Геном прокариот/Материалы:NC 008618

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008618»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008618            2089645 bp    DNA     circular BCT 08-AUG-2007
   DEFINITION  Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703, complete genome.
   ACCESSION   NC_008618
   VERSION     NC_008618.1  GI:119025018
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703
     ORGANISM  Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703
               Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Bifidobacteriales;
               Bifidobacteriaceae; Bifidobacterium.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Suzuki,T., Tsuda,Y., Kanou,N., Inoue,T., Kumazaki,K., Nagano,S.,
               Hirai,S., Tanaka,K. and Watanabe,K.
     TITLE     Bifidobacterium adolescentis complete genome sequence
     JOURNAL   Published Only in Database (2006)
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2089645)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-DEC-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2089645)
     AUTHORS   Suzuki,T., Tsuda,Y., Kanou,N., Inoue,T., Kumazaki,K., Nagano,S.,
               Hirai,S., Tanaka,K. and Watanabe,K.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (04-DEC-2006) Tohru Suzuki, Gifu University, Life Science
               Research Center; 1-1 Yanagido, Gifu, Gifu 501-1193, Japan
               (E-mail:suzuki@gifu-u.ac.jp, Tel:81-58-293-3171,
               Fax:81-58-293-3172)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP009256.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
13060 13132 - 73 119025018 BAD_t0001 - Anticodon: TGG
13134 13206 - 73 119025018 BAD_t0002 - Anticodon: AGC
13249 13322 - 74 119025018 BAD_t0003 - Anticodon: AAG
64679 64761 - 83 119025018 BAD_t0004 - Anticodon: TGT
81167 81240 + 74 119025018 BAD_t0005 - Anticodon: CCC
152267 152339 - 73 119025018 BAD_t0006 - Anticodon: TTT
240485 240560 + 76 119025018 BAD_t0007 - Anticodon: CTC
240596 240670 + 75 119025018 BAD_t0008 - Anticodon: CTG
302036 302111 + 76 119025018 BAD_t0009 - Anticodon: CGT
302204 302284 + 81 119025018 BAD_t0010 - Anticodon: TAG
320827 320902 - 76 119025018 BAD_t0011 - Anticodon: ACG
342497 342570 + 74 119025018 BAD_t0012 - Anticodon: TCC
387948 388029 + 82 119025018 BAD_t0013 - Anticodon: GTA
388031 388103 + 73 119025018 BAD_t0014 - Anticodon: GGT
388109 388185 + 77 119025018 BAD_t0015 - Anticodon: CAT
400738 400828 - 91 119025018 BAD_t0016 - Anticodon: TAG
442111 442196 - 86 119025018 BAD_t0017 - Anticodon: GCG
465693 465782 + 90 119025018 BAD_t0018 - Anticodon: TGA
474189 474265 - 77 119025018 BAD_t0019 - Anticodon: GAA
490662 490738 - 77 119025018 BAD_t0020 - Anticodon: GCG
493074 493145 + 72 119025018 BAD_t0021 - Anticodon: TTC
493171 493244 + 74 119025018 BAD_t0022 - Anticodon: GTC
493268 493343 + 76 119025018 BAD_t0023 - Anticodon: GAA
553096 553169 + 74 119025018 BAD_t0024 - 14 Ile tRNA
626466 626542 + 77 119025018 BAD_t0025 - Anticodon: TCT
628730 628805 - 76 119025018 BAD_t0026 - Anticodon: TTG
628839 628911 - 73 119025018 BAD_t0027 - Anticodon: CGG
628957 629028 - 72 119025018 BAD_t0028 - Anticodon: GGA
662621 662696 - 76 119025018 BAD_t0029 - Anticodon: AGA
738459 738535 + 77 119025018 BAD_t0030 - Anticodon: ACG
738577 738650 + 74 119025018 BAD_t0031 - Anticodon: ACG
812748 812827 + 80 119025018 BAD_t0032 - Anticodon: TAA
847728 847801 + 74 119025018 BAD_t0033 - Anticodon: CAA
856660 856736 + 77 119025018 BAD_t0034 - Anticodon: TGG
904796 904886 - 91 119025018 BAD_t0035 - Anticodon: ACA
972147 972219 + 73 119025018 BAD_t0036 - Anticodon: GTT
972247 972319 + 73 119025018 BAD_t0037 - Anticodon: GTT
1018165 1018242 - 78 119025018 BAD_t0038 - Xaa tRNA
1028759 1028831 - 73 119025018 BAD_t0039 - Anticodon: CGG
1028862 1028933 - 72 119025018 BAD_t0040 - Anticodon: GGA
1028974 1029044 - 71 119025018 BAD_t0041 - Anticodon: AGC
1029072 1029147 - 76 119025018 BAD_t0042 - Anticodon: TTG
1060541 1060616 - 76 119025018 BAD_t0043 - Anticodon: TTG
1071291 1071366 - 76 119025018 BAD_t0044 - Anticodon: GGA
1084173 1084245 - 73 119025018 BAD_t0045 - Anticodon: TGG
1107262 1107335 + 74 119025018 BAD_t0046 - Anticodon: TTG
1435985 1436058 + 74 119025018 BAD_t0047 - Anticodon: TAC
1522409 1522481 + 73 119025018 BAD_t0048 - Anticodon: CCT
1525217 1525338 - 122 119025018 BAD_1221a - 5S ribosomal RNA
1549800 1549916 - 117 119025018 BAD_r0001 - 5S ribosomal RNA
1550111 1553191 - 3081 119025018 BAD_r0002 - 23S ribosomal RNA
1553631 1555164 - 1534 119025018 BAD_r0003 - 16S ribosomal RNA
1611079 1611195 - 117 119025018 BAD_r0004 - 5S ribosomal RNA
1611391 1614470 - 3080 119025018 BAD_r0005 - 23S ribosomal RNA
1614924 1616459 - 1536 119025018 BAD_r0006 - 16S ribosomal RNA
1796364 1796439 - 76 119025018 BAD_t0049 - 11 Arg tRNA
1810564 1810640 + 77 119025018 BAD_t0050 - Anticodon: CAT
1861607 1861680 - 74 119025018 BAD_t0051 - Anticodon: AAT
1904972 1905059 - 88 119025018 BAD_t0052 - Anticodon: AAC
1906098 1906214 - 117 119025018 BAD_r0007 - 5S ribosomal RNA
1906411 1909492 - 3082 119025018 BAD_r0008 - 23S ribosomal RNA
1909939 1911469 - 1531 119025018 BAD_r0009 - 16S ribosomal RNA
1951626 1951701 + 76 119025018 BAD_t0053 - Anticodon: CGC
1984547 1984663 - 117 119025018 BAD_r0010 - 5S ribosomal RNA
1984860 1987940 - 3081 119025018 BAD_r0011 - 23S ribosomal RNA
1988380 1989913 - 1534 119025018 BAD_r0012 - 16S ribosomal RNA
2057159 2057275 - 117 119025018 BAD_r0013 - 5S ribosomal RNA
2057472 2060552 - 3081 119025018 BAD_r0014 - 23S ribosomal RNA
2060993 2062526 - 1534 119025018 BAD_r0015 - 16S ribosomal RNA
2069586 2069662 + 77 119025018 BAD_t0054 - Anticodon: TGT