Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 002678

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 002678»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_002678            7036071 bp    DNA     circular BCT 03-DEC-2005
   DEFINITION  Mesorhizobium loti MAFF303099, complete genome.
   ACCESSION   NC_002678
   VERSION     NC_002678.2  GI:57165207
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Mesorhizobium loti MAFF303099
     ORGANISM  Mesorhizobium loti MAFF303099
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales;
               Phyllobacteriaceae; Mesorhizobium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 7036071)
     AUTHORS   Kaneko,T., Nakamura,Y., Sato,S., Asamizu,E., Kato,T., Sasamoto,S.,
               Watanabe,A., Idesawa,K., Ishikawa,A., Kawashima,K., Kimura,T.,
               Kishida,Y., Kiyokawa,C., Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A.,
               Mochizuki,Y., Nakayama,S., Nakazaki,N., Shimpo,S., Sugimoto,M.,
               Takeuchi,C., Yamada,M. and Tabata,S.
     TITLE     Complete genome structure of the nitrogen-fixing symbiotic
               bacterium Mesorhizobium loti
     JOURNAL   DNA Res. 7 (6), 331-338 (2000)
      PUBMED   11214968
   REFERENCE   2  (bases 1 to 7036071)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (28-MAR-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 7036071)
     AUTHORS   Kaneko,T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (25-DEC-2000) Kazusa DNA Research Institute, The First
               Laboratory for Plant Gene Research, Yana 1532-3, Kisarazu, Chiba
               292-0812, Japan
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BA000012.
               On Jan 6, 2005 this sequence version replaced gi:13470324.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
108953 109035 - 83 57165207 MAFFt01 -
174602 174674 - 73 57165207 MAFFt02 -
182332 182413 + 82 57165207 MAFFt03 -
182507 182577 + 71 57165207 MAFFt04 -
189335 189407 + 73 57165207 MAFFt05 -
347728 347814 + 87 57165207 MAFFt06 -
390847 390918 + 72 57165207 MAFFt07 -
552076 552148 - 73 57165207 MAFFt08 -
758541 758612 + 72 57165207 MAFFt09 -
885120 885201 + 82 57165207 MAFFt10 -
931145 931215 - 71 57165207 MAFFt11 -
932216 932287 + 72 57165207 MAFFt12 -
985561 985635 + 75 57165207 MAFFt13 -
1119775 1119856 - 82 57165207 MAFFt14 -
1166352 1166424 - 73 57165207 MAFFt15 -
1306445 1306844 - 400 57165207 MAFFs01 - RNA subunit of RNase P
1484314 1484384 + 71 57165207 MAFFt16 -
1960650 1960722 - 73 57165207 MAFFt17 -
2262782 2262855 + 74 57165207 MAFFt18 -
2447615 2447686 + 72 57165207 MAFFt19 -
2521648 2521734 - 87 57165207 MAFFt20 -
2745672 2745745 - 74 57165207 MAFFt21 -
2745963 2746081 - 119 57165207 MAFFr01 - 5S ribosomal RNA
2746230 2749084 - 2855 57165207 MAFFr02 - 23S ribosomal RNA
2749510 2749582 - 73 57165207 MAFFt22 -
2749636 2749709 - 74 57165207 MAFFt23 -
2750005 2751465 - 1461 57165207 MAFFr03 - 16S ribosomal RNA
2753161 2753234 - 74 57165207 MAFFt24 -
2753476 2753594 - 119 57165207 MAFFr04 - 5S ribosomal RNA
2753743 2756597 - 2855 57165207 MAFFr05 - 23S ribosomal RNA
2757023 2757095 - 73 57165207 MAFFt25 -
2757149 2757222 - 74 57165207 MAFFt26 -
2757518 2758978 - 1461 57165207 MAFFr06 - 16S ribosomal RNA
2802935 2803016 - 82 57165207 MAFFt27 -
2888029 2888102 + 74 57165207 MAFFt28 -
3010387 3010458 - 72 57165207 MAFFt29 -
3212914 3213000 + 87 57165207 MAFFt30 -
3320515 3320587 + 73 57165207 MAFFt31 -
3514869 3514940 + 72 57165207 MAFFt32 -
3682634 3682715 + 82 57165207 MAFFt33 -
3823111 3823184 - 74 57165207 MAFFt34 -
3934618 3934691 + 74 57165207 MAFFt35 -
4147036 4147108 + 73 57165207 MAFFt36 -
4394691 4394763 - 73 57165207 MAFFt37 -
4556829 4556899 - 71 57165207 MAFFt38 -
5255770 5255842 - 73 57165207 MAFFt39 -
5279354 5279425 + 72 57165207 MAFFt40 -
5351042 5351115 + 74 57165207 MAFFt41 -
6214934 6215005 - 72 57165207 MAFFt42 -
6294442 6294515 - 74 57165207 MAFFt43 -
6410149 6410243 + 95 57165207 MAFFt44 -
6574580 6574653 - 74 57165207 MAFFt45 -
6575131 6575204 + 74 57165207 MAFFt46 -
6855487 6855557 - 71 57165207 MAFFt47 -
6924448 6924521 - 74 57165207 MAFFt48 -
6975166 6975239 - 74 57165207 MAFFt49 -
6975457 6975529 + 73 57165207 MAFFt50 -