Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 003272

Добавить ссылки
Материал из Викиверситета
 Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»
   LOCUS       NC_003272            6413771 bp    DNA     circular BCT 09-JAN-2006
   DEFINITION  Nostoc sp. PCC 7120, complete genome.
   ACCESSION   NC_003272
   VERSION     NC_003272.1  GI:17227497
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Nostoc sp. PCC 7120
     ORGANISM  Nostoc sp. PCC 7120
               Bacteria; Cyanobacteria; Nostocales; Nostocaceae; Nostoc.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Kaneko,T., Nakamura,Y., Wolk,C.P., Kuritz,T., Sasamoto,S.,
               Watanabe,A., Iriguchi,M., Ishikawa,A., Kawashima,K., Kimura,T.,
               Kishida,Y., Kohara,M., Matsumoto,M., Matsuno,A., Muraki,A.,
               Nakazaki,N., Shimpo,S., Sugimoto,M., Takazawa,M., Yamada,M.,
               Yasuda,M. and Tabata,S.
     TITLE     Complete genomic sequence of the filamentous nitrogen-fixing
               cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120
     JOURNAL   DNA Res. 8 (5), 205-213 (2001)
      PUBMED   11759840
   REFERENCE   2  (bases 1 to 6413771)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-DEC-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 6413771)
     AUTHORS   Kaneko,T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (02-MAY-2001) The First Laboratory for Plant Gene
               Research, Kazusa DNA Research Institute, Yana 1532-3, Kisarazu,
               Chiba 292-0812, Japan
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BA000019.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
2858 3247 - 390 17227497 allrs01 - 10Sa RNA
115865 115938 + 74 17227497 allrt01 - Anticodon: TGG
179865 179948 - 84 17227497 allrt02 - Anticodon: CAA
185099 185180 + 82 17227497 allrt03 - Anticodon: CAG
262327 262400 - 74 17227497 allrt04 - Anticodon: CCT
449237 449309 + 73 17227497 allrt05 - Anticodon: TGC
605200 605272 - 73 17227497 allrt06 - Anticodon: TAC
610399 610471 - 73 17227497 allrt07 - Anticodon: GTG
860747 860825 + 79 17227497 allrt08 - Anticodon: GTT
955535 955607 - 73 17227497 allrt09 - Anticodon: GAA
979233 979305 + 73 17227497 allrt10 - Anticodon: TTC
1092279 1092359 - 81 17227497 allrt11 - Anticodon: GAG
1368658 1368751 - 94 17227497 allrs02 - probable 7SL RNA
1592150 1592222 + 73 17227497 allrt12 - Anticodon: TCT
1819470 1819552 + 83 17227497 allrt13 - Anticodon: GTA
1819613 1819684 + 72 17227497 allrt14 - Anticodon: GGT
1819777 1819848 - 72 17227497 allrt15 - Anticodon: CCC
1891880 1891951 - 72 17227497 allrt16 - Anticodon: TTG
2024850 2024923 + 74 17227497 allrt17 - Anticodon: CGG
2199183 2199274 + 92 17227497 allrt18 - Anticodon: GCT
2375734 2377222 + 1489 17227497 allrr01 - 16S ribosomal RNA
2377341 2377414 + 74 17227497 allrt19 - Anticodon: GAT
2377501 2377573 + 73 17227497 allrt20 - Anticodon: TGC
2377736 2378934 + 1199 17227497 allrr02 - 23S ribosomal RNA
2380406 2382034 + 1629 17227497 allrr02 - 23S ribosomal RNA
2382093 2382211 + 119 17227497 allrr03 - 5S ribosomal RNA
2500525 2502013 + 1489 17227497 allrr04 - 16S ribosomal RNA
2502132 2502205 + 74 17227497 allrt21 - Anticodon: GAT
2502292 2502364 + 73 17227497 allrt22 - Anticodon: TGC
2502527 2505354 + 2828 17227497 allrr05 - 23S ribosomal RNA
2505413 2505531 + 119 17227497 allrr06 - 5S ribosomal RNA
2845521 2845593 - 73 17227497 allrt23 - Anticodon: CCG
2955182 2955263 + 82 17227497 allrt24 - Anticodon: TAG
3274884 3274956 + 73 17227497 allrt25 - Anticodon: GGC
3305791 3305862 + 72 17227497 allrt26 - Anticodon: TTT
3340713 3340901 - 189 17227497 allrs03 - 6Sa RNA
3531859 3531932 + 74 17227497 allrt27 - Anticodon: GAC
3560617 3560703 + 87 17227497 allrt28 - Anticodon: GGA
3757004 3757090 + 87 17227497 allrt29 - Anticodon: CGA
3872407 3872480 - 74 17227497 allrt30 - Anticodon: GTC
4093879 4093952 - 74 17227497 allrt31 - Anticodon: ACG
4220061 4220131 - 71 17227497 allrt32 - Anticodon: TCC
4252006 4252078 + 73 17227497 allrt33 - Anticodon: CGC
4360902 4360973 + 72 17227497 allrt34 - Anticodon: CGT
4812562 4812633 + 72 17227497 allrt35 - Anticodon: GCC
4914765 4914883 - 119 17227497 allrr07 - 5S ribosomal RNA
4914942 4917769 - 2828 17227497 allrr08 - 23S ribosomal RNA
4917932 4918004 - 73 17227497 allrt36 - Anticodon: TGC
4918091 4918164 - 74 17227497 allrt37 - Anticodon: GAT
4918283 4919771 - 1489 17227497 allrr09 - 16S ribosomal RNA
4950355 4950814 - 460 17227497 allrs04 - RNA subunit of RNase P
5019099 5019172 + 74 17227497 allrt38 - Anticodon: CAT
5438588 5438659 - 72 17227497 allrt39 - Anticodon: GTT
5542179 5542252 + 74 17227497 allrt40 - Anticodon: CAT
5553520 5553593 + 74 17227497 allrt41 - Anticodon: GGG
5575828 5575912 + 85 17227497 allrt42 - Anticodon: TGA
5727652 5727702 - 51 17227497 allrt43 - 15 Leu tRNA
5727952 5727985 - 34 17227497 allrt43 - 15 Leu tRNA
5852885 5852956 - 72 17227497 allrt44 - Anticodon: TGT
5942409 5942527 - 119 17227497 allrr10 - 5S ribosomal RNA
5942586 5945413 - 2828 17227497 allrr11 - 23S ribosomal RNA
5945700 5947188 - 1489 17227497 allrr12 - 16S ribosomal RNA
6070047 6070119 + 73 17227497 allrt45 - Anticodon: CAT
6291864 6291935 + 72 17227497 allrt46 - Anticodon: CTT
6320575 6320647 + 73 17227497 allrt47 - Anticodon: CCA
6370266 6370337 - 72 17227497 allrt48 - Anticodon: GCA
Источник — https://ru.wikiversity.org/w/index.php?title=Геном_прокариот/Материалы:NC_003272&oldid=156259