Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 004369

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 004369»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_004369            3147090 bp    DNA     circular BCT 02-DEC-2005
   DEFINITION  Corynebacterium efficiens YS-314, complete genome.
   ACCESSION   NC_004369
   VERSION     NC_004369.1  GI:25026556
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Corynebacterium efficiens YS-314
     ORGANISM  Corynebacterium efficiens YS-314
               Bacteria; Actinobacteria; Actinobacteridae; Actinomycetales;
               Corynebacterineae; Corynebacteriaceae; Corynebacterium.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3147090)
     AUTHORS   Nishio,Y., Nakamura,Y., Kawarabayasi,Y., Usuda,Y., Kimura,E.,
               Sugimoto,S., Matsui,K., Yamagishi,A., Kikuchi,H., Ikeo,K. and
               Gojobori,T.
     TITLE     Comparative complete genome sequence analysis of the amino acid
               replacements responsible for the thermostability of Corynebacterium
               efficiens
     JOURNAL   Genome Res. 13 (7), 1572-1579 (2003)
      PUBMED   12840036
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3147090)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (15-NOV-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3147090)
     AUTHORS   Kawarabayasi,Y., Yamazaki,J., Hino,Y., Kikuchi,H. and
               Director-General of Biotechnology Center.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (17-MAY-2002) Director-General of Biotechnology Center,
               National Institute of Technology and Evaluation, Biotechnology
               Center; Nishihara 2-49-10, Shibuya-ku, Tokyo 151-0066, Japan
               (E-mail:bio@nite.go.jp, Tel:81-3-3481-1933, Fax:81-3-3481-8424)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BA000035.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
17345 17421 + 77 25026556 CEtRNA01 - Anticodon: GAT
17429 17501 + 73 25026556 CEtRNA02 - Anticodon: TGC
42450 42535 + 86 25026556 CEtRNA03 - Anticodon: CAG
194877 194961 + 85 25026556 CEtRNA04 - Anticodon: TGA
204649 204737 + 89 25026556 CEtRNA05 - Anticodon: GCT
204771 204846 + 76 25026556 CEtRNA06 - Anticodon: ACG
206956 207031 + 76 25026556 CEtRNA07 - Anticodon: ACG
209554 209644 + 91 25026556 CEtRNA08 - Anticodon: CGA
219828 219915 - 88 25026556 CEtRNA09 - Anticodon: GGA
295582 295658 - 77 25026556 CEtRNA10 - Anticodon: CGG
338816 338891 + 76 25026556 CEtRNA11 - 12 Thr tRNA
521492 521574 + 83 25026556 CEtRNA12 - 18 Tyr tRNA
522152 522227 + 76 25026556 CEtRNA13 - 12 Thr tRNA
522280 522351 + 72 25026556 CEtRNA14 - 16 Met tRNA
522508 522583 + 76 25026556 CEtRNA15 - 20 Trp tRNA
861148 861224 + 77 25026556 CEtRNA16 - 16 Met tRNA
861809 861885 + 77 25026556 CEtRNA17 - 16 Met tRNA
931679 933086 + 1408 25026556 CErRNA01 - 16S ribosomal RNA
