Геном прокариот/Материалы:NC 008702

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008702»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008702            4376040 bp    DNA     circular BCT 08-AUG-2007
   DEFINITION  Azoarcus sp. BH72, complete genome.
   ACCESSION   NC_008702
   VERSION     NC_008702.1  GI:119896292
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Azoarcus sp. BH72
     ORGANISM  Azoarcus sp. BH72
               Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Rhodocyclales;
               Rhodocyclaceae; Azoarcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4376040)
     AUTHORS   Krause,A., Ramakumar,A., Bartels,D., Battistoni,F., Bekel,T.,
               Boch,J., Bohm,M., Friedrich,F., Hurek,T., Krause,L., Linke,B.,
               McHardy,A.C., Sarkar,A., Schneiker,S., Syed,A.A., Thauer,R.,
               Vorholter,F.J., Weidner,S., Puhler,A., Reinhold-Hurek,B., Kaiser,O.
               and Goesmann,A.
     TITLE     Complete genome of the mutualistic, N2-fixing grass endophyte
               Azoarcus sp. strain BH72
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 24 (11), 1385-1391 (2006)
      PUBMED   17057704
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4376040)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (22-DEC-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4376040)
     AUTHORS   Reinhold-Hurek,B. and Krause,A.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (19-SEP-2006) Reinhold-Hurek B., Krause A., University of
               Bremen, General Microbiology, PO. Box 33 04 40, D-28334 Bremen,
               GERMANY
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AM406670.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
204448 204524 + 77 119896292 azo_tRNA_0001 - Anticodon: CCG
204806 206339 + 1534 119896292 azo_rrn1 - 16S ribosomal RNA
206413 206489 + 77 119896292 azo_tRNA_0002 - Anticodon: GAT
206517 206592 + 76 119896292 azo_tRNA_0003 - Anticodon: TGC
206857 209743 + 2887 119896292 azo_rrn2 - 23S ribosomal RNA
209845 209962 + 118 119896292 azo_rrn2a - 5S ribosomal RNA
438216 438288 - 73 119896292 azo_tRNA_0004 - Anticodon: TTT
601691 601766 - 76 119896292 azo_tRNA_0005 - Anticodon: CTT
770728 772261 + 1534 119896292 azo_rrn7 - 16S ribosomal RNA
772335 772411 + 77 119896292 azo_tRNA_0006 - Anticodon: GAT
772439 772514 + 76 119896292 azo_tRNA_0007 - Anticodon: TGC
772779 775665 + 2887 119896292 azo_rrn8 - 23S ribosomal RNA
775767 775884 + 118 119896292 azo_rrn8a - 5S ribosomal RNA
807603 807679 - 77 119896292 azo_tRNA_0008 - Anticodon: TTG
832451 832527 - 77 119896292 azo_tRNA_0009 - Anticodon: CAT
973414 973498 + 85 119896292 azo_tRNA_0010 - Anticodon: CAA
1005095 1005179 - 85 119896292 azo_tRNA_0011 - Anticodon: CAG
1005353 1005437 - 85 119896292 azo_tRNA_0012 - Anticodon: CAG
1052967 1053042 + 76 119896292 azo_tRNA_0013 - Anticodon: GAA
1091451 1091527 + 77 119896292 azo_tRNA_0014 - Anticodon: CGG
1104890 1104965 + 76 119896292 azo_tRNA_0015 - Anticodon: GGC
