Обсуждение:Геном прокариот

Вот я - человек далекий от биоинформатики, скажите сколько связей примерно будут иметь Ваши графы, Вы ,я полагаю, хотите сделать некое обобщение и затем с помощью математической статистики определить наиболее вероятные сходства различных организмов, но с точки зрения математики эти действия довольно-таки приблизительные, и хотелось бы узнать какие еще существуют методы решения этого вопроса, их плюсы и минусы.

Я тоже не являюсь специалистом, я так сказать любитель. Количество связей - незнаю, столько сколько потребуется (но учитывая иерархичность систематики не сильно много). Вы видили первый набросок на основе Ala tRNA (наверное, нет ... я добавил информацию) ? Думаю говорить здесь о статистики можно, но не совсем правильно. Когда два организма имеют одинаковую тРНК - это не случайность, это 100% указание на их сходство по данной РНК (т.е. предмета для вероятности нету). Таким образом, подтвержадается, что текущая систематика относительно семейств достаточно права, т.к. виды семейства зачастую имеют идентичные РНК. Но не все, находятся виды семейства, которые связанны с другими семействами - на основе них можно найти связи того как разошлись при эволюции различные семейства. Поэтому я считаю это 100% способ найти связи. А вот именно другие способы, которые строятся на выравнивании рРНК и ее статистического сравнения - вот это и есть очень приблизительные способы. Я не могу утверждать, что я знаю другие способы ... если кто-то с этим знаком, мы можем как раз это обсудить в рамках данного проекта. прошу зарегистрируйтесь, и подписывайте свои сообщения набирая ~~~~ S.J. 18:35, 17 September 2009 (UTC)