Материалы:NC 003902

Материал из Викиверситет
Перейти к: навигация, поиск
Fairytale up blue.png
Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_003902            5076188 bp    DNA     circular BCT 02-DEC-2005
   DEFINITION  Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913, complete
               genome.
   ACCESSION   NC_003902
   VERSION     NC_003902.1  GI:21229478
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913
     ORGANISM  Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xanthomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 5076188)
     AUTHORS   da Silva,A.C.R., Ferro,J.A., Reinach,F.C., Farah,C.S., Furlan,L.R.,
               Quaggio,R.B., Monteiro-Vitorello,C.B., Van Sluys,M.A., Almeida,N.F.
               Jr., Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Bertolini,M.C., Camargo,L.E.A.,
               Camarotte,G., Cannavan,F., Cardozo,J., Chambergo,F., Ciapina,L.P.,
               Cicarelli,R.M.B., Coutinho,L.L., Cursino-Santos,J.R., El-Dorry,H.,
               Faria,J.B., Ferreira,A.J.S., Ferreira,R.C.C., Ferro,M.I.T.,
               Formighieri,E.F., Franco,M.C., Greggio,C.C., Gruber,A.,
               Katsuyama,A.M., Kishi,L.T., Leite,R.P. Jr., Lemos,E.G.M.,
               Lemos,M.V.F., Locali,E.C., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Martinez-Rossi,N.M., Martins,E.C., Meidanis,J., Menck,C.F.M.,
               Miyaki,C.Y., Moon,D.H., Moreira,L.M., Novo,M.T.M., Okura,V.K.,
               Oliveira,M.C., Oliveira,V.R., Pereira,H.A. Jr., Rossi,A.,
               Sena,J.A.D., Silva,C., de Souza,R.F., Spinola,L.A.F., Takita,M.A.,
               Tamura,R.E., Teixeira,E.C., Tezza,R.I.D., Trindade dos Santos,M.,
               Truffi,D., Tsai,S.M., White,F.F., Setubal,J.C. and Kitajima,J.P.
     TITLE     Comparison of the genomes of two Xanthomonas pathogens with
               differing host specificities
     JOURNAL   Nature 417 (6887), 459-463 (2002)
      PUBMED   12024217
   REFERENCE   2  (bases 1 to 5076188)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 5076188)
     AUTHORS   da Silva,A.C.R., Ferro,J.A., Reinach,F.C., Farah,C.S., Furlan,L.R.,
               Quaggio,R.B., Monteiro-Vitorello,C.B., Van Sluys,M.A., Almeida,N.F.
               Jr., Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Bertolini,M.C., Camargo,L.E.A.,
               Camarotte,G., Cannavan,F., Cardozo,J., Chambergo,F., Ciapina,L.P.,
               Cicarelli,R.M.B., Coutinho,L.L., Cursino-Santos,J.R., El-Dorry,H.,
               Faria,J.B., Ferreira,A.J.S., Ferreira,R.C.C., Ferro,M.I.T.,
               Formighieri,E.F., Franco,M.C., Greggio,C.C., Gruber,A.,
               Katsuyama,A.M., Kishi,L.T., Leite,R.P. Jr., Lemos,E.G.M.,
               Lemos,M.V.F., Locali,E.C., Machado,M.A., Madeira,A.M.B.N.,
               Martinez-Rossi,N.M., Martins,E.C., Meidanis,J., Menck,C.F.M.,
               Miyaki,C.Y., Moon,D.H., Moreira,L.M., Novo,M.T.M., Okura,V.K.,
               Oliveira,M.C., Oliveira,V.R., Pereira,H.A. Jr., Rossi,A.,
               Sena,J.A.D., Silva,C., de Souza,R.F., Spinola,L.A.F., Takita,M.A.,
               Tamura,R.E., Teixeira,E.C., Tezza,R.I.D., Trindade dos Santos,M.,
               Truffi,D., Tsai,S.M., White,F.F., Setubal,J.C. and Kitajima,J.P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-NOV-2001) Departmento de Bioquimica, Universidade de
