Перейти к содержанию

Материалы:NC 008570

Материал из Викиверситета
Вы находитесь в Инкубаторе
Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Обработать/использовать материал

   LOCUS       NC_008570            4744448 bp    DNA     circular BCT 14-AUG-2007
   DEFINITION  Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966, complete genome.
   ACCESSION   NC_008570
   VERSION     NC_008570.1  GI:117617447
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
     ORGANISM  Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales;
               Aeromonadaceae; Aeromonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4744448)
     AUTHORS   Seshadri,R., Joseph,S.W., Chopra,A.K., Sha,J., Shaw,J., Graf,J.,
               Haft,D., Wu,M., Ren,Q., Rosovitz,M., Madupu,R., Tallon,L., Kim,M.,
               Jin,S., Vuong,H., Stine,O.C., Ali,A., Horneman,A.J. and
               Heidelberg,J.F.
     TITLE     Genome Sequence of Aeromonas hydrophila ATCC 7966T: The Jack of All
               Trades
     JOURNAL   (er) J. Bacteriol. (2006) In press
      PUBMED   16980456
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4744448)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-NOV-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4744448)
     AUTHORS   Seshadri,R., Joseph,S.W., Chopra,A.K., Shaw,J., Graf,J., Haft,D.,
               Wu,M., Rosovitz,M., Madupu,R., Tallon,L., Kim,M., Jin,S., Vuong,H.,
               Stine,O.C., Ali,A., Horneman,A.J. and Heidelberg,J.F.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-SEP-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr., Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000462.
               COMPLETENESS: full length.


