Геном прокариот/Материалы:NC 008262

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008262»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008262            2897393 bp    DNA     circular BCT 14-AUG-2007
   DEFINITION  Clostridium perfringens SM101, complete genome.
   ACCESSION   NC_008262
   VERSION     NC_008262.1  GI:110801439
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Clostridium perfringens SM101
     ORGANISM  Clostridium perfringens SM101
               Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae;
               Clostridium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2897393)
     AUTHORS   Myers,G.S., Rasko,D.A., Cheung,J.K., Ravel,J., Seshadri,R.,
               DeBoy,R.T., Ren,Q., Varga,J., Awad,M.M., Brinkac,L.M.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Dodson,R.J., Madupu,R., Nelson,W.C.,
               Rosovitz,M.J., Sullivan,S.A., Khouri,H., Dimitrov,G.I.,
               Watkins,K.L., Mulligan,S., Benton,J., Radune,D., Fisher,D.J.,
               Atkins,H.S., Hiscox,T., Jost,B.H., Billington,S.J., Songer,J.G.,
               McClane,B.A., Titball,R.W., Rood,J.I., Melville,S.B. and
               Paulsen,I.T.
     TITLE     Skewed genomic variability in strains of the toxigenic bacterial
               pathogen, Clostridium perfringens
     JOURNAL   Genome Res. 16 (8), 1031-1040 (2006)
      PUBMED   16825665
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2897393)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-JUL-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2897393)
     AUTHORS   Myers,G.S., Rasko,D.A., Cheung,J.K., Ravel,J., Seshadri,R.,
               DeBoy,R.T., Ren,Q., Varga,J., Awad,M.M., Brinkac,L.M.,
               Daugherty,S.C., Haft,D.H., Dodson,R.J., Madupu,R., Nelson,W.C.,
               Rosovitz,M., Sullivan,S.A., Khouri,H.M., Dimitrov,G., Watkins,K.L.,
               Mulligan,S., Benton,J.L., Fisher,D.J., Atkins,H.S., Hiscox,T.,
               Jost,H., Billington,S.J., Songer,J.G., McClane,B.A., Titball,R.W.,
               Rood,J.I., Melville,S. and Paulsen,I.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-APR-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000312.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
9990 11511 + 1522 110801439 CPR_r01 - 16S ribosomal RNA
11692 14599 + 2908 110801439 CPR_r02 - 23S ribosomal RNA
14691 14818 + 128 110801439 CPR_r03 - 5S ribosomal RNA
14815 14891 + 77 110801439 CPR_0008 - 16 Met tRNA
14898 14973 + 76 110801439 CPR_0009 - 02 Ala tRNA
23343 23433 + 91 110801439 CPR_0016 - 08 Ser tRNA
23467 23557 + 91 110801439 CPR_0017 - 08 Ser tRNA
24189 24279 + 91 110801439 CPR_0019 - 08 Ser tRNA
24285 24375 + 91 110801439 CPR_0020 - 08 Ser tRNA
39655 39731 + 77 110801439 CPR_0031 - 11 Arg tRNA
42904 42978 + 75 110801439 CPR_0035 - 11 Arg tRNA
54005 54094 + 90 110801439 CPR_0047 - 08 Ser tRNA
75565 77086 + 1522 110801439 CPR_r04 - 16S ribosomal RNA
77267 80174 + 2908 110801439 CPR_r05 - 23S ribosomal RNA
