Геном прокариот/Материалы:NC 009009

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_009009            2388435 bp    DNA     circular BCT 16-FEB-2007
   DEFINITION  Streptococcus sanguinis SK36, complete genome.
   ACCESSION   NC_009009
   VERSION     NC_009009.1  GI:125716887
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Streptococcus sanguinis SK36
     ORGANISM  Streptococcus sanguinis SK36
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Streptococcaceae;
               Streptococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2388435)
     AUTHORS   Xu,P., Alves,J.M., Kitten,T., Brown,A., Chen,Z., Ozaki,L.S.,
               Manque,P., Ge,X., Serrano,M.G., Puiu,D., Hendricks,S., Wang,Y.,
               Chaplin,M.D., Akan,D., Paik,S., Peterson,D.L., Macrina,F.L. and
               Buck,G.A.
     TITLE     Genome of the opportunistic pathogen Streptococcus sanguinis
     JOURNAL   (er) J. Bacteriol. (2007) In press
      PUBMED   17277061
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2388435)
     AUTHORS   Xu,P., Alves,J.M., Kitten,T., Peterson,D.L., Macrina,F. and
               Buck,G.A.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-JUN-2006) Virginia Commonwealth University, Philips
               Institute, Richmond, VA 23298, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2388435)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-NOV-2000) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000387.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
15263	15334	+	72	125716887	SSA_2412	-	^{04 Glu tRNA}
15340	15416	+	77	125716887	SSA_2413	-	^{07 Asn tRNA}
16379	17929	+	1551	125716887	SSA_2400	-	16S small subunit ribosomal RNA
17991	18063	+	73	125716887	SSA_2414	-	^{02 Ala tRNA}
18190	21087	+	2898	125716887	SSA_2404	-	23S large subunit ribosomal RNA
21206	21321	+	116	125716887	SSA_2408	-	5S ribosomal RNA
21325	21397	+	73	125716887	SSA_2415	-	^{13 Val tRNA}
21414	21486	+	73	125716887	SSA_2416	-	^{06 Asp tRNA}
21519	21591	+	73	125716887	SSA_2417	-	^{10 Lys tRNA}
21597	21678	+	82	125716887	SSA_2418	-	^{15 Leu tRNA}
21695	21767	+	73	125716887	SSA_2419	-	^{12 Thr tRNA}
21782	21853	+	72	125716887	SSA_2420	-	^{01 Gly tRNA}
21861	21946	+	86	125716887	SSA_2421	-	^{15 Leu tRNA}
21978	22051	+	74	125716887	SSA_2422	-	^{11 Arg tRNA}
22071	22144	+	74	125716887	SSA_2423	-	^{03 Pro tRNA}
22150	22223	+	74	125716887	SSA_2424	-	^{16 Met tRNA}
22237	22310	+	74	125716887	SSA_2425	-	^{16 Met tRNA}
22323	22412	+	90	125716887	SSA_2426	-	^{08 Ser tRNA}
22432	22505	+	74	125716887	SSA_2427	-	^{16 Met tRNA}
22511	22583	+	73	125716887	SSA_2428	-	^{17 Phe tRNA}
22604	22674	+	71	125716887	SSA_2429	-	^{01 Gly tRNA}
22708	22781	+	74	125716887	SSA_2430	-	^{14 Ile tRNA}
22791	22878	+	88	125716887	SSA_2431	-	^{08 Ser tRNA}
124363	125913	+	1551	125716887	SSA_2401	-	16S small subunit ribosomal RNA
125975	126047	+	73	125716887	SSA_2432	-	^{02 Ala tRNA}
