Материалы:NC 002947

Материал из Викиверситета
Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_002947            6181863 bp    DNA     circular BCT 17-AUG-2006
   DEFINITION  Pseudomonas putida KT2440, complete genome.
   ACCESSION   NC_002947
   VERSION     NC_002947.3  GI:26986745
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Pseudomonas putida KT2440
     ORGANISM  Pseudomonas putida KT2440
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales;
               Pseudomonadaceae; Pseudomonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 6181863)
     AUTHORS   Nelson,K., Paulsen,I., Weinel,C., Dodson,R., Hilbert,H., Fouts,D.,
               Gill,S., Pop,M., Martins Dos Santos,V., Holmes,M., Brinkac,L.,
               Beanan,M., DeBoy,R., Daugherty,S., Kolonay,J., Madupu,R.,
               Nelson,W., White,O., Peterson,J., Khouri,H., Hance,I., Lee,P.,
               Holtzapple,E., Scanlan,D., Tran,K., Moazzez,A., Utterback,T.,
               Rizzo,M., Lee,K., Kosack,D., Moestl,D., Wedler,H., Lauber,J.,
               Hoheisel,J., Straetz,M., Heim,S., Kiewitz,C., Eisen,J., Timmis,K.,
               Duesterhoft,A., Tummler,B. and Fraser,C.
     TITLE     Complete genome sequence and comparative analysis of the
               metabolically versatile Pseudomonas putida KT2440
     JOURNAL   Environ. Microbiol. 4 (12), 799-808 (2002)
      PUBMED   12534463
   REFERENCE   2  (bases 1 to 6181863)
     AUTHORS   Nelson,K., Paulsen,I., Weinel,C., Dodson,R., Hilbert,H., Fouts,D.,
               Gill,S., Pop,M., Martins Dos Santos,V., Holmes,M., Brinkac,L.,
               Beanan,M., DeBoy,R., Daugherty,S., Kolonay,J., Madupu,R.,
               Nelson,W., White,O., Peterson,J., Khouri,H., Hance,I., Lee,P.,
               Holtzapple,E., Scanlan,D., Tran,K., Moazzez,A., Utterback,T.,
               Rizzo,M., Lee,K., Kosack,D., Moestl,D., Wedler,H., Lauber,J.,
               Hoheisel,J., Straetz,M., Heim,S., Kiewitz,C., Eisen,J., Timmis,K.,
               Duesterhoft,A., Tummler,B. and Fraser,C.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (05-NOV-2002) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 6181863)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-APR-2002) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE015451.
               On Dec 16, 2002 this sequence version replaced gi:21264309.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
171387 172904 + 1518 26986745 PP_16SA - 16S ribosomal RNA
173201 176102 + 2902 26986745 PP_23SA - 23S ribosomal RNA
176235 176354 + 120 26986745 PP_5SA - 5S ribosomal RNA
176817 178334 + 1518 26986745 PP_16SB - 16S ribosomal RNA
178631 181532 + 2902 26986745 PP_23SB - 23S ribosomal RNA
181665 181784 + 120 26986745 PP_r01 - 5S ribosomal RNA
181890 182009 + 120 26986745 PP_5SB - 5S ribosomal RNA
255281 255354 - 74 26986745 PP_t01 - 11 Arg tRNA
334974 335046 - 73 26986745 PP_t02 - 12 Thr tRNA
344101 344173 - 73 26986745 PP_t03 - 17 Phe tRNA
467122 467195 - 74 26986745 PP_t04 - 16 Met tRNA
524947 526464 + 1518 26986745 PP_16SC - 16S ribosomal RNA
526761 529662 + 2902 26986745 PP_23SC - 23S ribosomal RNA
529782 529901 + 120 26986745 PP_5SC - 5S ribosomal RNA
532369 532449 + 81 26986745 PP_t05 - 18 Tyr tRNA
532477 532547 + 71 26986745 PP_t06 - 01 Gly tRNA
532580 532652 + 73 26986745 PP_t07 - 12 Thr tRNA
533982 534054 + 73 26986745 PP_t08 - 20 Trp tRNA
697822 699339 + 1518 26986745 PP_16SD - 16S ribosomal RNA
699429 699502 + 74 26986745 PP_t09 - 14 Ile tRNA
699530 699602 + 73 26986745 PP_t10 - 02 Ala tRNA
699849 702750 + 2902 26986745 PP_23SD - 23S ribosomal RNA
702882 703001 + 120 26986745 PP_5SD - 5S ribosomal RNA
733386 733458 + 73 26986745 PP_t11 - 07 Asn tRNA
