Геном прокариот/Материалы:NC 008319

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008319            2606748 bp    DNA     circular BCT 05-SEP-2006
   DEFINITION  Synechococcus sp. CC9311, complete genome.
   ACCESSION   NC_008319
   VERSION     NC_008319.1  GI:113952711
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Synechococcus sp. CC9311
     ORGANISM  Synechococcus sp. CC9311
               Bacteria; Cyanobacteria; Chroococcales; Synechococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2606748)
     AUTHORS   Palenik,B., Ren,Q., Dupont,C.L., Myers,G.S., Heidelberg,J.F.,
               Badger,J.H., Madupu,R., Nelson,W.C., Brinkac,L.M., Dodson,R.J.,
               Durkin,A.S., Daugherty,S.C., Sullivan,S.A., Khouri,H., Mohamoud,Y.,
               Halpin,R. and Paulsen,I.T.
     TITLE     Genome sequence of Synechococcus CC9311: Insights into adaptation
               to a coastal environment
     JOURNAL   (er) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2006) In press
      PUBMED   16938853
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2606748)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (04-SEP-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2606748)
     AUTHORS   Palenik,B., Ren,Q., Dupont,C.L., Myers,G.S., Heidelberg,J.F.,
               Badger,J.H., Madupu,R., Nelson,W.C., Brinkac,L.M., Dodson,R.J.,
               Durkin,A.S., Daugherty,S.C., Sullivan,S.A., Khouri,H.M.,
               Mohamoud,Y., Halpin,R. and Paulsen,I.T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (04-AUG-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000435.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
45490	45561	-	72	113952711	sync_0044	-	^{01 Gly tRNA}
87169	87240	+	72	113952711	sync_0082	-	^{01 Gly tRNA}
208369	208442	+	74	113952711	sync_0201	-	^{11 Arg tRNA}
288447	288519	+	73	113952711	sync_0278	-	Xaa tRNA
308668	308741	+	74	113952711	sync_0299	-	^{11 Arg tRNA}
344293	344374	+	82	113952711	sync_0335	-	^{15 Leu tRNA}
354855	354927	-	73	113952711	sync_0350	-	^{02 Ala tRNA}
398746	398819	+	74	113952711	sync_0390	-	^{03 Pro tRNA}
417315	417403	-	89	113952711	sync_0405	-	^{08 Ser tRNA}
439501	439572	+	72	113952711	sync_0441	-	^{05 Gln tRNA}
454675	454751	+	77	113952711	sync_0458	-	^{11 Arg tRNA}
470642	470712	+	71	113952711	sync_0474	-	^{19 Cys tRNA}
508476	508548	-	73	113952711	sync_0524	-	^{17 Phe tRNA}
521701	521775	-	75	113952711	sync_0542	-	^{12 Thr tRNA}
529961	531437	+	1477	113952711	sync_0553	-	16S ribosomal RNA
531624	531697	+	74	113952711	sync_0554	-	^{14 Ile tRNA}
531707	531779	+	73	113952711	sync_0555	-	^{02 Ala tRNA}
532200	535063	+	2864	113952711	sync_0556	-	23S ribosomal RNA
535179	535295	+	117	113952711	sync_0557	-	5S ribosomal RNA
554168	554242	-	75	113952711	sync_0576	-	^{12 Thr tRNA}
554253	554334	-	82	113952711	sync_0577	-	^{18 Tyr tRNA}
673778	673864	+	87	113952711	sync_0719	-	^{08 Ser tRNA}
691679	691751	-	73	113952711	sync_0738	-	^{09 His tRNA}
698137	698218	-	82	113952711	sync_0745	-	^{15 Leu tRNA}
699751	699832	+	82	113952711	sync_0747	-	^{15 Leu tRNA}
768454	768526	+	73	113952711	sync_0832	-	^{02 Ala tRNA}
907494	907566	-	73	113952711	sync_1005	-	^{04 Glu tRNA}
1026731	1026804	-	74	113952711	sync_1131	-	^{03 Pro tRNA}
1028873	1028944	-	72	113952711	sync_1135	-	^{10 Lys tRNA}
1078857	1078933	-	77	113952711	sync_1199	-	^{16 Met tRNA}
1143399	1143485	-	87	113952711	sync_1264	-	^{08 Ser tRNA}
1203943	1204016	-	74	113952711	sync_1324	-	^{16 Met tRNA}
1274383	1274469	-	87	113952711	sync_1393	-	^{08 Ser tRNA}
1304108	1304316	-	209	113952711	sync_1427	-	6S RNA sequence
1506397	1506470	+	74	113952711	sync_1643	-	^{03 Pro tRNA}
1702995	1703080	+	86	113952711	sync_1913	-	^{15 Leu tRNA}
1846185	1846258	-	74	113952711	sync_2083	-	^{11 Arg tRNA}
1900882	1900953	-	72	113952711	sync_2145	-	^{13 Val tRNA}
1915633	1915706	-	74	113952711	sync_2164	-	^{06 Asp tRNA}
1916236	1916308	-	73	113952711	sync_2167	-	^{20 Trp tRNA}
1930338	1930408	-	71	113952711	sync_2194	-	^{01 Gly tRNA}
1984730	1984801	+	72	113952711	sync_2259	-	^{13 Val tRNA}
2087350	2087422	+	73	113952711	sync_2376	-	^{12 Thr tRNA}
2143555	2143817	-	263	113952711	sync_2449	-	sRNA
2154043	2154127	-	85	113952711	sync_2458	-	^{15 Leu tRNA}
2219662	2219778	-	117	113952711	sync_2535	-	5S ribosomal RNA
2219894	2222757	-	2864	113952711	sync_2536	-	23S ribosomal RNA
2223178	2223250	-	73	113952711	sync_2537	-	^{02 Ala tRNA}
2223260	2223333	-	74	113952711	sync_2538	-	^{14 Ile tRNA}
2223520	2224996	-	1477	113952711	sync_2539	-	16S ribosomal RNA
2269768	2269839	+	72	113952711	sync_2589	-	^{07 Asn tRNA}
2498375	2498446	-	72	113952711	sync_2844	-	^{13 Val tRNA}