Геном прокариот/Материалы:NC 008095

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008095»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008095            9139763 bp    DNA     circular BCT 26-JAN-2007
   DEFINITION  Myxococcus xanthus DK 1622, complete genome.
   ACCESSION   NC_008095
   VERSION     NC_008095.1  GI:108756767
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Myxococcus xanthus DK 1622
     ORGANISM  Myxococcus xanthus DK 1622
               Bacteria; Proteobacteria; Deltaproteobacteria; Myxococcales;
               Cystobacterineae; Myxococcaceae; Myxococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 9139763)
     AUTHORS   Goldman,B.S., Nierman,W.C., Kaiser,D., Slater,S.C., Durkin,A.S.,
               Eisen,J.A., Ronning,C.M., Barbazuk,W.B., Blanchard,M., Field,C.,
               Halling,C., Hinkle,G., Iartchuk,O., Kim,H.S., Mackenzie,C.,
               Madupu,R., Miller,N., Shvartsbeyn,A., Sullivan,S.A., Vaudin,M.,
               Wiegand,R. and Kaplan,H.B.
     TITLE     Evolution of sensory complexity recorded in a myxobacterial genome
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (41), 15200-15205 (2006)
      PUBMED   17015832
     REMARK    Erratum:[Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Dec 19;103(51):19605.
               Eisen, J [corrected to Eisen, J A]]
   REFERENCE   2  (bases 1 to 9139763)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (09-JUN-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 9139763)
     AUTHORS   Nierman,W.C.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (29-AUG-2005) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000113.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
335354 335427 + 74 108756767 MXAN_0281 - 05 Gln tRNA
376441 377980 + 1540 108756767 MXAN_0319 - 16S ribosomal RNA
378191 378267 + 77 108756767 MXAN_0320 - 14 Ile tRNA
378338 378410 + 73 108756767 MXAN_0321 - 02 Ala tRNA
378685 381657 + 2973 108756767 MXAN_0322 - 23S ribosomal RNA
381811 381926 + 116 108756767 MXAN_0323 - 5S ribosomal RNA
445878 445949 + 72 108756767 MXAN_0381 - 01 Gly tRNA
445987 446060 + 74 108756767 MXAN_0382 - 15 Leu tRNA
450580 450652 + 73 108756767 MXAN_0388 - 11 Arg tRNA
485283 485351 - 69 108756767 MXAN_0424 - Xaa tRNA
895384 895456 + 73 108756767 MXAN_0786 - 17 Phe tRNA
1752416 1752489 - 74 108756767 MXAN_1487 - Xaa tRNA
1752500 1752570 - 71 108756767 MXAN_1488 - 02 Ala tRNA
1752798 1752868 - 71 108756767 MXAN_1489 - 16 Met tRNA
1752945 1753015 - 71 108756767 MXAN_1490 - 14 Ile tRNA
1753060 1753145 - 86 108756767 MXAN_1491 - 18 Tyr tRNA
2238796 2238868 - 73 108756767 MXAN_1908 - 07 Asn tRNA
2270279 2270365 - 87 108756767 MXAN_1935 - 08 Ser tRNA
2270378 2270464 - 87 108756767 MXAN_1936 - 08 Ser tRNA
2270955 2271031 - 77 108756767 MXAN_1938 - 11 Arg tRNA
2271061 2271150 - 90 108756767 MXAN_1939 - 08 Ser tRNA
2271195 2271281 - 87 108756767 MXAN_1940 - 08 Ser tRNA
2338138 2338211 + 74 108756767 MXAN_2006 - 03 Pro tRNA
2338248 2338324 + 77 108756767 MXAN_2007 - 11 Arg tRNA
