Геном прокариот/Материалы:NC 006677

	Базовый уровень статей Выделить только проверенную информацию
	Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_006677            2702173 bp    DNA     circular BCT 03-DEC-2005
   DEFINITION  Gluconobacter oxydans 621H, complete genome.
   ACCESSION   NC_006677
   VERSION     NC_006677.1  GI:58038491
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Gluconobacter oxydans 621H
     ORGANISM  Gluconobacter oxydans 621H
               Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodospirillales;
               Acetobacteraceae; Gluconobacter.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2702173)
     AUTHORS   Prust,C., Hoffmeister,M., Liesegang,H., Wiezer,A., Fricke,W.F.,
               Ehrenreich,A., Gottschalk,G. and Deppenmeier,U.
     TITLE     Complete genome sequence of the acetic acid bacterium Gluconobacter
               oxydans
     JOURNAL   Nat. Biotechnol. 23 (2), 195-200 (2005)
      PUBMED   15665824
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2702173)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (24-JAN-2005) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2702173)
     AUTHORS   Prust,C., Hoffmeister,M., Liesegang,H., Wiezer,A., Fricke,W.F.,
               Gottschalk,G. and Deppenmeier,U.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (15-JUL-2004) Goettingen Genomics Laboratory,
               Georg-August-University Goettingen, Grisebachstr. 8, Goettingen
               D-37077, Germany
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000009.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
34757	34831	+	75	58038491	GOX0027	-	^{16 Met tRNA}
51717	51802	-	86	58038491	GOX0045	-	^{15 Leu tRNA}
98639	98713	-	75	58038491	GOX0083	-	^{13 Val tRNA}
105568	105652	-	85	58038491	GOX0089	-	^{15 Leu tRNA}
131145	131221	-	77	58038491	GOX0112	-	tRNA-Pro-GGG
155117	155205	-	89	58038491	GOX0138	-	^{08 Ser tRNA}
190867	190943	-	77	58038491	GOX0172	-	^{11 Arg tRNA}
190962	191038	-	77	58038491	GOX0173	-	^{03 Pro tRNA}
192961	193036	-	76	58038491	GOX0176	-	^{07 Asn tRNA}
213646	213735	+	90	58038491	GOX0199	-	^{08 Ser tRNA}
238223	238299	-	77	58038491	GOX0219	-	^{16 Met tRNA}
238351	238467	-	117	58038491	GOX0220	-	5S ribosomal RNA
238565	241274	-	2710	58038491	GOX0221	-	23S ribosomal RNA
241649	241724	-	76	58038491	GOX0222	-	^{02 Ala tRNA}
241731	241807	-	77	58038491	GOX0223	-	^{14 Ile tRNA}
241937	243414	-	1478	58038491	GOX0224	-	16S ribosomal RNA
480240	480315	-	76	58038491	GOX0457	-	tRNA-His-GTG
507988	508063	+	76	58038491	GOX0486	-	^{04 Glu tRNA}
523990	524075	-	86	58038491	GOX0500	-	^{18 Tyr tRNA}
665102	665176	+	75	58038491	GOX0623	-	^{12 Thr tRNA}
823833	823906	-	74	58038491	GOX0754	-	^{16 Met tRNA}
830919	830993	-	75	58038491	GOX0760	-	^{01 Gly tRNA}
831141	831215	-	75	58038491	GOX0761	-	^{01 Gly tRNA}
940391	940467	+	77	58038491	GOX0872	-	^{03 Pro tRNA}
952595	952670	-	76	58038491	GOX0883	-	^{10 Lys tRNA}
1100694	1100769	+	76	58038491	GOX1005	-	^{17 Phe tRNA}
1140783	1140858	+	76	58038491	GOX1039	-	^{02 Ala tRNA}
1162502	1162577	-	76	58038491	GOX1061	-	^{10 Lys tRNA}
1212306	1212381	+	76	58038491	GOX1106	-	^{02 Ala tRNA}
1240761	1240835	-	75	58038491	GOX1129	-	tRNA-Gln-TTG
1262881	1264358	+	1478	58038491	GOX1156	-	16S ribosomal RNA
1264488	1264564	+	77	58038491	GOX1157	-	^{14 Ile tRNA}
1264571	1264646	+	76	58038491	GOX1158	-	^{02 Ala tRNA}
1265021	1267729	+	2709	58038491	GOX1159	-	23S ribosomal RNA
1267830	1267946	+	117	58038491	GOX1160	-	5S ribosomal RNA
1267998	1268074	+	77	58038491	GOX1161	-	^{16 Met tRNA}
1426321	1426396	+	76	58038491	GOX1301	-	^{12 Thr tRNA}
1431357	1431433	-	77	58038491	GOX1307	-	tRNA-Trp-CCA
1431603	1431676	+	74	58038491	GOX1308	-	tRNA-Gly-TCC
1438241	1439718	+	1478	58038491	GOX1316	-	16S ribosomal RNA
1439848	1439924	+	77	58038491	GOX1317	-	^{14 Ile tRNA}
1439931	1440006	+	76	58038491	GOX1318	-	^{02 Ala tRNA}
1440381	1443091	+	2711	58038491	GOX1319	-	23S ribosomal RNA
1443190	1443308	+	119	58038491	GOX1320	-	5S ribosomal RNA
1443360	1443436	+	77	58038491	GOX1321	-	^{16 Met tRNA}
1534827	1534912	-	86	58038491	GOX1404	-	^{15 Leu tRNA}
1561069	1561143	-	75	58038491	GOX1428	-	^{12 Thr tRNA}
1580920	1581003	+	84	58038491	GOX1445	-	^{15 Leu tRNA}
1603897	1605374	+	1478	58038491	GOX1464	-	16S ribosomal RNA
1605504	1605580	+	77	58038491	GOX1465	-	^{14 Ile tRNA}
1605587	1605662	+	76	58038491	GOX1466	-	^{02 Ala tRNA}
1606037	1608746	+	2710	58038491	GOX1467	-	23S ribosomal RNA
1608845	1608963	+	119	58038491	GOX1468	-	5S ribosomal RNA
1609015	1609091	+	77	58038491	GOX1469	-	^{16 Met tRNA}
1667365	1667440	-	76	58038491	GOX1514	-	^{04 Glu tRNA}
1694977	1695053	-	77	58038491	GOX1547	-	^{06 Asp tRNA}
1829726	1829799	+	74	58038491	GOX1672	-	^{01 Gly tRNA}
1884198	1884274	-	77	58038491	GOX1722	-	^{11 Arg tRNA}
2018403	2018489	-	87	58038491	GOX1848	-	^{15 Leu tRNA}
2138191	2138267	-	77	58038491	GOX1947	-	^{11 Arg tRNA}
2138302	2138378	-	77	58038491	GOX1948	-	^{11 Arg tRNA}
2406797	2406871	-	75	58038491	GOX2196	-	^{13 Val tRNA}
2452789	2452879	-	91	58038491	GOX2233	-	^{08 Ser tRNA}
2482740	2482813	+	74	58038491	GOX2264	-	^{05 Gln tRNA}
2537909	2537983	+	75	58038491	GOX2317	-	^{13 Val tRNA}
2592569	2592661	-	93	58038491	GOX2381	-	^{08 Ser tRNA}
2683356	2683429	-	74	58038491	GOX2486	-	^{19 Cys tRNA}