1104986 1105061 + 76 119896292 azo_tRNA_0016 - Anticodon: TTC
1105124 1105200 + 77 119896292 azo_tRNA_0017 - Anticodon: GTC
1105287 1105362 + 76 119896292 azo_tRNA_0018 - Anticodon: GGC
1105372 1105447 + 76 119896292 azo_tRNA_0019 - Anticodon: TTC
1105508 1105584 + 77 119896292 azo_tRNA_0020 - Anticodon: GTC
1162391 1162467 + 77 119896292 azo_tRNA_0021 - Anticodon: GAC
1170058 1170134 + 77 119896292 azo_tRNA_0022 - Anticodon: GGG
1184957 1185046 + 90 119896292 azo_tRNA_0023 - Anticodon: TGA
1283196 1283271 + 76 119896292 azo_tRNA_0024 - Anticodon: CGT
1391911 1393444 + 1534 119896292 azo_rrn5 - 16S ribosomal RNA
1393517 1393593 + 77 119896292 azo_tRNA_0025 - Anticodon: GAT
1393621 1393696 + 76 119896292 azo_tRNA_0026 - Anticodon: TGC
1393962 1396848 + 2887 119896292 azo_rrn6 - 23S ribosomal RNA
1396949 1397066 + 118 119896292 azo_rrn6a - 5S ribosomal RNA
1445319 1445408 - 90 119896292 azo_tRNA_0027 - Anticodon: CGA
1466272 1466348 - 77 119896292 azo_tRNA_0028 - Anticodon: ACG
1508492 1508567 + 76 119896292 azo_tRNA_0029 - Anticodon: CGC
1524791 1524875 + 85 119896292 azo_tRNA_0030 - Anticodon: GAG
1771974 1772049 - 76 119896292 azo_tRNA_0031 - Anticodon: GTT
1772115 1772190 - 76 119896292 azo_tRNA_0032 - Anticodon: GTT
1809899 1809974 + 76 119896292 azo_tRNA_0033 - Anticodon: GCC
1810049 1810122 + 74 119896292 azo_tRNA_0034 - Anticodon: GCA
1810132 1810207 + 76 119896292 azo_tRNA_0035 - Anticodon: GCC
1812221 1812305 - 85 119896292 azo_tRNA_0036 - Anticodon: TAA
2045941 2046025 + 85 119896292 azo_tRNA_0037 - Anticodon: TAG
2269150 2269224 - 75 119896292 azo_tRNA_0038 - Anticodon: CAC
2269263 2269337 - 75 119896292 azo_tRNA_0039 - Anticodon: CAC
2269418 2269493 - 76 119896292 azo_tRNA_0040 - Anticodon: TAC
2307999 2308074 - 76 119896292 azo_tRNA_0041 - Anticodon: GTG
2308120 2308196 - 77 119896292 azo_tRNA_0042 - Anticodon: TCT
2308224 2308300 - 77 119896292 azo_tRNA_0043 - Anticodon: TGG
2508773 2508863 - 91 119896292 azo_tRNA_0044 - Anticodon: GGA
2869372 2869448 - 77 119896292 azo_tRNA_0045 - Anticodon: CAT
2959702 2960079 - 378 119896292 azo_rRNA_0001 - tmRNA
2962600 2962675 - 76 119896292 azo_tRNA_0046 - Anticodon: TGT
3423041 3423134 - 94 119896292 azo_tRNA_0047 - Anticodon: GCT
3499971 3500045 + 75 119896292 azo_tRNA_0048 - Anticodon: CCT
3511781 3511898 - 118 119896292 azo3194a - 5S ribosomal RNA
3511974 3514860 - 2887 119896292 azo_rrn4 - 23S ribosomal RNA
3515151 3515226 - 76 119896292 azo_tRNA_0049 - Anticodon: TGC
3515254 3515330 - 77 119896292 azo_tRNA_0050 - Anticodon: GAT
3515378 3516911 - 1534 119896292 azo_rrn3 - 16S ribosomal RNA
3559218 3559256 + 39 119896292 azo_tRNA_0051 - 14 Ile tRNA
3559462 3559501 + 40 119896292 azo_tRNA_0051 - 14 Ile tRNA
3759284 3759359 - 76 119896292 azo_tRNA_0052 - Anticodon: CCA
3760686 3760760 - 75 119896292 azo_tRNA_0053 - Anticodon: GGT
3760782 3760855 - 74 119896292 azo_tRNA_0054 - Anticodon: TCC
3760941 3761025 - 85 119896292 azo_tRNA_0055 - Anticodon: GTA
4144876 4144950 + 75 119896292 azo_tRNA_0056 - Anticodon: CCC