933549 936631 + 3083 25026556 CErRNA02 - 23S ribosomal RNA
936756 936875 + 120 25026556 CErRNA03 - 5S ribosomal RNA
975209 975284 - 76 25026556 CEtRNA18 - 11 Arg tRNA
1091956 1092027 - 72 25026556 CEtRNA19 - 05 Gln tRNA
1105057 1105130 + 74 25026556 CEtRNA20 - 15 Leu tRNA
1334714 1334786 - 73 25026556 CEtRNA21 - 11 Arg tRNA
1468116 1468187 + 72 25026556 CEtRNA22 - 05 Gln tRNA
1468227 1468302 + 76 25026556 CEtRNA23 - 04 Glu tRNA
1469098 1469170 + 73 25026556 CEtRNA24 - 04 Glu tRNA
1478138 1478209 + 72 25026556 CEtRNA25 - 05 Gln tRNA
1478249 1478324 + 76 25026556 CEtRNA26 - 04 Glu tRNA
1611156 1612563 + 1408 25026556 CErRNA04 - 16S ribosomal RNA
1613026 1616107 + 3082 25026556 CErRNA05 - 23S ribosomal RNA
1616231 1616350 + 120 25026556 CErRNA06 - 5S ribosomal RNA
1646332 1646408 - 77 25026556 CEtRNA28 - 03 Pro tRNA
1733328 1733413 + 86 25026556 CEtRNA29 - 15 Leu tRNA
1733516 1733601 + 86 25026556 CEtRNA30 - 15 Leu tRNA
1886432 1886504 - 73 25026556 CEtRNA31 - 01 Gly tRNA
1886537 1886611 - 75 25026556 CEtRNA32 - 13 Val tRNA
1886648 1886720 - 73 25026556 CEtRNA33 - 01 Gly tRNA
1886753 1886827 - 75 25026556 CEtRNA34 - 13 Val tRNA
1886837 1886907 - 71 25026556 CEtRNA35 - 19 Cys tRNA
1886949 1887021 - 73 25026556 CEtRNA36 - 01 Gly tRNA
1887377 1887451 + 75 25026556 CEtRNA37 - 13 Val tRNA
2275298 2275370 - 73 25026556 CEtRNA38 - 13 Val tRNA
2297219 2297292 - 74 25026556 CEtRNA39 - 16 Met tRNA
2299084 2299156 + 73 25026556 CEtRNA40 - 07 Asn tRNA
2462328 2462401 - 74 25026556 CEtRNA41 - 03 Pro tRNA
2462773 2462844 - 72 25026556 CEtRNA42 - 01 Gly tRNA
2504980 2505056 + 77 25026556 CEtRNA43 - 11 Arg tRNA
2517603 2517678 + 76 25026556 CEtRNA44 - 09 His tRNA
2524659 2524731 + 73 25026556 CEtRNA45 - 10 Lys tRNA
2524825 2524900 + 76 25026556 CEtRNA46 - 10 Lys tRNA
2554958 2555039 - 82 25026556 CEtRNA47 - 15 Leu tRNA
2584755 2584827 - 73 25026556 CEtRNA48 - 02 Ala tRNA
2584859 2584931 - 73 25026556 CEtRNA49 - 02 Ala tRNA
2594885 2595004 - 120 25026556 CErRNA07 - 5S ribosomal RNA
2595129 2598210 - 3082 25026556 CErRNA08 - 23S ribosomal RNA
2598674 2600081 - 1408 25026556 CErRNA09 - 16S ribosomal RNA
2606283 2606358 - 76 25026556 CEtRNA50 - 17 Phe tRNA
2606391 2606464 - 74 25026556 CEtRNA51 - 06 Asp tRNA
2608946 2609022 - 77 25026556 CEtRNA52 - 06 Asp tRNA
2609052 2609127 - 76 25026556 CEtRNA53 - 04 Glu tRNA
2621684 2621759 - 76 25026556 CEtRNA54 - 10 Lys tRNA
2672375 2672447 - 73 25026556 CEtRNA55 - 12 Thr tRNA
2833871 2833944 + 74 25026556 CEtRNA56 - 01 Gly tRNA
2977401 2977520 - 120 25026556 CErRNA10 - 5S ribosomal RNA
2977645 2980726 - 3082 25026556 CErRNA11 - 23S ribosomal RNA
2981190 2982597 - 1408 25026556 CErRNA12 - 16S ribosomal RNA
2986276 2986395 - 120 25026556 CErRNA13 - 5S ribosomal RNA
2986520 2989602 - 3083 25026556 CErRNA14 - 23S ribosomal RNA
2990066 2991474 - 1409 25026556 CErRNA15 - 16S ribosomal RNA