733466 733539 + 74 26986745 PP_t12 - 03 Pro tRNA
733549 733621 + 73 26986745 PP_t13 - 10 Lys tRNA
733671 733744 + 74 26986745 PP_t14 - 03 Pro tRNA
733753 733825 + 73 26986745 PP_t15 - 10 Lys tRNA
741323 741395 + 73 26986745 PP_t16 - 12 Thr tRNA
813225 813298 - 74 26986745 PP_t17 - 16 Met tRNA
839747 839818 - 72 26986745 PP_t18 - 05 Gln tRNA
968899 968980 - 82 26986745 PP_t19 - 15 Leu tRNA
1325501 1327018 + 1518 26986745 PP_16SE - 16S ribosomal RNA
1327315 1330216 + 2902 26986745 PP_23SE - 23S ribosomal RNA
1330348 1330467 + 120 26986745 PP_5SE - 5S ribosomal RNA
1380537 1380610 - 74 26986745 PP_t20 - 16 Met tRNA
1380748 1380821 - 74 26986745 PP_t21 - 16 Met tRNA
1380959 1381032 - 74 26986745 PP_t22 - 16 Met tRNA
1402404 1402476 + 73 26986745 PP_t23 - 10 Lys tRNA
1418342 1418428 + 87 26986745 PP_t24 -
1606460 1606530 - 71 26986745 PP_t25 - 01 Gly tRNA
1898426 1898498 + 73 26986745 PP_t26 - 13 Val tRNA
1898515 1898588 + 74 26986745 PP_t27 - 06 Asp tRNA
1898762 1898834 + 73 26986745 PP_t28 - 13 Val tRNA
1898851 1898924 + 74 26986745 PP_t29 - 06 Asp tRNA
2069061 2069147 + 87 26986745 PP_t30 - 08 Ser tRNA
2102637 2102709 + 73 26986745 PP_t31 - 04 Glu tRNA
2102715 2102787 + 73 26986745 PP_t32 - 01 Gly tRNA
2102883 2102955 + 73 26986745 PP_t33 - 04 Glu tRNA
2102962 2103034 + 73 26986745 PP_t34 - 01 Gly tRNA
2103123 2103195 + 73 26986745 PP_t35 - 01 Gly tRNA
2233271 2233343 - 73 26986745 PP_t36 - 07 Asn tRNA
2241531 2241603 + 73 26986745 PP_t37 - 02 Ala tRNA
2241679 2241751 + 73 26986745 PP_t38 - 04 Glu tRNA
2241806 2241878 + 73 26986745 PP_t39 - 02 Ala tRNA
2241924 2241996 + 73 26986745 PP_t40 - 04 Glu tRNA
2242061 2242133 + 73 26986745 PP_t41 - 02 Ala tRNA
2242179 2242251 + 73 26986745 PP_t42 - 04 Glu tRNA
2271396 2271468 + 73 26986745 PP_t43 - 13 Val tRNA
2271537 2271610 + 74 26986745 PP_t44 - 06 Asp tRNA
2271713 2271786 + 74 26986745 PP_t45 - 06 Asp tRNA
2271931 2272004 + 74 26986745 PP_t46 - 06 Asp tRNA
2420624 2420697 - 74 26986745 PP_t47 - 03 Pro tRNA
2548687 2550204 + 1518 26986745 PP_16SF - 16S ribosomal RNA
2550294 2550367 + 74 26986745 PP_t48 - 14 Ile tRNA
2550395 2550467 + 73 26986745 PP_t49 - 02 Ala tRNA
2550714 2553615 + 2902 26986745 PP_23SF - 23S ribosomal RNA
2553747 2553866 + 120 26986745 PP_5SF - 5S ribosomal RNA
2585761 2585834 + 74 26986745 PP_t50 - 11 Arg tRNA
2585879 2585951 + 73 26986745 PP_t51 - 09 His tRNA
2586007 2586088 + 82 26986745 PP_t52 - 15 Leu tRNA
2626119 2626191 + 73 26986745 PP_t53 - 09 His tRNA
2685139 2685210 + 72 26986745 PP_t54 - 05 Gln tRNA
2796488 2796561 + 74 26986745 PP_t55 - 13 Val tRNA
2796737 2796810 + 74 26986745 PP_t56 - 13 Val tRNA
2817001 2817074 + 74 26986745 PP_t57 - 03 Pro tRNA
4361679 4361760 + 82 26986745 PP_t58 - 15 Leu tRNA
4427519 4427589 - 71 26986745 PP_t59 - 19 Cys tRNA
4501318 4501402 - 85 26986745 PP_t60 - 08 Ser tRNA
4632553 4632625 - 73 26986745 PP_t61 - 01 Gly tRNA
5075554 5075625 - 72 26986745 PP_t62 - 11 Arg tRNA
5075760 5075828 - 69 26986745 PP_t63 - 11 Arg tRNA
5079153 5079226 - 74 26986745 PP_t64 - 11 Arg tRNA
5079303 5079376 - 74 26986745 PP_t65 - 11 Arg tRNA
5079454 5079527 - 74 26986745 PP_t66 - 11 Arg tRNA
5079602 5079675 - 74 26986745 PP_t67 - 11 Arg tRNA
5079785 5079872 - 88 26986745 PP_t68 - 08 Ser tRNA
5307435 5307554 - 120 26986745 PP_5SG - 5S ribosomal RNA
5307686 5310587 - 2902 26986745 PP_23SG - 23S ribosomal RNA
5310825 5310897 - 73 26986745 PP_t69 - 02 Ala tRNA
5310997 5311070 - 74 26986745 PP_t70 - 14 Ile tRNA
5311162 5312679 - 1518 26986745 PP_16SG - 16S ribosomal RNA
5360918 5360991 - 74 26986745 PP_t71 - 16 Met tRNA
5361095 5361177 - 83 26986745 PP_t72 - 15 Leu tRNA
5549323 5549406 + 84 26986745 PP_t73 - 15 Leu tRNA
5549498 5549581 + 84 26986745 PP_t74 - 15 Leu tRNA