FoldIt Wiki/Аминокислоты

Материал из Викиверситета

Обзор[править]

Альфа-аминокислоты являются "строительными блоками" белков. Они образуются при реакции конденсации, в которой высвобождается вода и новый "аминокислотный остаток". Аминокислотные остатки удерживается вместе в составе белка благодаря пептидной связи. Белки определяются своей уникальной последовательностью аминокислотных остатков; эта последовательность является первичной структурой белка. Также, как буквы алфавита могут быть скомбинированы в почти бесконечное многообразие слов, аминокислоты могут быть объединены в различные последовательности, формируя огромное число белков.

Клетками при биосинтезе белков используются двадцать стандартных аминокислот, и их использование определяется общим генетическим кодом. Эти 20 аминокислот биологически синтезируются из других молекул, однако организмы различаются тем, какие из аминокислот они могут синтезировать сами и тем, какие из них должны присутствовать в питании. Аминокислоты, которые должны поступать с питанием, называют "незаменимыми".

Аминокислоты также являются основными единицами в игре Foldit. В структуре белка каждая аминокислота привносит в основную цепь одно звено и (обычно) одну боковую цепь у этого звена. Основная цепь определяет главные структурные особенности белка, а боковые цепи - особенности её биологической функции.

Ниже приведен список аминокислот, которые можно встретить в игре Foldit. Возможно, также использовались или будут использоваться некоторые другие, но перечисленные - самые распространённые.

Аминокислота 3х-буквенное сокращение 1-буквенное сокращение Полярность боковой цепи Кислотность/основность боковой цепи у нейтральных видов Гидрофобность
аланин Ala A неполярная нейтральная 1,8
аргинин Arg R полярная основная (сильная) -4,5
аспарагин Asn N полярная нейтральная -3,5
аспарагиновая кислота Asp D полярная кислотная -3,5
цистеин Cys C полярная нейтральная 2,5
глутаминовая кислота Glu E полярная кислотная -3,5
глутамин Gln Q полярная нейтральная -3,5
глицин Gly G неполярная нейтральная -0,4
гистидин His H полярная основная (слабая) -3,2
изолейцин Ile I неполярная нейтральная 4,5
лейцин Leu L неполярная нейтральная 3,8
лизин Lys K полярная основная -3,9
метионин Met M неполярная нейтральная 1,9
фенилаланин Phe F неполярная нейтральная 2,8
пролин Pro P неполярная нейтральная -1,6
серин Ser S полярная нейтральная -0,8
треонин Thr T полярная нейтральная -0,7
триптофан Trp W неполярная нейтральная -0,9
тирозин Tyr Y полярная нейтральная -1,3
валин Val V неполярная нейтральная 4,2