2338421 2338494 + 74 108756767 MXAN_2008 - 09 His tRNA
2338518 2338591 + 74 108756767 MXAN_2009 - 11 Arg tRNA
2340154 2340226 + 73 108756767 MXAN_2011 - 10 Lys tRNA
2340331 2340412 + 82 108756767 MXAN_2012 - 15 Leu tRNA
2426740 2427103 + 364 108756767 MXAN_2093 - sRNA
3120731 3120802 - 72 108756767 MXAN_2672 - 04 Glu tRNA
3120932 3121002 - 71 108756767 MXAN_2673 - 05 Gln tRNA
3290739 3290820 + 82 108756767 MXAN_2819 - 15 Leu tRNA
3293005 3294544 + 1540 108756767 MXAN_2823 - 16S ribosomal RNA
3294755 3294831 + 77 108756767 MXAN_2824 - 14 Ile tRNA
3295154 3298126 + 2973 108756767 MXAN_2825 - 23S ribosomal RNA
3298279 3298394 + 116 108756767 MXAN_2826 - 5S ribosomal RNA
3576940 3577014 - 75 108756767 MXAN_3047 - 19 Cys tRNA
3593089 3593161 + 73 108756767 MXAN_3064 - 12 Thr tRNA
3593218 3593301 + 84 108756767 MXAN_3065 - 18 Tyr tRNA
3593312 3593387 + 76 108756767 MXAN_3066 - 01 Gly tRNA
3593413 3593488 + 76 108756767 MXAN_3067 - 12 Thr tRNA
3594986 3595061 + 76 108756767 MXAN_3070 - 20 Trp tRNA
3732282 3732354 - 73 108756767 MXAN_3184 - 04 Glu tRNA
3732378 3732450 - 73 108756767 MXAN_3185 - 10 Lys tRNA
4057336 4057407 + 72 108756767 MXAN_3477 - 13 Val tRNA
4073655 4073728 - 74 108756767 MXAN_3494 - 11 Arg tRNA
4145876 4145949 + 74 108756767 MXAN_3560 - 16 Met tRNA
4146017 4146090 + 74 108756767 MXAN_3561 - 16 Met tRNA
4146126 4146199 + 74 108756767 MXAN_3562 - 16 Met tRNA
4186027 4186101 + 75 108756767 MXAN_3590 - 13 Val tRNA
4193176 4193252 + 77 108756767 MXAN_3597 - 03 Pro tRNA
4453851 4453939 + 89 108756767 MXAN_3737 - 15 Leu tRNA
4456617 4456689 + 73 108756767 MXAN_3741 - 02 Ala tRNA
4456770 4456842 + 73 108756767 MXAN_3742 - 02 Ala tRNA
5324820 5324894 - 75 108756767 MXAN_4326 - 12 Thr tRNA
5443601 5443674 + 74 108756767 MXAN_4408 - 16 Met tRNA
5535546 5535644 + 99 108756767 MXAN_4472 - Sec tRNA
5807442 5807516 - 75 108756767 MXAN_4624 - 01 Gly tRNA
5807568 5807642 - 75 108756767 MXAN_4625 - 01 Gly tRNA
5893187 5893302 - 116 108756767 MXAN_4701 - 5S ribosomal RNA
5893456 5896428 - 2973 108756767 MXAN_4702 - 23S ribosomal RNA
5896751 5896827 - 77 108756767 MXAN_4703 - 14 Ile tRNA
5897038 5898577 - 1540 108756767 MXAN_4704 - 16S ribosomal RNA
5996573 5996646 - 74 108756767 MXAN_4797 - 11 Arg tRNA
6072179 6072264 - 86 108756767 MXAN_4853 - 15 Leu tRNA
6147430 6147502 + 73 108756767 MXAN_4913 - 01 Gly tRNA
6257408 6257494 + 87 108756767 MXAN_5007 - 15 Leu tRNA
6500477 6500549 + 73 108756767 MXAN_5206 - 16 Met tRNA
6624027 6624102 + 76 108756767 MXAN_5320 - 02 Ala tRNA
6703858 6703929 + 72 108756767 MXAN_5381 - 13 Val tRNA
6703945 6704021 + 77 108756767 MXAN_5382 - 06 Asp tRNA
6704111 6704187 + 77 108756767 MXAN_5383 - 06 Asp tRNA
7099831 7100165 + 335 108756767 MXAN_5732 - sRNA
7771863 7771939 - 77 108756767 MXAN_6295 - 03 Pro tRNA
8961234 8961349 - 116 108756767 MXAN_7341 - 5S ribosomal RNA
8961502 8964474 - 2973 108756767 MXAN_7342 - 23S ribosomal RNA
8964749 8964821 - 73 108756767 MXAN_7343 - 02 Ala tRNA
8964892 8964968 - 77 108756767 MXAN_7344 - 14 Ile tRNA
8965179 8966718 - 1540 108756767 MXAN_7345 - 16S ribosomal RNA