80289 80415 + 127 110801439 CPR_r06 - 5S ribosomal RNA
80412 80487 + 76 110801439 CPR_0071 - 10 Lys tRNA
85852 87373 + 1522 110801439 CPR_r07 - 16S ribosomal RNA
87554 90461 + 2908 110801439 CPR_r08 - 23S ribosomal RNA
90552 90679 + 128 110801439 CPR_r09 - 5S ribosomal RNA
90676 90752 + 77 110801439 CPR_0077 - 16 Met tRNA
90758 90833 + 76 110801439 CPR_0078 - 02 Ala tRNA
107888 109409 + 1522 110801439 CPR_r10 - 16S ribosomal RNA
109590 112497 + 2908 110801439 CPR_r11 - 23S ribosomal RNA
112546 112672 + 127 110801439 CPR_r12 - 5S ribosomal RNA
112669 112744 + 76 110801439 CPR_0090 - 10 Lys tRNA
117671 119192 + 1522 110801439 CPR_r13 - 16S ribosomal RNA
119373 122280 + 2908 110801439 CPR_r14 - 23S ribosomal RNA
122330 122456 + 127 110801439 CPR_r15 - 5S ribosomal RNA
122457 122531 + 75 110801439 CPR_0095 - 07 Asn tRNA
233318 234839 + 1522 110801439 CPR_r16 - 16S ribosomal RNA
235020 237927 + 2908 110801439 CPR_r17 - 23S ribosomal RNA
238042 238168 + 127 110801439 CPR_r18 - 5S ribosomal RNA
238171 238246 + 76 110801439 CPR_0191 - 17 Phe tRNA
282349 282424 - 76 110801439 CPR_0228 - 16 Met tRNA
304835 306356 + 1522 110801439 CPR_r19 - 16S ribosomal RNA
306537 309444 + 2908 110801439 CPR_r20 - 23S ribosomal RNA
309494 309620 + 127 110801439 CPR_r21 - 5S ribosomal RNA
309623 309698 + 76 110801439 CPR_0250 - 17 Phe tRNA
323069 323144 - 76 110801439 CPR_0263 - 03 Pro tRNA
562274 562349 + 76 110801439 CPR_0473 - 16 Met tRNA
661048 662569 + 1522 110801439 CPR_r22 - 16S ribosomal RNA
662750 665657 + 2908 110801439 CPR_r23 - 23S ribosomal RNA
665772 665898 + 127 110801439 CPR_r24 - 5S ribosomal RNA
665896 665970 + 75 110801439 CPR_0559 - 04 Glu tRNA
799831 799919 - 89 110801439 CPR_0677 - 15 Leu tRNA
1544138 1544224 - 87 110801439 CPR_1372 - 15 Leu tRNA
2025512 2025602 + 91 110801439 CPR_1834 - Sec tRNA
2063530 2063604 - 75 110801439 CPR_1864 - 19 Cys tRNA
2063610 2063683 - 74 110801439 CPR_1865 - 01 Gly tRNA
2063687 2063761 - 75 110801439 CPR_1866 - 01 Gly tRNA
2063767 2063842 - 76 110801439 CPR_1867 - 17 Phe tRNA
2163759 2163844 - 86 110801439 CPR_1958 - 15 Leu tRNA
2360915 2360990 - 76 110801439 CPR_2129 - 20 Trp tRNA
2361019 2361094 - 76 110801439 CPR_2130 - 20 Trp tRNA
2380748 2380833 - 86 110801439 CPR_2146 - 18 Tyr tRNA
2380839 2380914 - 76 110801439 CPR_2147 - 12 Thr tRNA
2380940 2381025 - 86 110801439 CPR_2148 - 18 Tyr tRNA
2381031 2381106 - 76 110801439 CPR_2149 - 12 Thr tRNA
2381125 2381200 - 76 110801439 CPR_2150 - 13 Val tRNA
2381205 2381290 - 86 110801439 CPR_2151 - 18 Tyr tRNA
2381296 2381371 - 76 110801439 CPR_2152 - 12 Thr tRNA
2441882 2441956 - 75 110801439 CPR_2211 - 07 Asn tRNA
2442008 2444914 - 2907 110801439 CPR_r25 - 23S ribosomal RNA
2445015 2445091 - 77 110801439 CPR_2212 - 14 Ile tRNA
2445097 2445172 - 76 110801439 CPR_2213 - 02 Ala tRNA
2445329 2446850 - 1522 110801439 CPR_r26 - 16S ribosomal RNA
2450271 2450347 - 77 110801439 CPR_2217 - 11 Arg tRNA
2450396 2450469 - 74 110801439 CPR_2218 - 01 Gly tRNA
2450473 2450547 - 75 110801439 CPR_2219 - 01 Gly tRNA
