Геном прокариот/Материалы:NC 008593

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008593            2547720 bp    DNA     circular BCT 08-AUG-2007
   DEFINITION  Clostridium novyi NT, complete genome.
   ACCESSION   NC_008593
   VERSION     NC_008593.1  GI:118442852
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Clostridium novyi NT
     ORGANISM  Clostridium novyi NT
               Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
               Clostridium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2547720)
     AUTHORS   Bettegowda,C., Huang,X., Lin,J., Cheong,I., Kohli,M., Szabo,S.A.,
               Zhang,X., Diaz,L.A. Jr., Velculescu,V.E., Parmigiani,G.,
               Kinzler,K.W., Vogelstein,B. and Zhou,S.
     TITLE     The genome and transcriptomes of the anti-tumor agent Clostridium
               novyi-NT
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 24 (12), 1573-1580 (2006)
      PUBMED   17115055
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2547720)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (29-NOV-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2547720)
     AUTHORS   Bettegowda,C., Huang,X., Szabo,S., Cheong,I., Kohli,M.,
               Velculescu,V., Kinzler,K., Zhou,S. and Vogelstein,B.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (18-MAY-2006) Howard Hughes Medical Institute and Ludwig
               Center for Cancer Genetics & Therapeutics at the Johns Hopkins
               Kimmel Cancer Center, 1650 Orleans Street, Baltimore, MD 21231, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000382.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
20831	20906	+	76	118442852	NT01CX_0893	-	^{12 Thr tRNA}
37102	37176	+	75	118442852	NT01CX_0909	-	^{04 Glu tRNA}
37190	37265	+	76	118442852	NT01CX_0910	-	^{13 Val tRNA}
37279	37355	+	77	118442852	NT01CX_0911	-	^{06 Asp tRNA}
37363	37438	+	76	118442852	NT01CX_0912	-	^{12 Thr tRNA}
37456	37530	+	75	118442852	NT01CX_0913	-	^{04 Glu tRNA}
37544	37619	+	76	118442852	NT01CX_0914	-	^{13 Val tRNA}
37632	37708	+	77	118442852	NT01CX_0915	-	^{06 Asp tRNA}
37714	37789	+	76	118442852	NT01CX_0916	-	^{12 Thr tRNA}
128922	128997	-	76	118442852	NT01CX_1007	-	^{03 Pro tRNA}
152120	152208	+	89	118442852	NT01CX_1031	-	^{15 Leu tRNA}
152213	152288	+	76	118442852	NT01CX_1032	-	^{16 Met tRNA}
152294	152370	+	77	118442852	NT01CX_1033	-	^{16 Met tRNA}
152419	152507	+	89	118442852	NT01CX_1034	-	^{15 Leu tRNA}
152513	152588	+	76	118442852	NT01CX_1035	-	^{16 Met tRNA}
152623	152699	+	77	118442852	NT01CX_1036	-	^{16 Met tRNA}
166178	166252	+	75	118442852	NT01CX_1047	-	^{07 Asn tRNA}
170256	171767	+	1512	118442852	NT01CX_1050	-	16S ribosomal RNA
171942	174846	+	2905	118442852	NT01CX_1051	-	23S ribosomal RNA
174902	174976	+	75	118442852	NT01CX_1053	-	^{07 Asn tRNA}
