Геном прокариот/Материалы:NC 009707

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 009707»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_009707            1845106 bp    DNA     circular BCT 05-SEP-2007
   DEFINITION  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome.
   ACCESSION   NC_009707
   VERSION     NC_009707.1  GI:153950938
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97
     ORGANISM  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97
               Bacteria; Proteobacteria; Epsilonproteobacteria; Campylobacterales;
               Campylobacteraceae; Campylobacter.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1845106)
     AUTHORS   Fouts,D.E., Mongodin,E.F., Puiu,D., Sebastian,Y., Miller,W.G.,
               Mandrell,R.E., Lastovica,A.J. and Nelson,K.E.
     TITLE     Complete Genome Sequence of Campylobacter jejuni subsp doylei
               269.97 isolated from human blood
     JOURNAL   Unpublished
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1845106)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (26-JUL-2007) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1845106)
     AUTHORS   Fouts,D.E., Mongodin,E.F., Puiu,D., Sebastian,Y., Miller,W.G.,
               Mandrell,R.E., Lastovica,A.J. and Nelson,K.E.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (12-JUL-2007) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Drive, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000768.
               This strain is available at ATCC BEIR.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
39388 40900 + 1513 153950938 JJD26997_0032 - 16S ribosomal RNA
41005 41080 + 76 153950938 JJD26997_0033 - 02 Ala tRNA
41089 41165 + 77 153950938 JJD26997_0034 - 14 Ile tRNA
43377 44564 + 1188 153950938 JJD26997_0040 - 23S ribosomal RNA
44656 44710 + 55 153950938 JJD26997_0040 - intervening sequence
44711 46421 + 1711 153950938 JJD26997_0040 - 23S ribosomal RNA
46701 46820 + 120 153950938 JJD26997_0041 - 5S ribosomal RNA
171341 171415 + 75 153950938 JJD26997_0182 - 04 Glu tRNA
267859 268217 + 359 153950938 JJD26997_0290 - 10Sa RNA (tmRNA)
297350 297677 + 328 153950938 JJD26997_0338 - 10Sa RNA (tmRNA)
303152 303241 + 90 153950938 JJD26997_0343 - 08 Ser tRNA
388949 389024 + 76 153950938 JJD26997_0442 - 17 Phe tRNA
389132 389208 - 77 153950938 JJD26997_0443 - 16 Met tRNA
449462 449536 + 75 153950938 JJD26997_0500 - 07 Asn tRNA
702387 702463 - 77 153950938 JJD26997_0777 - 11 Arg tRNA
777553 777638 - 86 153950938 JJD26997_0877 - 15 Leu tRNA
907961 908047 + 87 153950938 JJD26997_1032 - 15 Leu tRNA
908058 908132 + 75 153950938 JJD26997_1033 - 01 Gly tRNA
970958 971032 + 75 153950938 JJD26997_1099 - 05 Gln tRNA
971067 971142 + 76 153950938 JJD26997_1100 - 16 Met tRNA
1011214 1011290 - 77 153950938 JJD26997_1156 - 06 Asp tRNA
1011342 1011417 - 76 153950938 JJD26997_1157 - 13 Val tRNA
1011424 1011499 - 76 153950938 JJD26997_1158 - 11 Arg tRNA
1011520 1011595 - 76 153950938 JJD26997_1159 - 10 Lys tRNA
1011600 1011676 - 77 153950938 JJD26997_1160 - 06 Asp tRNA
1011729 1011804 - 76 153950938 JJD26997_1161 - 13 Val tRNA
1011812 1011887 - 76 153950938 JJD26997_1162 - 10 Lys tRNA
1107786 1107905 - 120 153950938 JJD26997_1263 - 5S ribosomal RNA
1108185 1109895 - 1711 153950938 JJD26997_1264 - 23S ribosomal RNA
1109896 1110080 - 185 153950938 JJD26997_1264 - intervening sequence
1110081 1111268 - 1188 153950938 JJD26997_1264 - 23S ribosomal RNA
1120506 1120582 - 77 153950938 JJD26997_1273 - 14 Ile tRNA
1120591 1120666 - 76 153950938 JJD26997_1274 - 02 Ala tRNA
1120771 1122283 - 1513 153950938 JJD26997_1275 - 16S ribosomal RNA
1278650 1278726 - 77 153950938 JJD26997_1441 - 11 Arg tRNA
1302737 1302812 - 76 153950938 JJD26997_1463 - 20 Trp tRNA
1304305 1304379 - 75 153950938 JJD26997_1466 - 12 Thr tRNA
1304486 1304562 - 77 153950938 JJD26997_1467 - 01 Gly tRNA
1304569 1304654 - 86 153950938 JJD26997_1468 - 18 Tyr tRNA
1304704 1304779 - 76 153950938 JJD26997_1469 - 12 Thr tRNA
1344267 1344386 - 120 153950938 JJD26997_1519 - 5S ribosomal RNA
1344666 1346376 - 1711 153950938 JJD26997_1520 - 23S ribosomal RNA
1346377 1346561 - 185 153950938 JJD26997_1520 - intervening sequence
1346562 1347749 - 1188 153950938 JJD26997_1520 - 23S ribosomal RNA
1348308 1348384 - 77 153950938 JJD26997_1522 - 14 Ile tRNA
1348393 1348468 - 76 153950938 JJD26997_1523 - 02 Ala tRNA
1348573 1350085 - 1513 153950938 JJD26997_1524 - 16S ribosomal RNA
1625778 1625875 - 98 153950938 JJD26997_1847 - Sec tRNA
1746222 1746296 + 75 153950938 JJD26997_1978 - 01 Gly tRNA
1746306 1746394 + 89 153950938 JJD26997_1979 - 15 Leu tRNA
1746413 1746486 + 74 153950938 JJD26997_1980 - 19 Cys tRNA
1746508 1746595 + 88 153950938 JJD26997_1981 - 08 Ser tRNA
1790814 1790898 - 85 153950938 JJD26997_2038 - 15 Leu tRNA
1790903 1790979 - 77 153950938 JJD26997_2039 - 11 Arg tRNA
1790993 1791069 - 77 153950938 JJD26997_2040 - 11 Arg tRNA
1791074 1791150 - 77 153950938 JJD26997_2041 - 09 His tRNA
1791175 1791252 - 78 153950938 JJD26997_2042 - 03 Pro tRNA
1830408 1830484 - 77 153950938 JJD26997_2088 - 16 Met tRNA
1830620 1830707 + 88 153950938 JJD26997_2089 - 08 Ser tRNA
1830754 1830829 + 76 153950938 JJD26997_2090 - 02 Ala tRNA
1830833 1830908 + 76 153950938 JJD26997_2091 - 13 Val tRNA