Материалы:NC 004061

Материал из Викиверситета
Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_004061             641454 bp    DNA     circular BCT 03-APR-2006
   DEFINITION  Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome.
   ACCESSION   NC_004061
   VERSION     NC_004061.1  GI:21672294
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
     ORGANISM  Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales;
               Enterobacteriaceae; Buchnera.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   Tamas,I., Klasson,L., Canback,B., Naslund,A.K., Eriksson,A.S.,
               Wernegreen,J.J., Sandstrom,J.P., Moran,N.A. and Andersson,S.G.
     TITLE     50 million years of genomic stasis in endosymbiotic bacteria
     JOURNAL   Science 296 (5577), 2376-2379 (2002)
      PUBMED   12089438
   REFERENCE   2  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   .
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (10-SEP-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 641454)
     AUTHORS   NCBI Microbial Genomes Annotation Project.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (24-AUG-2001) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AE013218.
               REFSEQ gene predictions performed by GeneMark 2.4/GeneMark.hmm 2.0
               with comparison to original submitter provided annotation. tRNA
               spans validated with tRNAscan-SE v.1.23.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
17956 18028 - 73 21672294 BUsg584 - 17 Phe tRNA
48600 48672 - 73 21672294 BUsg585 - 12 Thr tRNA
48697 48767 - 71 21672294 BUsg586 - 01 Gly tRNA
48774 48855 - 82 21672294 BUsg587 - 18 Tyr tRNA
48870 48942 - 73 21672294 BUsg588 - 12 Thr tRNA
74766 74838 - 73 21672294 BUsg589 - 10 Lys tRNA
74852 74924 - 73 21672294 BUsg590 - 13 Val tRNA
76793 76864 + 72 21672294 BUsg591 - 02 Ala tRNA
93336 93659 - 324 21672294 BUsg617 - ribonuclease P RNA component
117388 117461 - 74 21672294 BUsg592 - 13 Val tRNA
203361 203736 - 376 21672294 BUsg593 - tmRNA
275522 277031 + 1510 21672294 BUsg618 - 16S ribosomal RNA
277128 277201 + 74 21672294 BUsg594 - 14 Ile tRNA
277221 277293 + 73 21672294 BUsg595 - 02 Ala tRNA
279396 279469 + 74 21672294 BUsg596 - 06 Asp tRNA
366117 366201 - 85 21672294 BUsg597 - 15 Leu tRNA
366219 366289 - 71 21672294 BUsg598 - 19 Cys tRNA
366450 366534 + 85 21672294 BUsg599 - 08 Ser tRNA
420585 420666 - 82 21672294 BUsg600 - 15 Leu tRNA
443338 443427 + 90 21672294 BUsg601 - 08 Ser tRNA
443463 443536 + 74 21672294 BUsg602 - 11 Arg tRNA
449630 449701 - 72 21672294 BUsg603 - 05 Gln tRNA
449742 449823 - 82 21672294 BUsg604 - 15 Leu tRNA
449836 449909 - 74 21672294 BUsg605 - 16 Met tRNA
505385 505458 - 74 21672294 BUsg606 - 16 Met tRNA
536611 536684 - 74 21672294 BUsg607 - 11 Arg tRNA
540138 540257 - 120 21672294 BUsg619 - 5S ribosomal RNA
540354 543274 - 2921 21672294 BUsg620 - 23S ribosomal RNA
543452 543523 - 72 21672294 BUsg608 - 04 Glu tRNA
575257 575341 + 85 21672294 BUsg609 - 08 Ser tRNA
592841 592913 - 73 21672294 BUsg610 - 07 Asn tRNA
593047 593119 + 73 21672294 BUsg611 - 16 Met tRNA
611053 611125 + 73 21672294 BUsg612 - 01 Gly tRNA
626413 626486 - 74 21672294 BUsg613 - 03 Pro tRNA
626520 626592 - 73 21672294 BUsg614 - 09 His tRNA
626632 626706 - 75 21672294 BUsg615 - 11 Arg tRNA
634355 634428 - 74 21672294 BUsg616 - 20 Trp tRNA