126174	129073	+	2900	125716887	SSA_2405	-	23S large subunit ribosomal RNA
129192	129307	+	116	125716887	SSA_2409	-	5S ribosomal RNA
129311	129383	+	73	125716887	SSA_2433	-	^{13 Val tRNA}
129391	129461	+	71	125716887	SSA_2434	-	^{01 Gly tRNA}
129495	129568	+	74	125716887	SSA_2435	-	^{14 Ile tRNA}
129584	129655	+	72	125716887	SSA_2436	-	^{04 Glu tRNA}
129663	129752	+	90	125716887	SSA_2437	-	^{08 Ser tRNA}
129772	129845	+	74	125716887	SSA_2438	-	^{16 Met tRNA}
129851	129923	+	73	125716887	SSA_2439	-	^{17 Phe tRNA}
129937	130017	+	81	125716887	SSA_2440	-	^{18 Tyr tRNA}
130026	130096	+	71	125716887	SSA_2441	-	^{20 Trp tRNA}
130107	130179	+	73	125716887	SSA_2442	-	^{09 His tRNA}
130193	130264	+	72	125716887	SSA_2443	-	^{05 Gln tRNA}
130277	130360	+	84	125716887	SSA_2444	-	^{15 Leu tRNA}
228378	228450	-	73	125716887	SSA_2472	-	^{10 Lys tRNA}
230927	230999	-	73	125716887	SSA_2471	-	^{10 Lys tRNA}
807051	807141	+	91	125716887	SSA_2445	-	^{08 Ser tRNA}
1245602	1245673	-	72	125716887	SSA_2470	-	^{11 Arg tRNA}
1247126	1247197	-	72	125716887	SSA_2469	-	^{05 Gln tRNA}
1247211	1247291	-	81	125716887	SSA_2468	-	^{18 Tyr tRNA}
1290162	1290233	-	72	125716887	SSA_2467	-	^{11 Arg tRNA}
1617445	1617517	-	73	125716887	SSA_2466	-	^{12 Thr tRNA}
1823484	1823560	-	77	125716887	SSA_2465	-	^{03 Pro tRNA}
1823607	1823680	-	74	125716887	SSA_2464	-	^{11 Arg tRNA}
1823738	1823811	-	74	125716887	SSA_2463	-	^{11 Arg tRNA}
1823843	1823928	-	86	125716887	SSA_2462	-	^{15 Leu tRNA}
1823936	1824007	-	72	125716887	SSA_2461	-	^{01 Gly tRNA}
1824022	1824094	-	73	125716887	SSA_2460	-	^{12 Thr tRNA}
1824111	1824192	-	82	125716887	SSA_2459	-	^{15 Leu tRNA}
1824198	1824270	-	73	125716887	SSA_2458	-	^{10 Lys tRNA}
1824303	1824375	-	73	125716887	SSA_2457	-	^{06 Asp tRNA}
1824392	1824464	-	73	125716887	SSA_2456	-	^{13 Val tRNA}
1824468	1824583	-	116	125716887	SSA_2410	-	5S ribosomal RNA
1824702	1827599	-	2898	125716887	SSA_2406	-	23S large subunit ribosomal RNA
1827726	1827798	-	73	125716887	SSA_2455	-	^{02 Ala tRNA}
1827860	1829410	-	1551	125716887	SSA_2402	-	16S small subunit ribosomal RNA
1930449	1930522	-	74	125716887	SSA_2454	-	^{07 Asn tRNA}
1930528	1930643	-	116	125716887	SSA_2411	-	5S ribosomal RNA
1930762	1933660	-	2899	125716887	SSA_2407	-	23S large subunit ribosomal RNA
1933787	1933859	-	73	125716887	SSA_2453	-	^{02 Ala tRNA}
1933921	1935471	-	1551	125716887	SSA_2403	-	16S small subunit ribosomal RNA
1982039	1982111	-	73	125716887	SSA_2452	-	^{12 Thr tRNA}
1990237	1990325	-	89	125716887	SSA_2451	-	^{15 Leu tRNA}
2127192	2127274	+	83	125716887	SSA_2446	-	^{15 Leu tRNA}
2183262	2183334	-	73	125716887	SSA_2500	-	component of signal recognition particle (SRP)
2204603	2204673	+	71	125716887	SSA_2447	-	^{19 Cys tRNA}
2383020	2383096	-	77	125716887	SSA_2450	-	^{07 Asn tRNA}
2383102	2383173	-	72	125716887	SSA_2449	-	^{04 Glu tRNA}
2385639	2385712	-	74	125716887	SSA_2448	-	^{11 Arg tRNA}