutropha H16 chromosome 1, complete sequence.
   ACCESSION   NC_008313
   VERSION     NC_008313.1  GI:113866031
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Ralstonia eutropha H16
     ORGANISM  Ralstonia eutropha H16
               Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales;
               Burkholderiaceae; Cupriavidus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4052032)
     AUTHORS   Pohlmann,A., Fricke,W.F., Reinecke,F., Kusian,B., Liesegang,H.,
               Cramm,R., Eitinger,T., Ewering,C., Potter,M., Schwartz,E.,
               Strittmatter,A., Voss,I., Gottschalk,G., Steinbuchel,A.,
               Friedrich,B. and Bowien,B.
     TITLE     Genome sequence of the bioplastic-producing 'Knallgas' bacterium
               Ralstonia eutropha H16
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 24 (10), 1257-1262 (2006)
      PUBMED   16964242
     REMARK    Erratum:[Nat Biotechnol. 2007 Apr;25(4):478]
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4052032)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (01-SEP-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4052032)
     AUTHORS   Fricke,W.F.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-APR-2006) Fricke W.F., Institute for Microbiology and
               Genetics, Goettingen Genomics Laboratory, Grisebachstr. 8,
               Goettingen 37077, GERMANY
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AM260479.
               URL -- http://www.g2l.bio.uni-goettingen.de
               Contacts: Heiko Liesegang (hlieseg@gwdg.de).
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
279140 279212 + 73 113866031 H16_A0268 - 19 Cys tRNA
391392 391468 - 77 113866031 H16_A0373 - 05 Gln tRNA
566469 566545 - 77 113866031 H16_A0539 - 16 Met tRNA
831628 831715 + 88 113866031 H16_A0765 - 08 Ser tRNA
1040614 1040703 - 90 113866031 H16_A0945 - 08 Ser tRNA
1051815 1051889 + 75 113866031 H16_A0957 - 11 Arg tRNA
1090717 1090792 - 76 113866031 H16_A0998 - 12 Thr tRNA
1147185 1147267 + 83 113866031 H16_A1049 - 15 Leu tRNA
1331515 1331606 + 92 113866031 H16_A1226 - 08 Ser tRNA
1452484 1452558 + 75 113866031 H16_A1338 - 13 Val tRNA
1461034 1461108 + 75 113866031 H16_A1347 - 03 Pro tRNA
1474911 1474986 - 76 113866031 H16_A1361 - 10 Lys tRNA
1477680 1477755 - 76 113866031 H16_A1364 - 10 Lys tRNA
1522216 1522291 - 76 113866031 H16_A1405 - 16 Met tRNA
1603751 1603837 - 87 113866031 H16_A1478 - 15 Leu tRNA
1614153 1614226 + 74 113866031 H16_A1486 - 13 Val tRNA
1625700 1625774 + 75 113866031 H16_A1498 - 06 Asp tRNA
1806458 1807992 + 1535 113866031 H16_A1659 - 16S ribosomal RNA
1808320 1811335 + 3016 113866031 H16_A1660 - 23S ribosomal RNA
1811521 1811635 + 115 113866031 H16_A1661 - 5S ribosomal RNA
2259217 2259291 + 75 113866031 H16_A2077 - 13 Val tRNA
2310579 2310663 + 85 113866031 H16_A2126 - 15 Leu tRNA
2311381 2311465 + 85 113866031 H16_A2127 - 15 Leu tRNA
2478126 2478201 - 76 113866031 H16_A2286 - 09 His tRNA
2554014 2554098 + 85 113866031 H16_A2350 - 15 Leu tRNA
2614094 2614170 - 77 113866031 H16_A2400 - 06 Asp tRNA
2614234 2614309 - 76 113866031 H16_A2401 - 04 Glu tRNA
2614376 2614451 - 76 113866031 H16_A2402 - 02 Ala tRNA
2643616 2643692 - 77 113866031 H16_A2427 - 11 Arg tRNA
2645411 2645485 + 75 113866031 H16_A2429 - 03 Pro tRNA
2688539 2688611 + 73 113866031 H16_A2468 - 13 Val tRNA
2733383 2733473 - 91 113866031 H16_A2523 - 08 Ser tRNA
2749388 2749472 + 85 113866031 H16_A2539 - 15 Leu tRNA
2753348 2753421 - 74 113866031 H16_A2543 - 19 Cys tRNA
2753542 2753617 - 76 113866031 H16_A2544 - 01 Gly tRNA
2753678 2753753 - 76 113866031 H16_A2545 - 01 Gly tRNA
2800347 2800420 + 74 113866031 H16_A2593 - 07 Asn tRNA
2891390 2891464 - 75 113866031 H16_A2679 - 11 Arg tRNA
3052475 3052550 - 76 113866031 H16_A2824 - 10 Lys tRNA
3095406 3095478 + 73 113866031 H16_A2869 - 01 Gly tRNA
3252685 3252767 + 83 113866031 H16_A3006 - 15 Leu tRNA
3514987 3515061 + 75 113866031 H16_A3254 - 03 Pro tRNA
3575211 3575327 - 117 113866031 H16_A3302 - 5S ribosomal RNA
3575502 3578320 - 2819 113866031 H16_A3303 - 23S ribosomal RNA
3578617 3578692 - 76 113866031 H16_A3304 - 02 Ala tRNA
3578705 3578781 - 77 113866031 H16_A3305 - 14 Ile tRNA
3578844 3580380 - 1537 113866031 H16_A3306 - 16S ribosomal RNA
3674199 3674274 - 76 113866031 H16_A3393 - 12 Thr tRNA
3778541 3778616 - 76 113866031 H16_A3504 - 20 Trp tRNA
3779937 3780011 - 75 113866031 H16_A3506 - 12 Thr tRNA
3780049 3780122 - 74 113866031 H16_A3507 - 01 Gly tRNA
3780174 3780259 - 86 113866031 H16_A3508 - 18 Tyr tRNA
3780548 3780664 - 117 113866031 H16_A3509 - 5S ribosomal RNA
3780839 3783657 - 2819 113866031 H16_A3510 - 23S ribosomal RNA
3783954 3784029 - 76 113866031 H16_A3511 - 02 Ala tRNA
3784042 3784118 - 77 113866031 H16_A3512 - 14 Ile tRNA
3784181 3785717 - 1537 113866031 H16_A3513 - 16S ribosomal RNA
3834937 3835012 - 76 113866031 H16_A3562 - 02 Ala tRNA
3882930 3883005 - 76 113866031 H16_A3613 - 11 Arg tRNA
3983051 3983126 - 76 113866031 H16_A3693 - 17 Phe tRNA