Геном прокариот/Материалы:NC 007705

Материал из Викиверситета
(перенаправлено с «Материалы:NC 007705»)
Базовый уровень статей

Выделить только проверенную информацию

Создать черновик

   LOCUS       NC_007705            4940217 bp    DNA     circular BCT 30-MAR-2006
   DEFINITION  Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018, complete genome.
   ACCESSION   NC_007705
   VERSION     NC_007705.1  GI:84621657
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018
     ORGANISM  Xanthomonas oryzae pv. oryzae MAFF 311018
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales;
               Xanthomonadaceae; Xanthomonas.
   REFERENCE   1
     AUTHORS   Ochiai,H., Inoue,Y., Takeya,M., Sasaki,A. and Kaku,H.
     TITLE     Genome sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae suggests
               contribution of large numbers of effector genes and insertion
               sequences to its race diversity
     JOURNAL   JARQ 39, 275-287 (2005)
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4940217)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (09-JAN-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4940217)
     AUTHORS   Ochiai,H., Inoue,Y., Takeya,M., Sasaki,A. and Kaku,H.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (16-NOV-2004) Hirokazu Ochiai, National Institute of
               Agrobiological Sciences, Genetic Diversity; 2-1-2 Kannondai,
               Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan (E-mail:ochiaih@nias.affrc.go.jp,
               Tel:81-29-838-7452, Fax:81-29-838-7451)
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from AP008229.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК[править]

Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
293626 295175 + 1550 84621657 XOO_r01 - 16S ribosomal RNA
295269 295344 + 76 84621657 XOO_r02 - 02 Ala tRNA
295364 295440 + 77 84621657 XOO_r03 - 14 Ile tRNA
295668 298590 + 2923 84621657 XOO_r04 - 23S ribosomal RNA
298722 298840 + 119 84621657 XOO_r05 - 5S ribosomal RNA
426679 426754 + 76 84621657 XOO_r06 - 12 Thr tRNA
448446 448522 - 77 84621657 XOO_r07 - 11 Arg tRNA
520867 522416 + 1550 84621657 XOO_r08 - 16S ribosomal RNA
522510 522585 + 76 84621657 XOO_r09 - 02 Ala tRNA
522605 522681 + 77 84621657 XOO_r10 - 14 Ile tRNA
522909 525831 + 2923 84621657 XOO_r11 - 23S ribosomal RNA
525963 526081 + 119 84621657 XOO_r12 - 5S ribosomal RNA
613808 613883 + 76 84621657 XOO_r13 - 16 Met tRNA
881935 882009 + 75 84621657 XOO_r14 - 13 Val tRNA
1012227 1012303 + 77 84621657 XOO_r15 - 03 Pro tRNA
1012346 1012422 + 77 84621657 XOO_r16 - 11 Arg tRNA
1012455 1012531 + 77 84621657 XOO_r17 - 09 His tRNA
1012625 1012700 + 76 84621657 XOO_r18 - 10 Lys tRNA
1015106 1015190 + 85 84621657 XOO_r19 - 15 Leu tRNA
1021927 1022001 + 75 84621657 XOO_r20 - 13 Val tRNA
1022030 1022106 + 77 84621657 XOO_r21 - 06 Asp tRNA
1022201 1022277 + 77 84621657 XOO_r22 - 06 Asp tRNA
1030594 1030684 + 91 84621657 XOO_r23 - 08 Ser tRNA
1053135 1053227 - 93 84621657 XOO_r24 - 08 Ser tRNA
1659582 1659657 + 76 84621657 XOO_r25 - 12 Thr tRNA
1723607 1723682 + 76 84621657 XOO_r26 - 10 Lys tRNA
2165034 2165120 - 87 84621657 XOO_r27 - 15 Leu tRNA
2200156 2200245 + 90 84621657 XOO_r28 - 08 Ser tRNA
2329636 2329712 + 77 84621657 XOO_r29 - 11 Arg tRNA
2405677 2405752 - 76 84621657 XOO_r30 - 01 Gly tRNA
2405835 2405908 - 74 84621657 XOO_r31 - 19 Cys tRNA
2405977 2406052 - 76 84621657 XOO_r32 - 01 Gly tRNA
2438204 2438290 - 87 84621657 XOO_r33 - 15 Leu tRNA
2474149 2474235 + 87 84621657 XOO_r34 - 15 Leu tRNA
2491288 2491362 + 75 84621657 XOO_r35 - 04 Glu tRNA
2788174 2788249 + 76 84621657 XOO_r36 - 02 Ala tRNA
2788297 2788372 + 76 84621657 XOO_r37 - 04 Glu tRNA
2789132 2789207 + 76 84621657 XOO_r38 - 02 Ala tRNA
2789255 2789330 + 76 84621657 XOO_r39 - 04 Glu tRNA
2800698 2800774 + 77 84621657 XOO_r40 - 03 Pro tRNA
2887016 2887091 + 76 84621657 XOO_r41 - 02 Ala tRNA
3131220 3131296 + 77 84621657 XOO_r42 - 11 Arg tRNA
3131390 3131466 + 77 84621657 XOO_r43 - 11 Arg tRNA
3138863 3138955 - 93 84621657 XOO_r44 - 08 Ser tRNA
3320071 3320154 + 84 84621657 XOO_r45 - 15 Leu tRNA
3402661 3402736 - 76 84621657 XOO_r46 - 17 Phe tRNA
3423554 3423630 - 77 84621657 XOO_r47 - 03 Pro tRNA
3433519 3433593 - 75 84621657 XOO_r48 - 13 Val tRNA
3436441 3436517 - 77 84621657 XOO_r49 - 07 Asn tRNA
3465440 3465516 - 77 84621657 XOO_r50 - 16 Met tRNA
3480643 3480727 - 85 84621657 XOO_r51 - 15 Leu tRNA
3594191 3594264 - 74 84621657 XOO_r52 - 01 Gly tRNA
3861178 3861253 - 76 84621657 XOO_r53 - 20 Trp tRNA
3862596 3862671 - 76 84621657 XOO_r54 - 12 Thr tRNA
3862706 3862779 - 74 84621657 XOO_r55 - 01 Gly tRNA
3862809 3862894 - 86 84621657 XOO_r56 - 18 Tyr tRNA
3866682 3866758 - 77 84621657 XOO_r57 - 05 Gln tRNA
4428036 4428112 + 77 84621657 XOO_r58 - 16 Met tRNA
4428165 4428238 + 74 84621657 XOO_r59 - 05 Gln tRNA