Перейти к содержанию

Геном прокариот/Материалы:NC 009009

Материал из Викиверситета
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_009009            2388435 bp    DNA     circular BCT 16-FEB-2007
   DEFINITION  Streptococcus sanguinis SK36, complete genome.
   ACCESSION   NC_009009
   VERSION     NC_009009.1  GI:125716887
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Streptococcus sanguinis SK36
     ORGANISM  Streptococcus sanguinis SK36
               Bacteria; Firmicutes; Lactobacillales; Streptococcaceae;
               Streptococcus.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 2388435)
     AUTHORS   Xu,P., Alves,J.M., Kitten,T., Brown,A., Chen,Z., Ozaki,L.S.,
               Manque,P., Ge,X., Serrano,M.G., Puiu,D., Hendricks,S., Wang,Y.,
               Chaplin,M.D., Akan,D., Paik,S., Peterson,D.L., Macrina,F.L. and
               Buck,G.A.
     TITLE     Genome of the opportunistic pathogen Streptococcus sanguinis
     JOURNAL   (er) J. Bacteriol. (2007) In press
      PUBMED   17277061
   REFERENCE   2  (bases 1 to 2388435)
     AUTHORS   Xu,P., Alves,J.M., Kitten,T., Peterson,D.L., Macrina,F. and
               Buck,G.A.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (07-JUN-2006) Virginia Commonwealth University, Philips
               Institute, Richmond, VA 23298, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 2388435)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (03-NOV-2000) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000387.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
15263 15334 + 72 125716887 SSA_2412 - 04 Glu tRNA
15340 15416 + 77 125716887 SSA_2413 - 07 Asn tRNA
16379 17929 + 1551 125716887 SSA_2400 - 16S small subunit ribosomal RNA
17991 18063 + 73 125716887 SSA_2414 - 02 Ala tRNA
18190 21087 + 2898 125716887 SSA_2404 - 23S large subunit ribosomal RNA
21206 21321 + 116 125716887 SSA_2408 - 5S ribosomal RNA
21325 21397 + 73 125716887 SSA_2415 - 13 Val tRNA
21414 21486 + 73 125716887 SSA_2416 - 06 Asp tRNA
21519 21591 + 73 125716887 SSA_2417 - 10 Lys tRNA
21597 21678 + 82 125716887 SSA_2418 - 15 Leu tRNA
21695 21767 + 73 125716887 SSA_2419 - 12 Thr tRNA
21782 21853 + 72 125716887 SSA_2420 - 01 Gly tRNA
21861 21946 + 86 125716887 SSA_2421 - 15 Leu tRNA
21978 22051 + 74 125716887 SSA_2422 - 11 Arg tRNA
22071 22144 + 74 125716887 SSA_2423 - 03 Pro tRNA
22150 22223 + 74 125716887 SSA_2424 - 16 Met tRNA
22237 22310 + 74 125716887 SSA_2425 - 16 Met tRNA
22323 22412 + 90 125716887 SSA_2426 - 08 Ser tRNA
22432 22505 + 74 125716887 SSA_2427 - 16 Met tRNA
22511 22583 + 73 125716887 SSA_2428 - 17 Phe tRNA
22604 22674 + 71 125716887 SSA_2429 - 01 Gly tRNA
22708 22781 + 74 125716887 SSA_2430 - 14 Ile tRNA
22791 22878 + 88 125716887 SSA_2431 - 08 Ser tRNA
124363 125913 + 1551 125716887 SSA_2401 - 16S small subunit ribosomal RNA
