Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 005861

Материал из Викиверситета
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_005861            2414465 bp    DNA     circular BCT 19-DEC-2005
   DEFINITION  Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
   ACCESSION   NC_005861
   VERSION     NC_005861.1  GI:46445634
   KEYWORDS    complete genome.
   SOURCE      Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25
     ORGANISM  Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25
               Bacteria; Chlamydiae; Chlamydiales; Parachlamydiaceae; Candidatus
               Protochlamydia.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2414465)
     AUTHORS   Horn,M., Collingro,A., Schmitz-Esser,S., Beier,C.L., Purkhold,U.,
               Fartmann,B., Brandt,P., Nyakatura,G.J., Droege,M., Frishman,D.,
               Rattei,T., Mewes,H.W. and Wagner,M.
     TITLE     Illuminating the evolutionary history of chlamydiae
     JOURNAL   Science 304 (5671), 728-730 (2004)
      PUBMED   15073324
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2414465)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (21-APR-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2414465)
     AUTHORS   Horn,M., Collingro,A., Schmitz-Esser,S., Beier,C.L., Purkhold,U.,
               Fartmann,B., Brandt,P., Nyakatura,G.J., Droege,M., Frishman,D.,
               Rattei,T., Mewes,H. and Wagner,M.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (15-JAN-2003) Submitted by Matthias Horn, Department of
               Microbial Ecology, University of Vienna, Althanstr. 14, A-1090
               Wien, Austria, Email: horn@microbial-ecology.net Complete
               annotation available at: http://mips.gsf.de/services/genomes/uwe25
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from BX908798.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
37322 37395 - 74 46445634 pct01 - Anticodon: ACG
128380 128452 + 73 46445634 pct02 - Anticodon: GGC
208862 208932 + 71 46445634 pct03 - Anticodon: TCC
310157 310229 + 73 46445634 pct04 - Anticodon: GAA
435123 435196 - 74 46445634 pct05 - Anticodon: CCT
442137 442220 - 84 46445634 pct06 - Anticodon: CAG
450594 450676 + 83 46445634 pct07 - Anticodon: CAA
463504 463576 - 73 46445634 pct08 - Anticodon: TCG
464404 464487 + 84 46445634 pct09 - Anticodon: GAG
486773 486845 - 73 46445634 pct10 - Anticodon: TCT
566025 566108 + 84 46445634 pct11 - Anticodon: TAA
606996 607069 - 74 46445634 pct12 - Anticodon: GTG
641151 641223 + 73 46445634 pct13 - Anticodon: CAT
732847 732918 + 72 46445634 pct14 - Anticodon: GGT
734222 734294 + 73 46445634 pct15 - Anticodon: CCA
768930 769017 - 88 46445634 pct16 - Anticodon: TGA
853577 853650 + 74 46445634 pct17 - Anticodon: GAC
878495 878576 + 82 46445634 pct18 - Anticodon: TAG
958032 958105 - 74 46445634 pct19 - Anticodon: GTC
958118 958190 - 73 46445634 pct20 - Anticodon: TAC
1013700 1013772 + 73 46445634 pct21 - Anticodon: CAT
1013785 1013857 + 73 46445634 pct22 - Anticodon: CAT
1039856 1039937 - 82 46445634 pct23 - Anticodon: GTA
1039951 1040023 - 73 46445634 pct24 - Anticodon: TGT
1227275 1227391 - 117 46445634 pcr01 - 5S ribosomal RNA
1227524 1230471 - 2948 46445634 pcr02 - 23S ribosomal RNA
1230812 1232292 - 1481 46445634 pcr03 - 16S ribosomal RNA
1296930 1297004 + 75 46445634 pct25 - Anticodon: TGG
1408186 1408257 + 72 46445634 pct26 - Anticodon: GTT
1499806 1499877 + 72 46445634 pct27 - Anticodon: GCA
1648172 1648243 + 72 46445634 pct28 - Anticodon: GCC
1648332 1648403 + 72 46445634 pct29 - Anticodon: GCC
1857631 1857747 - 117 46445634 pcr04 - 5S ribosomal RNA
1857880 1858685 - 806 46445634 pcr05 - 23S ribosomal RNA
1858686 1859583 - 898 46445634 pcr06 - 16S ribosomal RNA
1910152 1910223 - 72 46445634 pct30 - Anticodon: TTG
2127797 2127913 - 117 46445634 pcr07 - 5S ribosomal RNA
2128046 2130993 - 2948 46445634 pcr08 - 23S ribosomal RNA
2131334 2132814 - 1481 46445634 pcr09 - 16S ribosomal RNA
2160172 2160259 - 88 46445634 pct31 - Anticodon: GCT
2164508 2164595 + 88 46445634 pct32 - Anticodon: GGA
2236176 2236249 - 74 46445634 pct33 - Anticodon: TTT
2236254 2236328 - 75 46445634 pct34 - Anticodon: TTC
2387508 2387582 - 75 46445634 pct35 - Anticodon: GGG