Геном прокариот/Материалы:NC 009442

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_009442            2096309 bp    DNA     circular BCT 25-JUN-2007
   DEFINITION  Streptococcus suis 05ZYH33, complete genome.
   ACCESSION   NC_009442
   VERSION     NC_009442.1  GI:146317663
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Streptococcus suis 05ZYH33
     ORGANISM  Streptococcus suis 05ZYH33
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Streptococcaceae;
               Streptococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2096309)
     AUTHORS   Chen,C., Tang,J., Dong,W., Wang,C., Feng,Y., Wang,J., Zheng,F.,
               Pan,X., Liu,D., Li,M., Song,Y., Zhu,X., Sun,H., Feng,T., Guo,Z.,
               Ju,A., Ge,J., Dong,Y., Sun,W., Jiang,Y., Wang,J., Yan,J., Yang,H.,
               Wang,X., Gao,G.F., Yang,R., Wang,J. and Yu,J.
     CONSRTM   BGI
     TITLE     A Glimpse of Streptococcal Toxic Shock Syndrome from Comparative
               Genomics of S. suis 2 Chinese Isolates
     JOURNAL   (er) PLoS ONE 2, E315 (2007)
      PUBMED   17375201
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2096309)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-MAY-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2096309)
     AUTHORS   Chen,C., Tang,J., Dong,W., Wang,J., Wang,C., Pan,X., Zheng,F.,
               Song,Y., Dong,Y., Zhu,X., Sun,H., Feng,T., Guo,Z., Ju,A., Ge,J.,
               Wang,J., Wang,X., Gao,G.F., Yang,H., Yang,R., Wang,J. and Yu,J.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (27-JUN-2006) Beijing Institute of Genomics, Chinese
               Academy of Sciences, Beijing 101300, China
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000407.
               Bacteria available from Ziyang, China, 2005.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
16970	18521	+	1552	146317663	SSU05_2255	-	16S ribosomal RNA
18573	18645	+	73	146317663	SSU05_2195	-	^{02 Ala tRNA}
18924	21828	+	2905	146317663	SSU05_2260	-	23S ribosomal RNA
21913	22031	+	119	146317663	SSU05_2254	-	5S ribosomal RNA
22036	22108	+	73	146317663	SSU05_2196	-	^{13 Val tRNA}
22111	22183	+	73	146317663	SSU05_2197	-	^{06 Asp tRNA}
22229	22301	+	73	146317663	SSU05_2198	-	^{10 Lys tRNA}
22305	22386	+	82	146317663	SSU05_2199	-	^{15 Leu tRNA}
22401	22473	+	73	146317663	SSU05_2200	-	^{12 Thr tRNA}
22486	22557	+	72	146317663	SSU05_2201	-	^{01 Gly tRNA}
22565	22648	+	84	146317663	SSU05_2202	-	^{15 Leu tRNA}
22667	22743	+	77	146317663	SSU05_2203	-	^{11 Arg tRNA}
22788	22861	+	74	146317663	SSU05_2204	-	^{03 Pro tRNA}
22874	22947	+	74	146317663	SSU05_2205	-	^{16 Met tRNA}
22964	23037	+	74	146317663	SSU05_2206	-	^{16 Met tRNA}
23044	23133	+	90	146317663	SSU05_2207	-	^{08 Ser tRNA}
23144	23217	+	74	146317663	SSU05_2208	-	^{16 Met tRNA}
23233	23305	+	73	146317663	SSU05_2209	-	^{17 Phe tRNA}
