Геном прокариот/Материалы:NC 004556

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_004556            2519802 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2006
   DEFINITION  Xylella fastidiosa Temecula1, complete genome.
   ACCESSION   NC_004556
   VERSION     NC_004556.1  GI:28197945
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xylella fastidiosa Temecula1
     ORGANISM  Xylella fastidiosa Temecula1
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xylella.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2519802)
     AUTHORS   Van Sluys,M.A., de Oliveira,M.C., Monteiro-Vitorello,C.B.,
               Miyaki,C.Y., Furlan,L.R., Camargo,L.E.A., da Silva,A.C.R.,
               Moon,D.H., Takita,M.A., Lemos,E.G.M., Machado,M.A., Ferro,M.I.T.,
               da Silva,F.R., Goldman,M.H.S., Goldman,G.H., Lemos,M.V.F.,
               El-Dorry,H., Tsai,S.M., Carrer,H., Carraro,D.M., de Oliveira,R.C.,
               Nunes,L.R., Siqueira,W.J., Coutinho,L.L., Kimura,E.T., Ferro,E.S.,
               Harakava,R., Kuramae,E.E., Marino,C.L., Giglioti,E., Abreu,I.L.,
               Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Baia,G.S., Blanco,S.R., Brito,M.S.,
               Cannavan,F.S., Celestino,A.V., da Cunha,A.F., Fenille,R.C.,
               Ferro,J.A., Formighieri,E.F., Kishi,L.T., Leoni,S.G.,
               Oliveira,A.R., Rosa,V.E. Jr., Sassaki,F.T., Sena,J.A.D., de
               Souza,A.A., Truffi,D., Tsukumo,F., Yanai,G.M., Zaros,L.G.,
               Civerolo,E.L., Simpson,A.J.G., Almeida,N.F. Jr., Setubal,J.C. and
               Kitajima,J.P.
     TITLE     Comparative Analyses of the Complete Genome Sequences of Pierce's
               Disease and Citrus Variegated Chlorosis Strains of Xylella
               fastidiosa
     JOURNAL   J. Bacteriol. 185 (3), 1018-1026 (2003)
      PUBMED   12533478
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2519802)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2519802)
     AUTHORS   Van Sluys,M.A., de Oliveira,M.C., Monteiro-Vitorello,C.B.,
               Miyaki,C.Y., Furlan,L.R., Camargo,L.E.A., da Silva,A.C.R.,
               Moon,D.H., Takita,M.A., Lemos,E.G.M., Machado,M.A., Ferro,M.I.T.,
               da Silva,F.R., Goldman,M.H.S., Goldman,G.H., Lemos,M.V.F.,
               El-Dorry,H., Tsai,S.M., Carrer,H., Carraro,D.M., de Oliveira,R.C.,
               Nunes,L.R., Siqueira,W.J., Coutinho,L.L., Kimura,E.T., Ferro,E.S.,
               Harakava,R., Kuramae,E.E., Marino,C.L., Giglioti,E., Abreu,I.L.,
               Alves,L.M.C., do Amaral,A.M., Baia,G.S., Blanco,S.R., Brito,M.S.,
               Cannavan,F.S., Celestino,A.V., da Cunha,A.F., Fenille,R.C.,
               Ferro,J.A., Formighieri,E.F., Kishi,L.T., Leoni,S.G.,
               Oliveira,A.R., Rosa,V.E. Jr., Sassaki,F.T., Sena,J.A.D., de
               Souza,A.A., Truffi,D., Tsukumo,F., Yanai,G.M., Zaros,L.G.,
               Civerolo,E.L., Simpson,A.J.G., Almeida,N.F. Jr., Setubal,J.C. and
               Kitajima,J.P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (17-DEC-2001) Instituto de Biociencias, Universidade de
               Sao Paulo, Rua do Matao, 277, Sao Paulo, SP 05508-900, Brazil
