Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 008510

Материал из Викиверситета
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_008510            3576473 bp    DNA     circular BCT 08-AUG-2007
   DEFINITION  Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome 1,
               complete sequence.
   ACCESSION   NC_008510
   VERSION     NC_008510.1  GI:116329799
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
     ORGANISM  Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
               Bacteria; Spirochaetes; Spirochaetales; Leptospiraceae; Leptospira.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 3576473)
     AUTHORS   Bulach,D.M., Zuerner,R.L., Wilson,P., Seemann,T., McGrath,A.,
               Cullen,P.A., Davis,J., Johnson,M., Kuczek,E., Alt,D.P.,
               Peterson-Burch,B., Coppel,R.L., Rood,J.I., Davies,J.K. and Adler,B.
     TITLE     Genome reduction in Leptospira borgpetersenii reflects limited
               transmission potential
     JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (39), 14560-14565 (2006)
      PUBMED   16973745
   REFERENCE   2  (bases 1 to 3576473)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (21-OCT-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 3576473)
     AUTHORS   Zuerner,R.L., Bulach,D.M., Wilson,P., Seemann,T., McGrath,A.,
               Cullen,P.A., Davis,J., Johnson,M., Kuczek,E., Alt,D.P.,
               Petersen-Burch,B., Coppel,R.L., Rood,J.I., Davies,J.K. and Adler,B.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (18-APR-2006) Bacterial Diseases of Livestock Research
               Unit, National Animal Disease Center, 2300 N. Dayton Rd, Ames, IA
               50010, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000350.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
94588 94664 - 77 116329799 LBJ_0079 - 11 Arg tRNA
95522 95608 - 87 116329799 LBJ_0082 - 08 Ser tRNA
95621 95704 - 84 116329799 LBJ_0083 - 08 Ser tRNA
118763 118846 - 84 116329799 LBJ_0100 - 15 Leu tRNA
177989 178105 + 117 116329799 LBJ_0144 - 5S ribosomal RNA
254437 254508 - 72 116329799 LBJ_0220 - 12 Thr tRNA
367453 368687 + 1235 116329799 LBJ_0300 - 23S ribosomal RNA
369352 371084 + 1733 116329799 LBJ_0300 - 23S ribosomal RNA
448341 448413 + 73 116329799 LBJ_0366 - 13 Val tRNA
460432 460508 - 77 116329799 LBJ_0376 - 11 Arg tRNA
807856 807927 - 72 116329799 LBJ_0673 - 03 Pro tRNA
915831 915902 - 72 116329799 LBJ_0756 - 11 Arg tRNA
1004953 1006187 + 1235 116329799 LBJ_0828 - 23S ribosomal RNA
1006852 1008584 + 1733 116329799 LBJ_0828 - 23S ribosomal RNA
1174413 1174485 - 73 116329799 LBJ_0982 - 16 Met tRNA
1207755 1207838 - 84 116329799 LBJ_1006 - 15 Leu tRNA
1253242 1253315 - 74 116329799 LBJ_1041 - 16 Met tRNA
1302922 1302993 + 72 116329799 LBJ_1082 - 01 Gly tRNA
1512115 1512190 + 76 116329799 LBJ_1271 - 07 Asn tRNA
1842930 1843003 + 74 116329799 LBJ_1568 - 16 Met tRNA
2124459 2124532 - 74 116329799 LBJ_1799 - 06 Asp tRNA
2125407 2125489 + 83 116329799 LBJ_1801 - 15 Leu tRNA
2152752 2152824 + 73 116329799 LBJ_1822 - 02 Ala tRNA
2161284 2162792 - 1509 116329799 LBJ_1828 - 16S ribosomal RNA
2266109 2266194 - 86 116329799 LBJ_1920 - 15 Leu tRNA
2266332 2266402 - 71 116329799 LBJ_1921 - 19 Cys tRNA
2659392 2660900 - 1509 116329799 LBJ_2236 - 16S ribosomal RNA
2762054 2762135 - 82 116329799 LBJ_2311 - 15 Leu tRNA
2838603 2838676 - 74 116329799 LBJ_2372 - 20 Trp tRNA
2838688 2838759 - 72 116329799 LBJ_2373 - 12 Thr tRNA
2960701 2960774 + 74 116329799 LBJ_2471 - 14 Ile tRNA
2960789 2960861 + 73 116329799 LBJ_2472 - 02 Ala tRNA
2973942 2974013 + 72 116329799 LBJ_2483 - 03 Pro tRNA
2974028 2974104 + 77 116329799 LBJ_2484 - 11 Arg tRNA
2974120 2974195 + 76 116329799 LBJ_2485 - 09 His tRNA
3003900 3003976 - 77 116329799 LBJ_2514 - 13 Val tRNA
3094336 3094411 + 76 116329799 LBJ_2585 - 05 Gln tRNA
3128031 3128103 + 73 116329799 LBJ_2617 - 12 Thr tRNA
3128114 3128195 + 82 116329799 LBJ_2618 - 18 Tyr tRNA
3184813 3184885 + 73 116329799 LBJ_2678 - 17 Phe tRNA
3194124 3194196 + 73 116329799 LBJ_2687 - 10 Lys tRNA
3194214 3194288 + 75 116329799 LBJ_2688 - 04 Glu tRNA
3533958 3534029 + 72 116329799 LBJ_2981 - 01 Gly tRNA
3557438 3557521 + 84 116329799 LBJ_3000 - 08 Ser tRNA