23337	23410	+	74	146317663	SSU05_2210	-	^{14 Ile tRNA}
23423	23510	+	88	146317663	SSU05_2211	-	^{08 Ser tRNA}
87759	89310	+	1552	146317663	SSU05_2256	-	16S ribosomal RNA
89362	89434	+	73	146317663	SSU05_2212	-	^{02 Ala tRNA}
89713	92618	+	2906	146317663	SSU05_2259	-	23S ribosomal RNA
92703	92820	+	118	146317663	SSU05_2251	-	5S ribosomal RNA
92825	92897	+	73	146317663	SSU05_2213	-	^{13 Val tRNA}
92903	92973	+	71	146317663	SSU05_2214	-	^{01 Gly tRNA}
93004	93077	+	74	146317663	SSU05_2215	-	^{14 Ile tRNA}
93084	93155	+	72	146317663	SSU05_2216	-	^{04 Glu tRNA}
93164	93253	+	90	146317663	SSU05_2217	-	^{08 Ser tRNA}
93263	93336	+	74	146317663	SSU05_2218	-	^{16 Met tRNA}
93352	93424	+	73	146317663	SSU05_2219	-	^{17 Phe tRNA}
93445	93525	+	81	146317663	SSU05_2220	-	^{18 Tyr tRNA}
93533	93603	+	71	146317663	SSU05_2221	-	^{20 Trp tRNA}
93611	93683	+	73	146317663	SSU05_2222	-	^{09 His tRNA}
93695	93766	+	72	146317663	SSU05_2223	-	^{05 Gln tRNA}
93778	93861	+	84	146317663	SSU05_2224	-	^{15 Leu tRNA}
324292	324377	+	86	146317663	SSU05_2225	-	^{15 Leu tRNA}
326694	328245	+	1552	146317663	SSU05_2257	-	16S ribosomal RNA
328297	328369	+	73	146317663	SSU05_2226	-	^{02 Ala tRNA}
328642	331545	+	2904	146317663	SSU05_2261	-	23S ribosomal RNA
331630	331747	+	118	146317663	SSU05_2253	-	5S ribosomal RNA
331751	331823	+	73	146317663	SSU05_2227	-	^{07 Asn tRNA}
331846	331917	+	72	146317663	SSU05_2228	-	^{04 Glu tRNA}
420741	422292	+	1552	146317663	SSU05_2258	-	16S ribosomal RNA
422344	422416	+	73	146317663	SSU05_2229	-	^{02 Ala tRNA}
422695	425597	+	2903	146317663	SSU05_2262	-	23S ribosomal RNA
425684	425801	+	118	146317663	SSU05_2252	-	5S ribosomal RNA
425806	425878	+	73	146317663	SSU05_2230	-	^{13 Val tRNA}
425881	425953	+	73	146317663	SSU05_2231	-	^{06 Asp tRNA}
425999	426071	+	73	146317663	SSU05_2232	-	^{10 Lys tRNA}
426075	426156	+	82	146317663	SSU05_2233	-	^{15 Leu tRNA}
426171	426243	+	73	146317663	SSU05_2234	-	^{12 Thr tRNA}
426256	426327	+	72	146317663	SSU05_2235	-	^{01 Gly tRNA}
426335	426418	+	84	146317663	SSU05_2236	-	^{15 Leu tRNA}
426437	426513	+	77	146317663	SSU05_2237	-	^{11 Arg tRNA}
426558	426631	+	74	146317663	SSU05_2238	-	^{03 Pro tRNA}
753760	753840	+	81	146317663	SSU05_2239	-	^{18 Tyr tRNA}
754116	754187	+	72	146317663	SSU05_2240	-	^{05 Gln tRNA}
755553	755627	+	75	146317663	SSU05_2241	-	^{11 Arg tRNA}
1355578	1355650	+	73	146317663	SSU05_2250	-	^{12 Thr tRNA}
1369015	1369102	+	88	146317663	SSU05_2249	-	^{08 Ser tRNA}
1468718	1468789	+	72	146317663	SSU05_2248	-	^{11 Arg tRNA}
1887018	1887088	+	71	146317663	SSU05_2242	-	^{19 Cys tRNA}
1904122	1904203	+	82	146317663	SSU05_2243	-	^{15 Leu tRNA}
2019703	2019775	+	73	146317663	SSU05_2244	-	^{10 Lys tRNA}
2092392	2092464	+	73	146317663	SSU05_2247	-	^{07 Asn tRNA}
2092470	2092541	+	72	146317663	SSU05_2246	-	^{04 Glu tRNA}
2092653	2092726	+	74	146317663	SSU05_2245	-	^{11 Arg tRNA}