Геном прокариот/Материалы:NC 006270

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 006270»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_006270            4222334 bp    DNA     circular BCT 18-JAN-2006
   DEFINITION  Bacillus licheniformis ATCC 14580, complete genome.
   ACCESSION   NC_006270
   VERSION     NC_006270.2  GI:56182545
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Bacillus licheniformis ATCC 14580 (DSM 13)
     ORGANISM  Bacillus licheniformis ATCC 14580
               Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4222334)
     AUTHORS   Rey,M.W., Ramaiya,P., Nelson,B.A., Brody-Karpin,S.D.,
               Zaretsky,E.J., Tang,M., de Leon,A.L., Xiang,H., Gusti,V.,
               Clausen,I.G., Olsen,P.B., Rasmussen,M.D., Andersen,J.T.,
               Jorgensen,P.L., Larsen,T.S., Sorokin,A., Bolotin,A., Lapidus,A.,
               Galleron,N., Ehrlich,S.D. and Berka,R.M.
     TITLE     Complete genome sequence of the industrial bacterium Bacillus
               licheniformis and comparisons with closely related Bacillus species
     JOURNAL   Genome Biol. 5 (10), R77 (2004)
      PUBMED   15461803
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4222334)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (15-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4222334)
     AUTHORS   Berka,R.M., Rey,M.W. and Ramaiya,P.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (14-JUL-2004) Novozymes Biotech Inc, 1445 Drew Ave,
               Davis, CA 95616, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000002.
               On Dec 2, 2004 this sequence version replaced gi:52078491.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
9908 11452 + 1545 56182545 BL_rrna_0001 - 16S ribosomal RNA
11553 11629 + 77 56182545 BL_trna_0001 - 14 Ile tRNA
11641 11716 + 76 56182545 BL_trna_0002 - 02 Ala tRNA
11787 14719 + 2933 56182545 BL_rrna_0002 - 23S ribosomal RNA
14851 14966 + 116 56182545 BL_rrna_0003 - 5S ribosomal RNA
26549 26641 + 93 56182545 BL_trna_0003 - 08 Ser tRNA
34611 36155 + 1545 56182545 BL_rrna_0004 - 16S ribosomal RNA
36256 36332 + 77 56182545 BL_trna_0004 - 14 Ile tRNA
36344 36419 + 76 56182545 BL_trna_0005 - 02 Ala tRNA
36490 39420 + 2931 56182545 BL_rrna_0005 - 23S ribosomal RNA
39553 39668 + 116 56182545 BL_rrna_0006 - 5S ribosomal RNA
74949 75022 + 74 56182545 BL_trna_0006 - 16 Met tRNA
75033 75104 + 72 56182545 BL_trna_0007 - 04 Glu tRNA
95347 96892 + 1546 56182545 BL_rrna_0007 - 16S ribosomal RNA
97065 99995 + 2931 56182545 BL_rrna_0008 - 23S ribosomal RNA
100128 100243 + 116 56182545 BL_rrna_0009 - 5S ribosomal RNA
158300 159845 + 1546 56182545 BL_rrna_0010 - 16S ribosomal RNA
160018 162951 + 2934 56182545 BL_rrna_0011 - 23S ribosomal RNA
163084 163119 + 36 56182545 BL_rrna_0012 - 5S ribosomal RNA
163242 163315 + 74 56182545 BL_trna_0008 -
163318 163390 + 73 56182545 BL_trna_0009 - 12 Thr tRNA
176445 176518 + 74 56182545 BL_trna_0010 - 04 Glu tRNA
176669 176744 + 76 56182545 BL_trna_0011 - 13 Val tRNA
176803 176875 + 73 56182545 BL_trna_0012 - 12 Thr tRNA
176884 176968 + 85 56182545 BL_trna_0013 - 18 Tyr tRNA
176973 177044 + 72 56182545 BL_trna_0014 - 05 Gln tRNA
572258 572332 + 75 56182545 BL_trna_0015 - 07 Asn tRNA
572335 572425 + 91 56182545 BL_trna_0016 - 08 Ser tRNA
572454 572525 + 72 56182545 BL_trna_0017 - 04 Glu tRNA
572538 572612 + 75 56182545 BL_trna_0018 - 05 Gln tRNA
572621 572696 + 76 56182545 BL_trna_0019 - 10 Lys tRNA
572709 572791 + 83 56182545 BL_trna_0020 - 15 Leu tRNA
