Перейти к содержанию

Искусственный химический синтез заданной последовательности РНК

Материал из Викиверситета
Эта статья — часть материалов: Факультет биотехнологий

Процесс

[править]
  1. Первый нуклеотид последовательности через его 5'-фосфатную группу химически закрепляют на твердой подложке, например, полистирола.
  2. Все потенциально химически активные группы и атомы его нуклеинового основания (аминогруппы, кислород) временно блокируются присоединением инертной «защиты». 3'-ОН группа сахара не блокируется.
  3. Все нуклеотиды, подлежащие последовательному присоединению защищаются не только по нуклеиновым основаниям, но и по 3'-ОН группе РНК. Для реакции остается свободной только ОН-группа фосфорной кислоты.
  4. В реакционную среду вносят "защищенный" второй нуклеотид нужной последовательности
  5. В реакции между двумя ОН-группами отщепляется вода и устанавливается ковалентная фосфодиэфирная связь двух нуклеотидов.
  6. Cнимается химическая защита с 3'-ОН группы присоединившегося второго нуклеотида
  7. В реакционную среду вносят третий защищенный нуклеотид ... и так далее

Отщепление воды и образование фосфодиэфирной связи происходит не само собой, а в присутствии сложного химического катализатора реакции.

Автоматические синтезаторы

[править]

Современные автоматические синтезаторы производят такую «сборку» олигонуклеотидов (РНК, ДНК) по заданной программе на длину до сотни нуклеиновых оснований.

Затраты на синтезирование олигонуклеотидов зависят от длины (как правило до 60-100) и количества олигонуклеотида, измеряемое в ОЕ (оптических единицах).

Ссылки

[править]