174994	175110	+	117	118442852	NT01CX_1054	-	5S ribosomal RNA
175116	175190	+	75	118442852	NT01CX_1055	-	^{07 Asn tRNA}
217728	217803	+	76	118442852	NT01CX_1099	-	^{12 Thr tRNA}
525478	525553	-	76	118442852	NT01CX_1374	-	^{05 Gln tRNA}
574730	575072	+	343	118442852	NT01CX_1419	-	sRNA
881614	881700	-	87	118442852	NT01CX_1676	-	^{15 Leu tRNA}
886083	886168	+	86	118442852	NT01CX_1680	-	^{15 Leu tRNA}
958223	958298	+	76	118442852	NT01CX_1751	-	^{13 Val tRNA}
958314	958390	+	77	118442852	NT01CX_1752	-	^{06 Asp tRNA}
958399	958474	+	76	118442852	NT01CX_1753	-	^{17 Phe tRNA}
958482	958556	+	75	118442852	NT01CX_1754	-	^{01 Gly tRNA}
958568	958642	+	75	118442852	NT01CX_1755	-	^{19 Cys tRNA}
958730	958804	+	75	118442852	NT01CX_1756	-	^{19 Cys tRNA}
1805317	1805391	-	75	118442852	NT01CX_0151	-	^{07 Asn tRNA}
1805448	1808352	-	2905	118442852	NT01CX_0153	-	23S ribosomal RNA
1808480	1808556	-	77	118442852	NT01CX_0154	-	^{14 Ile tRNA}
1808560	1808635	-	76	118442852	NT01CX_0155	-	^{02 Ala tRNA}
1808764	1810275	-	1512	118442852	NT01CX_0156	-	16S ribosomal RNA
1923779	1923895	-	117	118442852	NT01CX_0250	-	5S ribosomal RNA
1923931	1926835	-	2905	118442852	NT01CX_0252	-	23S ribosomal RNA
1927010	1928521	-	1512	118442852	NT01CX_0253	-	16S ribosomal RNA
1946231	1946347	-	117	118442852	NT01CX_0271	-	5S ribosomal RNA
1946383	1949287	-	2905	118442852	NT01CX_0273	-	23S ribosomal RNA
1949462	1950973	-	1512	118442852	NT01CX_0274	-	16S ribosomal RNA
2027881	2027997	-	117	118442852	NT01CX_0340	-	5S ribosomal RNA
2028034	2030938	-	2905	118442852	NT01CX_0342	-	23S ribosomal RNA
2031113	2032624	-	1512	118442852	NT01CX_0343	-	16S ribosomal RNA
2036464	2036537	-	74	118442852	NT01CX_0346	-	^{01 Gly tRNA}
2036553	2036629	-	77	118442852	NT01CX_0347	-	^{14 Ile tRNA}
2036634	2036709	-	76	118442852	NT01CX_0348	-	^{02 Ala tRNA}
2098557	2098633	-	77	118442852	NT01CX_0404	-	^{11 Arg tRNA}
2098653	2098726	-	74	118442852	NT01CX_0405	-	^{01 Gly tRNA}
2098766	2098841	-	76	118442852	NT01CX_0406	-	^{10 Lys tRNA}
2098846	2098920	-	75	118442852	NT01CX_0407	-	^{05 Gln tRNA}
2098925	2099000	-	76	118442852	NT01CX_0408	-	^{09 His tRNA}
2099007	2099083	-	77	118442852	NT01CX_0409	-	^{11 Arg tRNA}
2099088	2099161	-	74	118442852	NT01CX_0410	-	^{01 Gly tRNA}
2099167	2099242	-	76	118442852	NT01CX_0411	-	^{03 Pro tRNA}
2099272	2099347	-	76	118442852	NT01CX_0412	-	^{10 Lys tRNA}
2099354	2099430	-	77	118442852	NT01CX_0413	-	^{11 Arg tRNA}
2099437	2099510	-	74	118442852	NT01CX_0414	-	^{01 Gly tRNA}
2099516	2099590	-	75	118442852	NT01CX_0415	-	^{01 Gly tRNA}
2099594	2099677	-	84	118442852	NT01CX_0416	-	^{15 Leu tRNA}
2099702	2099777	-	76	118442852	NT01CX_0417	-	^{10 Lys tRNA}
2099782	2099856	-	75	118442852	NT01CX_0418	-	^{05 Gln tRNA}
2099861	2099936	-	76	118442852	NT01CX_0419	-	^{09 His tRNA}