2450571 2450654 - 84 110801439 CPR_2220 - 15 Leu tRNA
2450665 2450740 - 76 110801439 CPR_2221 - 10 Lys tRNA
2450748 2450822 - 75 110801439 CPR_2222 - 05 Gln tRNA
2450828 2450903 - 76 110801439 CPR_2223 - 09 His tRNA
2450908 2450984 - 77 110801439 CPR_2224 - 11 Arg tRNA
2451020 2451093 - 74 110801439 CPR_2225 - 01 Gly tRNA
2451098 2451173 - 76 110801439 CPR_2226 - 03 Pro tRNA
2451179 2451255 - 77 110801439 CPR_2227 - 11 Arg tRNA
2451331 2451404 - 74 110801439 CPR_2228 - 01 Gly tRNA
2451409 2451483 - 75 110801439 CPR_2229 - 01 Gly tRNA
2451507 2451590 - 84 110801439 CPR_2230 - 15 Leu tRNA
2451601 2451676 - 76 110801439 CPR_2231 - 10 Lys tRNA
2451696 2451771 - 76 110801439 CPR_2232 - 10 Lys tRNA
2451778 2451852 - 75 110801439 CPR_2233 - 05 Gln tRNA
2451856 2451931 - 76 110801439 CPR_2234 - 09 His tRNA
2451936 2452012 - 77 110801439 CPR_2235 - 11 Arg tRNA
2452092 2452166 - 75 110801439 CPR_2236 - 01 Gly tRNA
2452171 2452245 - 75 110801439 CPR_2237 - 03 Pro tRNA
2532078 2532153 - 76 110801439 CPR_2305 - 10 Lys tRNA
2532198 2532271 - 74 110801439 CPR_2306 - 01 Gly tRNA
2532336 2532410 - 75 110801439 CPR_2307 - 05 Gln tRNA
2532414 2532490 - 77 110801439 CPR_2308 - 11 Arg tRNA
2534954 2535029 - 76 110801439 CPR_2312 - 10 Lys tRNA
2535048 2535121 - 74 110801439 CPR_2313 - 01 Gly tRNA
2535127 2535201 - 75 110801439 CPR_2314 - 01 Gly tRNA
2535219 2535292 - 74 110801439 CPR_2315 - 01 Gly tRNA
2535298 2535381 - 84 110801439 CPR_2316 - 15 Leu tRNA
2636785 2636860 - 76 110801439 CPR_2417 - 12 Thr tRNA
2669636 2669710 - 75 110801439 CPR_2454 - 19 Cys tRNA
2669715 2669790 - 76 110801439 CPR_2455 - 17 Phe tRNA
2672081 2672202 - 122 110801439 CPR_r27 - 5S ribosomal RNA
2672204 2672278 - 75 110801439 CPR_2458 - 07 Asn tRNA
2672277 2672403 - 127 110801439 CPR_r28 - 5S ribosomal RNA
2672450 2675356 - 2907 110801439 CPR_r29 - 23S ribosomal RNA
2675457 2675533 - 77 110801439 CPR_2459 - 14 Ile tRNA
2675539 2675614 - 76 110801439 CPR_2460 - 02 Ala tRNA
2675775 2677291 - 1517 110801439 CPR_r30 - 16S ribosomal RNA
2685021 2685095 - 75 110801439 CPR_2466 - 07 Asn tRNA
2698146 2698234 - 89 110801439 CPR_2476 - 15 Leu tRNA
2698251 2698327 - 77 110801439 CPR_2477 - 16 Met tRNA
2698331 2698406 - 76 110801439 CPR_2478 - 16 Met tRNA
2698414 2698502 - 89 110801439 CPR_2479 - 15 Leu tRNA
2698519 2698595 - 77 110801439 CPR_2480 - 16 Met tRNA
2698599 2698674 - 76 110801439 CPR_2481 - 16 Met tRNA
2698681 2698769 - 89 110801439 CPR_2482 - 15 Leu tRNA
2858655 2858730 - 76 110801439 CPR_2624 - 12 Thr tRNA
2858734 2858810 - 77 110801439 CPR_2625 - 06 Asp tRNA
2858822 2858897 - 76 110801439 CPR_2626 - 13 Val tRNA
2858905 2858979 - 75 110801439 CPR_2627 - 04 Glu tRNA
2858985 2859061 - 77 110801439 CPR_2628 - 06 Asp tRNA
2859076 2859151 - 76 110801439 CPR_2629 - 13 Val tRNA
2859158 2859232 - 75 110801439 CPR_2630 - 04 Glu tRNA
2859240 2859316 - 77 110801439 CPR_2631 - 06 Asp tRNA
2859330 2859405 - 76 110801439 CPR_2632 - 13 Val tRNA
2859410 2859484 - 75 110801439 CPR_2633 - 04 Glu tRNA