125975 126047 + 73 125716887 SSA_2432 - 02 Ala tRNA
126174 129073 + 2900 125716887 SSA_2405 - 23S large subunit ribosomal RNA
129192 129307 + 116 125716887 SSA_2409 - 5S ribosomal RNA
129311 129383 + 73 125716887 SSA_2433 - 13 Val tRNA
129391 129461 + 71 125716887 SSA_2434 - 01 Gly tRNA
129495 129568 + 74 125716887 SSA_2435 - 14 Ile tRNA
129584 129655 + 72 125716887 SSA_2436 - 04 Glu tRNA
129663 129752 + 90 125716887 SSA_2437 - 08 Ser tRNA
129772 129845 + 74 125716887 SSA_2438 - 16 Met tRNA
129851 129923 + 73 125716887 SSA_2439 - 17 Phe tRNA
129937 130017 + 81 125716887 SSA_2440 - 18 Tyr tRNA
130026 130096 + 71 125716887 SSA_2441 - 20 Trp tRNA
130107 130179 + 73 125716887 SSA_2442 - 09 His tRNA
130193 130264 + 72 125716887 SSA_2443 - 05 Gln tRNA
130277 130360 + 84 125716887 SSA_2444 - 15 Leu tRNA
228378 228450 - 73 125716887 SSA_2472 - 10 Lys tRNA
230927 230999 - 73 125716887 SSA_2471 - 10 Lys tRNA
807051 807141 + 91 125716887 SSA_2445 - 08 Ser tRNA
1245602 1245673 - 72 125716887 SSA_2470 - 11 Arg tRNA
1247126 1247197 - 72 125716887 SSA_2469 - 05 Gln tRNA
1247211 1247291 - 81 125716887 SSA_2468 - 18 Tyr tRNA
1290162 1290233 - 72 125716887 SSA_2467 - 11 Arg tRNA
1617445 1617517 - 73 125716887 SSA_2466 - 12 Thr tRNA
1823484 1823560 - 77 125716887 SSA_2465 - 03 Pro tRNA
1823607 1823680 - 74 125716887 SSA_2464 - 11 Arg tRNA
1823738 1823811 - 74 125716887 SSA_2463 - 11 Arg tRNA
1823843 1823928 - 86 125716887 SSA_2462 - 15 Leu tRNA
1823936 1824007 - 72 125716887 SSA_2461 - 01 Gly tRNA
1824022 1824094 - 73 125716887 SSA_2460 - 12 Thr tRNA
1824111 1824192 - 82 125716887 SSA_2459 - 15 Leu tRNA
1824198 1824270 - 73 125716887 SSA_2458 - 10 Lys tRNA
1824303 1824375 - 73 125716887 SSA_2457 - 06 Asp tRNA
1824392 1824464 - 73 125716887 SSA_2456 - 13 Val tRNA
1824468 1824583 - 116 125716887 SSA_2410 - 5S ribosomal RNA
1824702 1827599 - 2898 125716887 SSA_2406 - 23S large subunit ribosomal RNA
1827726 1827798 - 73 125716887 SSA_2455 - 02 Ala tRNA
1827860 1829410 - 1551 125716887 SSA_2402 - 16S small subunit ribosomal RNA
1930449 1930522 - 74 125716887 SSA_2454 - 07 Asn tRNA
1930528 1930643 - 116 125716887 SSA_2411 - 5S ribosomal RNA
1930762 1933660 - 2899 125716887 SSA_2407 - 23S large subunit ribosomal RNA
1933787 1933859 - 73 125716887 SSA_2453 - 02 Ala tRNA
1933921 1935471 - 1551 125716887 SSA_2403 - 16S small subunit ribosomal RNA
1982039 1982111 - 73 125716887 SSA_2452 - 12 Thr tRNA
1990237 1990325 - 89 125716887 SSA_2451 - 15 Leu tRNA
2127192 2127274 + 83 125716887 SSA_2446 - 15 Leu tRNA
2183262 2183334 - 73 125716887 SSA_2500 - component of signal recognition particle (SRP)
2204603 2204673 + 71 125716887 SSA_2447 - 19 Cys tRNA
2383020 2383096 - 77 125716887 SSA_2450 - 07 Asn tRNA
2383102 2383173 - 72 125716887 SSA_2449 - 04 Glu tRNA
2385639 2385712 - 74 125716887 SSA_2448 - 11 Arg tRNA