Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 002932

Материал из Викиверситета
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_002932            2154946 bp    DNA     circular BCT 02-DEC-2005
   DEFINITION  Chlorobium tepidum TLS, complete genome.
   ACCESSION   NC_002932
   VERSION     NC_002932.3  GI:21672841
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Chlorobium tepidum TLS
     ORGANISM  Chlorobium tepidum TLS
               Bacteria; Chlorobi; Chlorobia; Chlorobiales; Chlorobiaceae;
               Chlorobaculum.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2154946)
     AUTHORS   Eisen,J.A., Nelson,K.E., Paulsen,I.T., Heidelberg,J.F., Wu,M.,
               Dodson,R.J., Deboy,R., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Haft,D.H.,
               Hickey,E.K., Peterson,J.D., Durkin,A.S., Kolonay,J.L., Yang,F.,
               Holt,I., Umayam,L.A., Mason,T., Brenner,M., Shea,T.P., Parksey,D.,
               Nierman,W.C., Feldblyum,T.V., Hansen,C.L., Craven,M.B., Radune,D.,
               Vamathevan,J., Khouri,H., White,O., Gruber,T.M., Ketchum,K.A.,
               Venter,J.C., Tettelin,,H., Bryant,D.A. and Fraser,C.M.
     TITLE     The complete genome sequence of Chlorobium tepidum TLS, a
               photosynthetic, anaerobic, green-sulfur bacterium
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (14), 9509-9514 (2002)
      PUBMED   12093901
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2154946)
     AUTHORS   Eisen,J.A., Nelson,K.E., Paulsen,I.T., Heidelberg,J.F., Wu,M.,
               Dodson,R.J., Deboy,R., Gwinn,M.L., Nelson,W.C., Haft,D.H.,
               Hickey,E.K., Peterson,J.D., Durkin,A.S., Kolonay,J.L., Yang,F.,
               Holt,I., Umayam,L.A., Mason,T., Brenner,M., Shea,T.P., Parksey,D.,
               Nierman,W.C., Feldblyum,T.V., Hansen,C.L., Craven,M.B., Radune,D.,
               Vamathevan,J., Khouri,H., White,O., Gruber,T.M., Ketchum,K.A.,
               Venter,J.C., Tettelin,,H., Bryant,D.A. and Fraser,C.M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (30-APR-2002) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2154946)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-APR-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE006470.
               On Jul 2, 2002 this sequence version replaced gi:21327749.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
16802 16877 - 76 21672841 CTt01 - 02 Ala tRNA
120624 120700 + 77 21672841 CTt02 - 13 Val tRNA
139488 140936 + 1449 21672841 CTrrnaA16S - 16S ribosomal RNA
141140 141216 + 77 21672841 CTt03 - 14 Ile tRNA
141260 141335 + 76 21672841 CTt04 - 02 Ala tRNA
141462 144223 + 2762 21672841 CTrrnaA23S - 23S ribosomal RNA
144491 144599 + 109 21672841 CTrrnaA5S - 5S ribosomal RNA
152008 152083 + 76 21672841 CTt05 - 12 Thr tRNA
152097 152179 + 83 21672841 CTt06 - 18 Tyr tRNA
152200 152275 + 76 21672841 CTt07 - 12 Thr tRNA
152295 152367 + 73 21672841 CTt08 - 20 Trp tRNA
188766 188842 + 77 21672841 CTt09 - 03 Pro tRNA
204273 204361 - 89 21672841 CTt10 - 15 Leu tRNA
210478 210566 - 89 21672841 CTt11 - 15 Leu tRNA
275856 275928 + 73 21672841 CTt12 - 10 Lys tRNA
275966 276047 + 82 21672841 CTt13 - 15 Leu tRNA
311834 311909 + 76 21672841 CTt14 - 17 Phe tRNA
331227 331299 - 73 21672841 CTt15 - 02 Ala tRNA
421537 421610 + 74 21672841 CTt16 - 13 Val tRNA
523363 523449 - 87 21672841 CTt17 - 08 Ser tRNA
526535 526610 - 76 21672841 CTt18 - 01 Gly tRNA
526817 526892 - 76 21672841 CTt19 - 01 Gly tRNA
558455 558527 - 73 21672841 CTt20 - 05 Gln tRNA
563295 563371 - 77 21672841 CTt21 - 11 Arg tRNA
563410 563486 - 77 21672841 CTt22 - 04 Glu tRNA
563510 563586 - 77 21672841 CTt23 - 16 Met tRNA
701232 701306 + 75 21672841 CTt24 - 05 Gln tRNA
710320 710395 + 76 21672841 CTt25 - 03 Pro tRNA
710427 710500 + 74 21672841 CTt26 - 11 Arg tRNA
710528 710604 + 77 21672841 CTt27 - 09 His tRNA
710656 710727 + 72 21672841 CTt28 - 04 Glu tRNA
717274 717349 + 76 21672841 CTt29 - 10 Lys tRNA
736072 736155 - 84 21672841 CTt30 - 15 Leu tRNA
736182 736263 - 82 21672841 CTt31 - 15 Leu tRNA
756229 756304 - 76 21672841 CTt32 - 16 Met tRNA
771728 771803 + 76 21672841 CTt33 - 11 Arg tRNA
771819 771891 + 73 21672841 CTt34 - 03 Pro tRNA
915378 915453 + 76 21672841 CTt35 - 16 Met tRNA
1080477 1080550 + 74 21672841 CTt36 - 19 Cys tRNA
1199337 1199413 + 77 21672841 CTt37 - 13 Val tRNA
1208543 1208632 - 90 21672841 CTt38 - 08 Ser tRNA
1208645 1208727 - 83 21672841 CTt39 - 08 Ser tRNA
1208802 1208892 - 91 21672841 CTt40 - 08 Ser tRNA
1240837 1240910 + 74 21672841 CTt41 - 16 Met tRNA
1240961 1241033 + 73 21672841 CTt42 - 01 Gly tRNA
1291102 1291186 + 85 21672841 CTt43 - 15 Leu tRNA
1738672 1738746 + 75 21672841 CTt44 - 06 Asp tRNA
1923584 1923656 - 73 21672841 CTt45 - 11 Arg tRNA
1998393 1998467 - 75 21672841 CTt46 - 07 Asn tRNA
2031717 2031825 - 109 21672841 CTrrnaB5S - 5S ribosomal RNA
2032093 2034854 - 2762 21672841 CTrrnaB23S - 23S ribosomal RNA
2034981 2035056 - 76 21672841 CTt47 - 02 Ala tRNA
2035100 2035176 - 77 21672841 CTt48 - 14 Ile tRNA
2035380 2036828 - 1449 21672841 CTrrnaB16S - 16S ribosomal RNA
2058896 2058968 - 73 21672841 CTt49 - 01 Gly tRNA
2097742 2097814 + 73 21672841 CTt50 - 12 Thr tRNA