Геном прокариот/Материалы:NC 008209

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008209            4133097 bp    DNA     circular BCT 23-JAN-2007
   DEFINITION  Roseobacter denitrificans OCh 114, complete genome.
   ACCESSION   NC_008209
   VERSION     NC_008209.1  GI:110677421
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Roseobacter denitrificans OCh 114
     ORGANISM  Roseobacter denitrificans OCh 114
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales;
               Rhodobacteraceae; Roseobacter.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4133097)
     AUTHORS   Swingley,W.D., Sadekar,S., Mastrian,S.D., Matthies,H.J., Hao,J.,
               Ramos,H., Acharya,C.R., Conrad,A.L., Taylor,H.L., Dejesa,L.C.,
               Shah,M.K., O'huallachain,M.E., Lince,M.T., Blankenship,R.E.,
               Beatty,J.T. and Touchman,J.W.
     TITLE     The Complete Genome Sequence of Roseobacter denitrificans Reveals a
               Mixotrophic Rather than Photosynthetic Metabolism
     JOURNAL   J. Bacteriol. 189 (3), 683-690 (2007)
      PUBMED   17098896
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4133097)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-JUL-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4133097)
     AUTHORS   Touchman,J.W.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (13-APR-2006) DNA Sequencing Center, Translational
               Genomics Research Institute, 445 N. Fifth Street, Phoenix, AZ
               85004, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000362.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
67695	67780	+	86	110677421	RD1_0066	-	^{15 Leu tRNA}
233441	233517	+	77	110677421	RD1_0233	-	^{11 Arg tRNA}
692586	692660	-	75	110677421	RD1_0717	-	^{13 Val tRNA}
703242	704651	+	1410	110677421	RD1_0727	-	16S ribosomal RNA
704917	704993	+	77	110677421	RD1_0728	-	^{14 Ile tRNA}
705012	705087	+	76	110677421	RD1_0729	-	^{02 Ala tRNA}
705536	708377	+	2842	110677421	RD1_0730	-	23S ribosomal RNA
708456	708572	+	117	110677421	RD1_0731	-	5S ribosomal RNA
795609	795684	-	76	110677421	RD1_0812	-	^{10 Lys tRNA}
959492	959567	-	76	110677421	RD1_0994	-	^{02 Ala tRNA}
1024785	1024859	-	75	110677421	RD1_1063	-	^{12 Thr tRNA}
1111279	1111355	-	77	110677421	RD1_1148	-	^{16 Met tRNA}
1217959	1218036	+	78	110677421	RD1_1257	-	^{11 Arg tRNA}
1247945	1248021	+	77	110677421	RD1_1285	-	^{16 Met tRNA}
1390831	1390907	+	77	110677421	RD1_1466	-	^{11 Arg tRNA}
1734852	1734928	+	77	110677421	RD1_1810	-	^{09 His tRNA}
1769281	1769355	+	75	110677421	RD1_1844	-	^{17 Phe tRNA}
1775819	1775892	-	74	110677421	RD1_1853	-	^{19 Cys tRNA}
1882719	1882804	+	86	110677421	RD1_1971	-	^{15 Leu tRNA}
1883048	1883121	+	74	110677421	RD1_1972	-	^{01 Gly tRNA}
2130499	2130574	+	76	110677421	RD1_2227	-	^{12 Thr tRNA}
2152866	2152940	-	75	110677421	RD1_2248	-	^{07 Asn tRNA}
2155368	2155444	-	77	110677421	RD1_2251	-	^{16 Met tRNA}
2177977	2178281	-	305	110677421	RD1_2280	-	sRNA
2197740	2197829	+	90	110677421	RD1_2301	-	^{08 Ser tRNA}
2397660	2397745	+	86	110677421	RD1_2512	-	^{15 Leu tRNA}
2424815	2424889	-	75	110677421	RD1_2535	-	^{04 Glu tRNA}
2461587	2461671	+	85	110677421	RD1_2574	-	^{15 Leu tRNA}
2544628	2544717	+	90	110677421	RD1_2669	-	^{08 Ser tRNA}
2563457	2563533	-	77	110677421	RD1_2688	-	^{11 Arg tRNA}
2590107	2590180	+	74	110677421	RD1_2717	-	^{01 Gly tRNA}
2658080	2658165	-	86	110677421	RD1_2788	-	^{15 Leu tRNA}
2702190	2702266	-	77	110677421	RD1_2830	-	^{06 Asp tRNA}
2704565	2704640	-	76	110677421	RD1_2833	-	^{13 Val tRNA}
2943042	2943131	+	90	110677421	RD1_3068	-	^{08 Ser tRNA}
3032080	3032156	+	77	110677421	RD1_3159	-	^{03 Pro tRNA}
3062015	3062091	-	77	110677421	RD1_3195	-	^{03 Pro tRNA}
3246291	3246365	+	75	110677421	RD1_3378	-	^{01 Gly tRNA}
3306627	3306701	+	75	110677421	RD1_3440	-	^{05 Gln tRNA}
3334175	3334264	-	90	110677421	RD1_3463	-	^{08 Ser tRNA}
3427558	3427641	+	84	110677421	RD1_3566	-	Xaa tRNA
3865309	3865384	-	76	110677421	RD1_4010	-	^{20 Trp tRNA}