Геном прокариот/Материалы:NC 008358

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008358»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008358            3705021 bp    DNA     circular BCT 19-SEP-2006
   DEFINITION  Hyphomonas neptunium ATCC 15444, complete genome.
   ACCESSION   NC_008358
   VERSION     NC_008358.1  GI:114797051
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Hyphomonas neptunium ATCC 15444
     ORGANISM  Hyphomonas neptunium ATCC 15444
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales;
               Hyphomonadaceae; Hyphomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3705021)
     AUTHORS   Badger,J.H., Hoover,T.R., Brun,Y.V., Weiner,R.M., Laub,M.T.,
               Alexandre,G., Mrazek,J., Ren,Q., Paulsen,I.T., Nelson,K.E.,
               Khouri,H.M., Radune,D., Sosa,J., Dodson,R.J., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M.J., Madupu,R., Brinkac,L.M., Durkin,A.S.,
               Daugherty,S.C., Kothari,S.P., Giglio,M.G., Zhou,L., Haft,D.H.,
               Selengut,J.D., Davidsen,T.M., Yang,Q., Zafar,N. and Ward,N.L.
     TITLE     Comparative Genomic Evidence for a Close Relationship between the
               Dimorphic Prosthecate Bacteria Hyphomonas neptunium and Caulobacter
               crescentus
     JOURNAL   J. Bacteriol. 188 (19), 6841-6850 (2006)
      PUBMED   16980487
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3705021)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (19-SEP-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3705021)
     AUTHORS   Badger,J.H., Hoover,T.R., Brun,Y.V., Weiner,R.M., Laub,M.T.,
               Alexandre,G., Mrazek,J., Ren,Q., Paulsen,I.T., Nelson,K.E.,
               Khouri,H.M., Radune,D., Sosa,J., Dodson,R.J., Sullivan,S.A.,
               Rosovitz,M.J., Madupu,R., Brinkac,L.M., Durkin,A.S.,
               Daugherty,S.C., Kothari,S.P., Giglio,M.G., Zhou,L., Haft,D.H.,
               Selengut,J., Davidsen,T.M., Yang,Q., Zafar,N. and Ward,N.L.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-JUL-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000158.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
183585 183660 + 76 114797051 HNE_0197 - 02 Ala tRNA
217164 217240 - 77 114797051 HNE_0224 - 11 Arg tRNA
223246 223320 + 75 114797051 HNE_0232 - 13 Val tRNA
542000 542076 - 77 114797051 HNE_0545 - 16 Met tRNA
714902 714976 - 75 114797051 HNE_0703 - 13 Val tRNA
977472 977557 - 86 114797051 HNE_0963 - 15 Leu tRNA
993699 993774 + 76 114797051 HNE_0978 - 13 Val tRNA
1013000 1013073 - 74 114797051 HNE_1000 - 01 Gly tRNA
1032600 1032676 - 77 114797051 HNE_1022 - 16 Met tRNA
1072135 1072219 + 85 114797051 HNE_1063 - 15 Leu tRNA
1143571 1143646 + 76 114797051 HNE_1132 - 10 Lys tRNA
1176429 1176506 - 78 114797051 HNE_1165 - 03 Pro tRNA
1376876 1376950 - 75 114797051 HNE_1341 - 12 Thr tRNA
1458130 1458206 + 77 114797051 HNE_1425 - 06 Asp tRNA
1627993 1628077 + 85 114797051 HNE_1595 - 15 Leu tRNA
1726191 1726264 + 74 114797051 HNE_1680 - 19 Cys tRNA
1726607 1726682 + 76 114797051 HNE_1682 - 07 Asn tRNA
1773314 1773388 - 75 114797051 HNE_1730 - 17 Phe tRNA
1778392 1778467 + 76 114797051 HNE_1736 - 20 Trp tRNA
1862948 1863037 + 90 114797051 HNE_1816 - 08 Ser tRNA
1887504 1887579 - 76 114797051 HNE_1829 - 12 Thr tRNA
2036053 2036127 - 75 114797051 HNE_1967 - 04 Glu tRNA
2075939 2076015 - 77 114797051 HNE_1999 - 09 His tRNA
2152440 2152524 + 85 114797051 HNE_2078 - 15 Leu tRNA
2341931 2342020 - 90 114797051 HNE_2238 - 08 Ser tRNA
2615670 2615764 - 95 114797051 HNE_2487 - Sec tRNA
2711836 2711925 - 90 114797051 HNE_2557 - 08 Ser tRNA
2727619 2727695 + 77 114797051 HNE_2573 - 03 Pro tRNA
2728063 2728139 + 77 114797051 HNE_2575 - 11 Arg tRNA
2762395 2762469 - 75 114797051 HNE_2599 - 01 Gly tRNA
2796971 2797044 - 74 114797051 HNE_2637 - 05 Gln tRNA
2814506 2814582 - 77 114797051 HNE_2654 - 16 Met tRNA
2814765 2814883 - 119 114797051 HNE_2655 - 5S ribosomal RNA
2814978 2817750 - 2773 114797051 HNE_2656 - 23S ribosomal RNA
2818014 2818089 - 76 114797051 HNE_2657 - 02 Ala tRNA
2818161 2818237 - 77 114797051 HNE_2658 - 14 Ile tRNA
2818559 2819913 - 1355 114797051 HNE_2659 - 16S ribosomal RNA
2844612 2844685 - 74 114797051 HNE_2683 - 01 Gly tRNA
2846059 2846143 - 85 114797051 HNE_2685 - 18 Tyr tRNA
2899602 2899678 + 77 114797051 HNE_2738 - 03 Pro tRNA
3121003 3121313 - 311 114797051 HNE_2964 - sRNA
3217479 3217550 + 72 114797051 HNE_3046 - 17 Phe tRNA
3325490 3325566 - 77 114797051 HNE_3145 - 11 Arg tRNA
3391163 3391246 - 84 114797051 HNE_3222 - 15 Leu tRNA
3400123 3400198 + 76 114797051 HNE_3231 - 12 Thr tRNA
3585191 3585267 - 77 114797051 HNE_3447 - 11 Arg tRNA
3613097 3613184 - 88 114797051 HNE_3478 - 08 Ser tRNA