Расположение РНК

[править]
Начало Конец Направление Длина PID Ген COG Комментарий
29246 29322 + 77 117617447 AHA_0024 - 11 Arg tRNA
29373 29448 + 76 117617447 AHA_0025 - 09 His tRNA
29469 29554 + 86 117617447 AHA_0026 - 15 Leu tRNA
29628 29704 + 77 117617447 AHA_0027 - 03 Pro tRNA
85174 86723 + 1550 117617447 AHA_0077 - 16S ribosomal RNA
86944 87019 + 76 117617447 AHA_0078 - 04 Glu tRNA
87259 90147 + 2889 117617447 AHA_0079 - 23S ribosomal RNA
90259 90389 + 131 117617447 AHA_0080 - 5S ribosomal RNA
90487 90562 + 76 117617447 AHA_0081 - 12 Thr tRNA
163372 164921 + 1550 117617447 AHA_0145 - 16S ribosomal RNA
165116 165191 + 76 117617447 AHA_0146 - 04 Glu tRNA
165428 168316 + 2889 117617447 AHA_0147 - 23S ribosomal RNA
168426 168556 + 131 117617447 AHA_0148 - 5S ribosomal RNA
214907 216456 + 1550 117617447 AHA_0198 - 16S ribosomal RNA
216523 216599 + 77 117617447 AHA_0199 - 14 Ile tRNA
216610 216685 + 76 117617447 AHA_0200 - 02 Ala tRNA
216926 219814 + 2889 117617447 AHA_0201 - 23S ribosomal RNA
219923 220053 + 131 117617447 AHA_0201a - 5S ribosomal RNA
220152 220227 + 76 117617447 AHA_0202 - 12 Thr tRNA
220249 220368 + 120 117617447 AHA_0203 - 5S ribosomal RNA
349946 351495 + 1550 117617447 AHA_0335 - 16S ribosomal RNA
351690 351765 + 76 117617447 AHA_0336 - 04 Glu tRNA
352002 354890 + 2889 117617447 AHA_0337 - 23S ribosomal RNA
354966 355085 + 120 117617447 AHA_0338 - 5S ribosomal RNA
355180 355256 + 77 117617447 AHA_0339 - 06 Asp tRNA
803843 805392 + 1550 117617447 AHA_0752 - 16S ribosomal RNA
805590 805665 + 76 117617447 AHA_0753 - 04 Glu tRNA
805904 808792 + 2889 117617447 AHA_0754 - 23S ribosomal RNA
808907 809026 + 120 117617447 AHA_0755 - 5S ribosomal RNA
809122 809198 + 77 117617447 AHA_0756 - 06 Asp tRNA
897169 897245 + 77 117617447 AHA_0836 - 16 Met tRNA
933020 934569 + 1550 117617447 AHA_0865 - 16S ribosomal RNA
934767 934842 + 76 117617447 AHA_0866 - 04 Glu tRNA
935081 937969 + 2889 117617447 AHA_0867 - 23S ribosomal RNA
938079 938209 + 131 117617447 AHA_0868 - 5S ribosomal RNA
1108232 1108316 - 85 117617447 AHA_1026 - 18 Tyr tRNA
1108348 1108432 - 85 117617447 AHA_1027 - 18 Tyr tRNA
1108464 1108548 - 85 117617447 AHA_1028 - 18 Tyr tRNA
1187027 1187103 - 77 117617447 AHA_1088 - 11 Arg tRNA
1210105 1210192 + 88 117617447 AHA_1116 - 08 Ser tRNA
1432952 1433041 + 90 117617447 AHA_1319 - 08 Ser tRNA
1457945 1458020 - 76 117617447 AHA_1343 - 12 Thr tRNA
1577701 1578060 - 360 117617447 AHA_1442 - 10Sa RNA (tmRNA)
1702438 1702522 - 85 117617447 AHA_1555 - 18 Tyr tRNA
1702574 1702658 - 85 117617447 AHA_1556 - 18 Tyr tRNA
1955468 1955555 - 88 117617447 AHA_1785 - 08 Ser tRNA
1989214 1989301 + 88 117617447 AHA_1825 - 08 Ser tRNA
2026838 2026913 - 76 117617447 AHA_1851 - 09 His tRNA
2026963 2027039 - 77 117617447 AHA_1852 - 11 Arg tRNA
2027076 2027152 - 77 117617447 AHA_1853 - 03 Pro tRNA
2322629 2322705 - 77 117617447 AHA_2108 - 13 Val tRNA
2322743 2322819 - 77 117617447 AHA_2109 - 13 Val tRNA
2322825 2322902 - 78 117617447 AHA_2110 - Xaa tRNA
2322941 2323017 - 77 117617447 AHA_2111 - 13 Val tRNA
2323035 2323111 - 77 117617447 AHA_2112 - 13 Val tRNA
2323124 2323200 - 77 117617447 AHA_2113 - 13 Val tRNA
2639183 2639259 - 77 117617447 AHA_2387 - 16 Met tRNA
2639357 2639433 - 77 117617447 AHA_2388 - 16 Met tRNA
2639530 2639606 - 77 117617447 AHA_2389 - 16 Met tRNA
2639703 2639779 - 77 117617447 AHA_2390 - 16 Met tRNA
2639876 2639952 - 77 117617447 AHA_2391 - 16 Met tRNA
2640049 2640125 - 77 117617447 AHA_2392 - 16 Met tRNA
2640222 2640298 - 77 117617447 AHA_2393 - 16 Met tRNA
2640391 2640467 - 77 117617447 AHA_2394 - 16 Met tRNA
2702867 2702942 + 76 117617447 AHA_2449 - 07 Asn tRNA
2791529 2791616 + 88 117617447 AHA_2507 - Sec tRNA
2826979 2827066 - 88 117617447 AHA_2539 - 08 Ser tRNA
2829543 2829618 + 76 117617447 AHA_2541 - 07 Asn tRNA
2829621 2829696 + 76 117617447 AHA_2542 - 07 Asn tRNA
2900868 2900944 + 77 117617447 AHA_2603 - 03 Pro tRNA
2983700 2983787 - 88 117617447 AHA_2673 - 08 Ser tRNA
3111150 3111236 - 87 117617447 AHA_2769 - 15 Leu tRNA
3111278 3111351 - 74 117617447 AHA_2770 - 19 Cys tRNA
3111386 3111461 - 76 117617447 AHA_2771 - 01 Gly tRNA
3162154 3162230 + 77 117617447 AHA_2815 - 03 Pro tRNA
3414420 3414494 - 75 117617447 AHA_3027 - 01 Gly tRNA
3414589 3414662 - 74 117617447 AHA_3028 - 01 Gly tRNA
3487450 3487523 - 74 117617447 AHA_3090 - 19 Cys tRNA