572812 572895 + 84 56182545 BL_trna_0021 - 15 Leu tRNA
611686 611762 + 77 56182545 BL_trna_0022 - 11 Arg tRNA
611775 611848 + 74 56182545 BL_trna_0023 - 01 Gly tRNA
612013 613557 + 1545 56182545 BL_rrna_0013 - 16S ribosomal RNA
613730 616662 + 2933 56182545 BL_rrna_0014 - 23S ribosomal RNA
616795 616910 + 116 56182545 BL_rrna_0015 - 5S ribosomal RNA
616923 616999 + 77 56182545 BL_trna_0024 - 16 Met tRNA
617041 617117 + 77 56182545 BL_trna_0025 - 06 Asp tRNA
920492 922037 + 1546 56182545 BL_rrna_0016 - 16S ribosomal RNA
922210 925140 + 2931 56182545 BL_rrna_0017 - 23S ribosomal RNA
925324 925416 + 93 56182545 BL_rrna_0018 - 5S ribosomal RNA
925436 925510 + 75 56182545 BL_trna_0026 - 07 Asn tRNA
925517 925608 + 92 56182545 BL_trna_0027 - 08 Ser tRNA
925623 925697 + 75 56182545 BL_trna_0028 - 04 Glu tRNA
925815 925890 + 76 56182545 BL_trna_0029 - 13 Val tRNA
925912 925988 + 77 56182545 BL_trna_0030 - 16 Met tRNA
926003 926079 + 77 56182545 BL_trna_0031 - 06 Asp tRNA
926090 926165 + 76 56182545 BL_trna_0032 - 17 Phe tRNA
926169 926241 + 73 56182545 BL_trna_0033 - 12 Thr tRNA
926249 926333 + 85 56182545 BL_trna_0034 - 18 Tyr tRNA
926341 926414 + 74 56182545 BL_trna_0035 - 20 Trp tRNA
926435 926507 + 73 56182545 BL_trna_0036 - 09 His tRNA
926516 926587 + 72 56182545 BL_trna_0037 - 05 Gln tRNA
926641 926715 + 75 56182545 BL_trna_0038 - 01 Gly tRNA
926729 926799 + 71 56182545 BL_trna_0039 - 19 Cys tRNA
926810 926898 + 89 56182545 BL_trna_0040 - 15 Leu tRNA
926913 926997 + 85 56182545 BL_trna_0041 - 15 Leu tRNA
953171 953244 + 74 56182545 BL_trna_0042 - 01 Gly tRNA
1299727 1299799 - 73 56182545 BL_trna_0043 - 13 Val tRNA
2175934 2176007 + 74 56182545 BL_trna_0044 - 11 Arg tRNA
2558249 2558323 + 75 56182545 BL_trna_0045 - 05 Gln tRNA
2865300 2865376 - 77 56182545 BL_trna_0046 - 11 Arg tRNA
3115485 3115559 - 75 56182545 BL_trna_0047 - 04 Glu tRNA
3115572 3115662 - 91 56182545 BL_trna_0048 - 08 Ser tRNA
3115664 3115738 - 75 56182545 BL_trna_0049 - 07 Asn tRNA
3115745 3115821 - 77 56182545 BL_trna_0050 - 14 Ile tRNA
3115834 3115907 - 74 56182545 BL_trna_0051 - 01 Gly tRNA
3115916 3115991 - 76 56182545 BL_trna_0052 - 09 His tRNA
3116014 3116089 - 76 56182545 BL_trna_0053 - 17 Phe tRNA
3116100 3116176 - 77 56182545 BL_trna_0054 - 06 Asp tRNA
3116222 3116298 - 77 56182545 BL_trna_0055 - 16 Met tRNA
3116323 3116415 - 93 56182545 BL_trna_0056 - 08 Ser tRNA
3116423 3116499 - 77 56182545 BL_trna_0057 - 16 Met tRNA
3116505 3116578 - 74 56182545 BL_trna_0058 - 16 Met tRNA
3116604 3116676 - 73 56182545 BL_trna_0059 - 02 Ala tRNA
3116683 3116759 - 77 56182545 BL_trna_0060 - 03 Pro tRNA
3116768 3116844 - 77 56182545 BL_trna_0061 - 11 Arg tRNA
3116855 3116926 - 72 56182545 BL_trna_0062 - 01 Gly tRNA
3116942 3117026 - 85 56182545 BL_trna_0063 - 15 Leu tRNA
3117033 3117108 - 76 56182545 BL_trna_0064 - 10 Lys tRNA
3117190 3117265 - 76 56182545 BL_trna_0065 - 12 Thr tRNA
3117281 3117356 - 76 56182545 BL_trna_0066 - 13 Val tRNA
3118082 3118197 - 116 56182545 BL_rrna_0019 - 5S ribosomal RNA
3118329 3121262 - 2934 56182545 BL_rrna_0020 - 23S ribosomal RNA
3121432 3122977 - 1546 56182545 BL_rrna_0021 - 16S ribosomal RNA
3143412 3143484 - 73 56182545 BL_trna_0067 - 02 Ala tRNA
3538113 3538188 - 76 56182545 BL_trna_0068 - 11 Arg tRNA
4187076 4187148 - 73 56182545 BL_trna_0069 - 17 Phe tRNA
4187175 4187251 - 77 56182545 BL_trna_0070 - 06 Asp tRNA
4187340 4187411 - 72 56182545 BL_trna_0071 - 04 Glu tRNA
4187419 4187494 - 76 56182545 BL_trna_0072 - 10 Lys tRNA