2099945	2100020	-	76	118442852	NT01CX_0420	-	^{10 Lys tRNA}
2100027	2100103	-	77	118442852	NT01CX_0421	-	^{11 Arg tRNA}
2100110	2100183	-	74	118442852	NT01CX_0422	-	^{01 Gly tRNA}
2100189	2100263	-	75	118442852	NT01CX_0423	-	^{01 Gly tRNA}
2100271	2100346	-	76	118442852	NT01CX_0424	-	^{03 Pro tRNA}
2187204	2187279	-	76	118442852	NT01CX_0500	-	^{20 Trp tRNA}
2205706	2205790	-	85	118442852	NT01CX_0517	-	^{18 Tyr tRNA}
2205831	2205906	-	76	118442852	NT01CX_0518	-	^{13 Val tRNA}
2205916	2206000	-	85	118442852	NT01CX_0519	-	^{18 Tyr tRNA}
2206005	2206080	-	76	118442852	NT01CX_0520	-	^{12 Thr tRNA}
2464769	2464885	-	117	118442852	NT01CX_0773	-	5S ribosomal RNA
2464964	2467868	-	2905	118442852	NT01CX_0775	-	23S ribosomal RNA
2468043	2469554	-	1512	118442852	NT01CX_0776	-	16S ribosomal RNA
2471065	2471140	-	76	118442852	NT01CX_0778	-	^{10 Lys tRNA}
2471411	2471486	-	76	118442852	NT01CX_0779	-	^{17 Phe tRNA}
2471489	2471608	-	120	118442852	NT01CX_0779a	-	5S ribosomal RNA
2472004	2472079	-	76	118442852	NT01CX_0780	-	^{17 Phe tRNA}
2472085	2472201	-	117	118442852	NT01CX_0781	-	5S ribosomal RNA
2472238	2475142	-	2905	118442852	NT01CX_0783	-	23S ribosomal RNA
2475317	2476828	-	1512	118442852	NT01CX_0784	-	16S ribosomal RNA
2487268	2487343	-	76	118442852	NT01CX_0797	-	^{10 Lys tRNA}
2487350	2487466	-	117	118442852	NT01CX_0798	-	5S ribosomal RNA
2487502	2490406	-	2905	118442852	NT01CX_0800	-	23S ribosomal RNA
2490581	2492092	-	1512	118442852	NT01CX_0801	-	16S ribosomal RNA
2497597	2497671	-	75	118442852	NT01CX_0809	-	^{04 Glu tRNA}
2497725	2497799	-	75	118442852	NT01CX_0810	-	^{05 Gln tRNA}
2497806	2497882	-	77	118442852	NT01CX_0811	-	^{11 Arg tRNA}
2497888	2497961	-	74	118442852	NT01CX_0812	-	^{01 Gly tRNA}
2497976	2498059	-	84	118442852	NT01CX_0813	-	^{15 Leu tRNA}
2498077	2498151	-	75	118442852	NT01CX_0814	-	^{04 Glu tRNA}
2498158	2498274	-	117	118442852	NT01CX_0815	-	5S ribosomal RNA
2498310	2501214	-	2905	118442852	NT01CX_0817	-	23S ribosomal RNA
2501342	2501418	-	77	118442852	NT01CX_0818	-	^{14 Ile tRNA}
2501422	2501497	-	76	118442852	NT01CX_0819	-	^{02 Ala tRNA}
2501581	2503092	-	1512	118442852	NT01CX_0820	-	16S ribosomal RNA
2507885	2507974	-	90	118442852	NT01CX_0826	-	^{08 Ser tRNA}
2509404	2509480	-	77	118442852	NT01CX_0829	-	^{11 Arg tRNA}
2523119	2523195	-	77	118442852	NT01CX_0844	-	^{11 Arg tRNA}
2523339	2523429	-	91	118442852	NT01CX_0845	-	^{08 Ser tRNA}
2523455	2523545	-	91	118442852	NT01CX_0846	-	^{08 Ser tRNA}
2523611	2523701	-	91	118442852	NT01CX_0847	-	^{08 Ser tRNA}
2533304	2533379	-	76	118442852	NT01CX_0855	-	^{02 Ala tRNA}
2533383	2533459	-	77	118442852	NT01CX_0856	-	^{16 Met tRNA}
2533463	2533579	-	117	118442852	NT01CX_0857	-	5S ribosomal RNA
2533658	2536562	-	2905	118442852	NT01CX_0859	-	23S ribosomal RNA
2536737	2538248	-	1512	118442852	NT01CX_0860	-	16S ribosomal RNA