Искусственный химический синтез заданной последовательности РНК
Внешний вид
Процесс
[править]- Первый нуклеотид последовательности через его 5'-фосфатную группу химически закрепляют на твердой подложке, например, полистирола.
- Все потенциально химически активные группы и атомы его нуклеинового основания (аминогруппы, кислород) временно блокируются присоединением инертной «защиты». 3'-ОН группа сахара не блокируется.
- Все нуклеотиды, подлежащие последовательному присоединению защищаются не только по нуклеиновым основаниям, но и по 3'-ОН группе РНК. Для реакции остается свободной только ОН-группа фосфорной кислоты.
- В реакционную среду вносят "защищенный" второй нуклеотид нужной последовательности
- В реакции между двумя ОН-группами отщепляется вода и устанавливается ковалентная фосфодиэфирная связь двух нуклеотидов.
- Cнимается химическая защита с 3'-ОН группы присоединившегося второго нуклеотида
- В реакционную среду вносят третий защищенный нуклеотид ... и так далее
Отщепление воды и образование фосфодиэфирной связи происходит не само собой, а в присутствии сложного химического катализатора реакции.
Автоматические синтезаторы
[править]Современные автоматические синтезаторы производят такую «сборку» олигонуклеотидов (РНК, ДНК) по заданной программе на длину до сотни нуклеиновых оснований.
Затраты на синтезирование олигонуклеотидов зависят от длины (как правило до 60-100) и количества олигонуклеотида, измеряемое в ОЕ (оптических единицах).
Ссылки
[править]- Конспект
- Синтезаторы ДНК/РНК, также можно скачать программы по управлению синтезов, работающие в демо-режиме без самого синтезатора
- Виды синтезаторов, тех. характеристики, ориентировочные цены (от 5000 EUR)
- Ориентировочные расценки за синтез
- appliedbiosystems.ru европейский производитель био. приборов и услуг
- Варианты синтеза РНК
- О процессе синтеза