Геном прокариот/Материалы:NC 008508

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 008508»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008508            3614446 bp    DNA     circular BCT 02-JUL-2007
   DEFINITION  Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1,
               complete sequence.
   ACCESSION   NC_008508
   VERSION     NC_008508.1  GI:116326852
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
     ORGANISM  Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
               Bacteria; Spirochaetes; Spirochaetales; Leptospiraceae; Leptospira.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3614446)
     AUTHORS   Bulach,D.M., Zuerner,R.L., Wilson,P., Seemann,T., McGrath,A.,
               Cullen,P.A., Davis,J., Johnson,M., Kuczek,E., Alt,D.P.,
               Peterson-Burch,B., Coppel,R.L., Rood,J.I., Davies,J.K. and Adler,B.
     TITLE     Genome reduction in Leptospira borgpetersenii reflects limited
               transmission potential
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (39), 14560-14565 (2006)
      PUBMED   16973745
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3614446)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (21-OCT-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3614446)
     AUTHORS   Bulach,D.M., Zuerner,R.L., Wilson,P., Seemann,T., McGrath,A.,
               Cullen,P., Davies,J., Kuczek,E., Alt,D., Peterson-Burch,B.,
               Coppel,R., Rood,J., Davis,J. and Adler,B.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (30-JAN-2006) Department of Microbiology, Monash
               University, Building 53, Clayton, Victoria 3800, Australia
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000348.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
42684 42767 + 84 116326852 LBL_0035 - 15 Leu tRNA
65820 65903 + 84 116326852 LBL_0053 - 08 Ser tRNA
65916 66002 + 87 116326852 LBL_0054 - 08 Ser tRNA
66860 66936 + 77 116326852 LBL_0057 - 11 Arg tRNA
72555 72638 + 84 116326852 LBL_0063 - 08 Ser tRNA
98747 98818 - 72 116326852 LBL_0084 - 01 Gly tRNA
450708 450782 - 75 116326852 LBL_0385 - 04 Glu tRNA
450800 450872 - 73 116326852 LBL_0386 - 10 Lys tRNA
474707 474779 + 73 116326852 LBL_0404 - 17 Phe tRNA
544311 544383 + 73 116326852 LBL_0495 - 12 Thr tRNA
544394 544475 + 82 116326852 LBL_0496 - 18 Tyr tRNA
579651 579726 - 76 116326852 LBL_0527 - 05 Gln tRNA
670298 670374 + 77 116326852 LBL_0598 - 13 Val tRNA
687712 687783 + 72 116326852 LBL_0612 - 03 Pro tRNA
687798 687874 + 77 116326852 LBL_0613 - 11 Arg tRNA
687890 687965 + 76 116326852 LBL_0614 - 09 His tRNA
713372 713444 - 73 116326852 LBL_0640 - 02 Ala tRNA
713459 713532 - 74 116326852 LBL_0641 - 14 Ile tRNA
833225 833296 + 72 116326852 LBL_0735 - 12 Thr tRNA
833308 833381 + 74 116326852 LBL_0736 - 20 Trp tRNA
909835 909916 + 82 116326852 LBL_0796 - 15 Leu tRNA
1345059 1345130 + 72 116326852 LBL_1139 - 01 Gly tRNA
1536776 1536858 - 83 116326852 LBL_1306 - 15 Leu tRNA
1537733 1537806 + 74 116326852 LBL_1308 - 06 Asp tRNA
1595404 1595474 + 71 116326852 LBL_1363 - 19 Cys tRNA
1595612 1595697 + 86 116326852 LBL_1364 - 15 Leu tRNA
1698993 1700503 + 1511 116326852 LBL_1455 - 16S ribosomal RNA
1708991 1709063 - 73 116326852 LBL_1461 - 02 Ala tRNA
1753924 1753999 + 76 116326852 LBL_1496 - 07 Asn tRNA
2084477 2084550 + 74 116326852 LBL_1792 - 16 Met tRNA
2324743 2324816 + 74 116326852 LBL_1993 - 16 Met tRNA
2370219 2370302 + 84 116326852 LBL_2028 - 15 Leu tRNA
2403588 2403660 + 73 116326852 LBL_2051 - 16 Met tRNA
2626134 2627642 - 1509 116326852 LBL_2229 - 16S ribosomal RNA
2654254 2655962 - 1709 116326852 LBL_2252 - 23S ribosomal RNA
2656650 2657830 - 1181 116326852 LBL_2252 - 23S ribosomal RNA
2746146 2746217 + 72 116326852 LBL_2322 - 11 Arg tRNA
2854378 2854449 + 72 116326852 LBL_2406 - 03 Pro tRNA
3201760 3201836 + 77 116326852 LBL_2701 - 11 Arg tRNA
3213849 3213921 - 73 116326852 LBL_2711 - 13 Val tRNA
3289705 3291413 - 1709 116326852 LBL_2775 - 23S ribosomal RNA
3292101 3293281 - 1181 116326852 LBL_2775 - 23S ribosomal RNA
3416424 3416495 + 72 116326852 LBL_2862 - 12 Thr tRNA
3492844 3492960 - 117 116326852 LBL_2939 - 5S ribosomal RNA