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE009442.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
20728	20804	-	77	28197945	PD0016	-	^{16 Met tRNA}
61898	61974	+	77	28197945	PD0047	-	^{11 Arg tRNA}
66041	67585	+	1545	28197945	PD0048	-	16S ribosomal RNA
67692	67767	+	76	28197945	PD0049	-	^{02 Ala tRNA}
67781	67857	+	77	28197945	PD0050	-	^{14 Ile tRNA}
68050	70932	+	2883	28197945	PD0051	-	23S ribosomal RNA
71060	71177	+	118	28197945	PD0052	-	5S ribosomal RNA
122451	122543	+	93	28197945	PD0096	-	^{08 Ser tRNA}
171124	172668	+	1545	28197945	PD0133	-	16S ribosomal RNA
172775	172850	+	76	28197945	PD0134	-	^{02 Ala tRNA}
172864	172940	+	77	28197945	PD0135	-	^{14 Ile tRNA}
173133	176015	+	2883	28197945	PD0136	-	23S ribosomal RNA
176143	176260	+	118	28197945	PD0137	-	5S ribosomal RNA
223170	223245	-	76	28197945	PD0176	-	^{02 Ala tRNA}
234764	234838	-	75	28197945	PD0184	-	^{04 Glu tRNA}
241438	241514	+	77	28197945	PD0191	-	^{16 Met tRNA}
307078	307153	+	76	28197945	PD0237	-	^{17 Phe tRNA}
317497	317581	+	85	28197945	PD0247	-	^{15 Leu tRNA}
428976	429328	+	353	28197945	PD0335	-	ribonuclease P catalytic RNA subunit
431180	431266	-	87	28197945	PD0339	-	^{15 Leu tRNA}
431397	431472	-	76	28197945	PD0340	-	^{04 Glu tRNA}
431526	431601	-	76	28197945	PD0341	-	^{02 Ala tRNA}
506192	506276	-	85	28197945	PD0411	-	^{15 Leu tRNA}
558291	558377	-	87	28197945	PD0467	-	^{15 Leu tRNA}
562814	562897	-	84	28197945	PD0470	-	^{15 Leu tRNA}
569915	569989	+	75	28197945	PD0476	-	^{13 Val tRNA}
570020	570096	+	77	28197945	PD0477	-	^{06 Asp tRNA}
617865	617940	-	76	28197945	PD0510	-	^{10 Lys tRNA}
952980	953053	-	74	28197945	PD0771	-	^{19 Cys tRNA}
1142563	1142638	-	76	28197945	PD0944	-	^{10 Lys tRNA}
1263216	1263308	+	93	28197945	PD1060	-	^{08 Ser tRNA}
1275932	1276007	+	76	28197945	PD1074	-	^{12 Thr tRNA}
1279785	1279860	-	76	28197945	PD1079	-	^{01 Gly tRNA}
1287099	1287175	-	77	28197945	PD1085	-	^{11 Arg tRNA}
1417227	1417317	-	91	28197945	PD1215	-	^{08 Ser tRNA}
1556021	1556096	+	76	28197945	PD1327	-	^{01 Gly tRNA}
1670103	1670178	-	76	28197945	PD1433	-	^{12 Thr tRNA}
1738190	1738264	-	75	28197945	PD1496	-	^{13 Val tRNA}
1772646	1772735	+	90	28197945	PD1526	-	^{08 Ser tRNA}
1860993	1861069	-	77	28197945	PD1609	-	^{07 Asn tRNA}
1944465	1944541	+	77	28197945	PD1675	-	^{16 Met tRNA}
1944587	1944661	+	75	28197945	PD1676	-	^{05 Gln tRNA}
2020428	2020502	-	75	28197945	PD1733	-	^{13 Val tRNA}
2124945	2125021	+	77	28197945	PD1821	-	^{03 Pro tRNA}
2210084	2210157	+	74	28197945	PD1880	-	^{01 Gly tRNA}
2239487	2239563	-	77	28197945	PD1908	-	^{03 Pro tRNA}
2303865	2303942	+	78	28197945	PD1961	-	^{11 Arg tRNA}
2368420	2368495	-	76	28197945	PD2008	-	^{20 Trp tRNA}
2369847	2369922	-	76	28197945	PD2010	-	^{12 Thr tRNA}
2369965	2370038	-	74	28197945	PD2011	-	^{01 Gly tRNA}
2370072	2370157	-	86	28197945	PD2012	-	^{18 Tyr tRNA}
2373906	2373982	-	77	28197945	PD2017	-	^{05 Gln tRNA}
2447459	2447813	+	355	28197945	PD2067	-	tmRNA
2489453	2489529	+	77	28197945	PD2099	-	^{03 Pro tRNA}
2489593	2489671	+	79	28197945	PD2100	-	^{11 Arg tRNA}
2489711	2489787	+	77	28197945	PD2101	-	^{09 His tRNA}
2489898	2489973	+	76	28197945	PD2102	-	^{10 Lys tRNA}