               Sao Paulo, Av. Prof. Lineu Prestes 748, Sao Paulo, SP 05508-900,
               Brazil
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE008922.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
465184 465260 + 77 21229478 XCC0391 - 11 Arg tRNA
578524 578598 - 75 21229478 XCC0478 - 05 Gln tRNA
578653 578729 - 77 21229478 XCC0479 - 16 Met tRNA
857932 858273 + 342 21229478 XCC0713 - RNA subunit of RNase P
1032341 1032417 + 77 21229478 XCC0872 - 05 Gln tRNA
1036251 1036336 + 86 21229478 XCC0877 - 18 Tyr tRNA
1036366 1036439 + 74 21229478 XCC0878 - 01 Gly tRNA
1036473 1036548 + 76 21229478 XCC0879 - 12 Thr tRNA
1037892 1037967 + 76 21229478 XCC0881 - 20 Trp tRNA
1127932 1128008 + 77 21229478 XCC0969 - 03 Pro tRNA
1128052 1128128 + 77 21229478 XCC0970 - 11 Arg tRNA
1128160 1128236 + 77 21229478 XCC0971 - 09 His tRNA
1128320 1128395 + 76 21229478 XCC0972 - 10 Lys tRNA
1128473 1128557 + 85 21229478 XCC0973 - 15 Leu tRNA
1135299 1135373 + 75 21229478 XCC0979 - 13 Val tRNA
1135403 1135479 + 77 21229478 XCC0980 - 06 Asp tRNA
1135576 1135652 + 77 21229478 XCC0981 - 06 Asp tRNA
1144017 1144107 + 91 21229478 XCC0990 - 08 Ser tRNA
1150246 1150338 + 93 21229478 XCC1000 - 08 Ser tRNA
1174192 1174266 + 75 21229478 XCC1025 - 13 Val tRNA
1348086 1348161 + 76 21229478 XCC1158 - 12 Thr tRNA
1634901 1634987 - 87 21229478 XCC1403 - 15 Leu tRNA
1710901 1711297 - 397 21229478 XCC1464 - tmRNA
1774607 1774693 - 87 21229478 XCC1516 - 15 Leu tRNA
1865175 1865264 + 90 21229478 XCC1596 - 08 Ser tRNA
2004902 2004994 + 93 21229478 XCC1726 - 08 Ser tRNA
2011766 2011842 - 77 21229478 XCC1732 - 11 Arg tRNA
2011939 2012015 - 77 21229478 XCC1733 - 11 Arg tRNA
2052260 2052334 - 75 21229478 XCC1765 - 04 Glu tRNA
2081567 2081643 + 77 21229478 XCC1792 - 11 Arg tRNA
2463969 2464052 + 84 21229478 XCC2091 - 15 Leu tRNA
2496862 2496937 - 76 21229478 XCC2111 - 01 Gly tRNA
2497018 2497091 - 74 21229478 XCC2112 - 19 Cys tRNA
2497161 2497236 - 76 21229478 XCC2113 - 01 Gly tRNA
2536273 2536348 + 76 21229478 XCC2146 - 02 Ala tRNA
2536396 2536471 + 76 21229478 XCC2147 - 04 Glu tRNA
2537225 2537300 + 76 21229478 XCC2148 - 02 Ala tRNA
2537354 2537429 + 76 21229478 XCC2149 - 04 Glu tRNA
2538171 2538257 - 87 21229478 XCC2151 - 15 Leu tRNA
2632817 2632893 + 77 21229478 XCC2235 - 03 Pro tRNA
2716155 2716230 + 76 21229478 XCC2310 - 02 Ala tRNA
2888681 2888756 - 76 21229478 XCC2429 - 17 Phe tRNA
2917971 2918047 - 77 21229478 XCC2455 - 03 Pro tRNA
2954810 2954884 - 75 21229478 XCC2484 - 13 Val tRNA
2957737 2957813 - 77 21229478 XCC2487 - 07 Asn tRNA
2988109 2988185 - 77 21229478 XCC2514 - 16 Met tRNA
3003340 3003424 - 85 21229478 XCC2529 - 15 Leu tRNA
3560344 3560419 - 76 21229478 XCC3013 - 10 Lys tRNA
3728582 3728655 - 74 21229478 XCC3147 - 01 Gly tRNA
4441155 4441230 - 76 21229478 XCC3734 - 16 Met tRNA
4557675 4557793 - 119 21229478 XCC3836 - SSU 5S ribosomal RNA
4557919 4560801 - 2883 21229478 XCC3837 - SSU 23S ribosomal RNA
4561029 4561105 - 77 21229478 XCC3838 - 14 Ile tRNA
4561125 4561200 - 76 21229478 XCC3839 - 02 Ala tRNA
4561295 4562841 - 1547 21229478 XCC3840 - SSU 16S ribosomal RNA
4663776 4663851 - 76 21229478 XCC3935 - 12 Thr tRNA
4945543 4945661 - 119 21229478 XCC4148 - SSU 5S ribosomal RNA
4945787 4948669 - 2883 21229478 XCC4149 - SSU 23S ribosomal RNA
4948897 4948973 - 77 21229478 XCC4150 - 14 Ile tRNA
4948993 4949068 - 76 21229478 XCC4151 - 02 Ala tRNA
4949163 4950709 - 1547 21229478 XCC4152 - SSU 16S ribosomal RNA