3487579 3487654 - 76 117617447 AHA_3091 - 01 Gly tRNA
3566154 3566228 + 75 117617447 AHA_3153 - 05 Gln tRNA
3571935 3572011 + 77 117617447 AHA_3158 - 16 Met tRNA
3572020 3572094 + 75 117617447 AHA_3159 - 05 Gln tRNA
3572241 3572315 + 75 117617447 AHA_3160 - 05 Gln tRNA
3572357 3572431 + 75 117617447 AHA_3161 - 05 Gln tRNA
3572470 3572546 + 77 117617447 AHA_3162 - 16 Met tRNA
3572592 3572666 + 75 117617447 AHA_3163 - 05 Gln tRNA
3572703 3572779 + 77 117617447 AHA_3164 - 16 Met tRNA
3572788 3572871 + 84 117617447 AHA_3165 - 15 Leu tRNA
3727432 3727508 - 77 117617447 AHA_3306 - 16 Met tRNA
3727601 3727685 - 85 117617447 AHA_3307 - 15 Leu tRNA
3875715 3875790 - 76 117617447 AHA_3442 - 02 Ala tRNA
3875825 3875900 - 76 117617447 AHA_3443 - 02 Ala tRNA
3875949 3876024 - 76 117617447 AHA_3444 - 02 Ala tRNA
3876088 3876163 - 76 117617447 AHA_3445 - 02 Ala tRNA
3876192 3876267 - 76 117617447 AHA_3446 - 02 Ala tRNA
3881802 3881881 - 80 117617447 AHA_3451 - Xaa tRNA
3881945 3882020 - 76 117617447 AHA_3452 - 01 Gly tRNA
3882045 3882120 - 76 117617447 AHA_3453 - 01 Gly tRNA
3882145 3882220 - 76 117617447 AHA_3454 - 01 Gly tRNA
3882245 3882320 - 76 117617447 AHA_3455 - 01 Gly tRNA
3882345 3882420 - 76 117617447 AHA_3456 - 01 Gly tRNA
3882454 3882529 - 76 117617447 AHA_3457 - 01 Gly tRNA
3882555 3882630 - 76 117617447 AHA_3458 - 01 Gly tRNA
3894370 3894445 + 76 117617447 AHA_3472 - 17 Phe tRNA
3894450 3894525 + 76 117617447 AHA_3473 - 07 Asn tRNA
3951574 3951693 - 120 117617447 AHA_3513 - 5S ribosomal RNA
3951808 3954696 - 2889 117617447 AHA_3514 - 23S ribosomal RNA
3954933 3955008 - 76 117617447 AHA_3515 - 04 Glu tRNA
3955208 3956757 - 1550 117617447 AHA_3516 - 16S ribosomal RNA
4068512 4068587 - 76 117617447 AHA_3622 - 13 Val tRNA
4068605 4068680 - 76 117617447 AHA_3623 - 10 Lys tRNA
4068703 4068778 - 76 117617447 AHA_3624 - 13 Val tRNA
4068796 4068871 - 76 117617447 AHA_3625 - 10 Lys tRNA
4068895 4068970 - 76 117617447 AHA_3626 - 13 Val tRNA
4068987 4069062 - 76 117617447 AHA_3627 - 10 Lys tRNA
4069087 4069162 - 76 117617447 AHA_3628 - 13 Val tRNA
4069179 4069254 - 76 117617447 AHA_3629 - 10 Lys tRNA
4069277 4069352 - 76 117617447 AHA_3630 - 13 Val tRNA
4069370 4069445 - 76 117617447 AHA_3631 - 10 Lys tRNA
4069469 4069544 - 76 117617447 AHA_3632 - 13 Val tRNA
4069566 4069641 - 76 117617447 AHA_3633 - 10 Lys tRNA
4069690 4069765 - 76 117617447 AHA_3634 - 13 Val tRNA
4069797 4069872 - 76 117617447 AHA_3635 - 10 Lys tRNA
4129664 4129749 - 86 117617447 AHA_3696 - 15 Leu tRNA
4141607 4141683 - 77 117617447 AHA_3706 - 11 Arg tRNA
4141712 4141788 - 77 117617447 AHA_3707 - 11 Arg tRNA
4141817 4141893 - 77 117617447 AHA_3708 - 11 Arg tRNA
4141920 4141996 - 77 117617447 AHA_3709 - 11 Arg tRNA
4142096 4142172 - 77 117617447 AHA_3710 - 11 Arg tRNA
4142176 4142268 - 93 117617447 AHA_3711 - 08 Ser tRNA
4234485 4234570 + 86 117617447 AHA_3805 - 15 Leu tRNA
4234626 4234711 + 86 117617447 AHA_3806 - 15 Leu tRNA
4234756 4234841 + 86 117617447 AHA_3807 - 15 Leu tRNA
4234887 4234972 + 86 117617447 AHA_3808 - 15 Leu tRNA
4235044 4235129 + 86 117617447 AHA_3809 - 15 Leu tRNA
4268521 4268596 - 76 117617447 AHA_3842 - 07 Asn tRNA
4268642 4268717 - 76 117617447 AHA_3843 - 17 Phe tRNA
4268721 4268796 - 76 117617447 AHA_3844 - 12 Thr tRNA
4268849 4268924 - 76 117617447 AHA_3845 - 17 Phe tRNA
4366322 4366441 - 120 117617447 AHA_3940 - 5S ribosomal RNA
4366517 4369405 - 2889 117617447 AHA_3941 - 23S ribosomal RNA
4369644 4369719 - 76 117617447 AHA_3942 - 02 Ala tRNA
4369730 4369806 - 77 117617447 AHA_3943 - 14 Ile tRNA
4369875 4371424 - 1550 117617447 AHA_3944 - 16S ribosomal RNA
4449170 4449246 - 77 117617447 AHA_4011 - 06 Asp tRNA
4449344 4449463 - 120 117617447 AHA_4012 - 5S ribosomal RNA
4449539 4452427 - 2889 117617447 AHA_4013 - 23S ribosomal RNA
4452666 4452741 - 76 117617447 AHA_4014 - 02 Ala tRNA
4452752 4452828 - 77 117617447 AHA_4015 - 14 Ile tRNA
4452897 4454446 - 1550 117617447 AHA_4016 - 16S ribosomal RNA
4474578 4474654 - 77 117617447 AHA_4035 - 20 Trp tRNA
4476064 4476138 - 75 117617447 AHA_4037 - 01 Gly tRNA
4476177 4476261 - 85 117617447 AHA_4038 - 18 Tyr tRNA
4526310 4526386 - 77 117617447 AHA_4085 - 20 Trp tRNA
4579858 4579934 - 77 117617447 AHA_4132 - 03 Pro tRNA
4697520 4697596 - 77 117617447 AHA_4242 - 06 Asp tRNA
4697694 4697813 - 120 117617447 AHA_4243 - 5S ribosomal RNA
4697928 4700816 - 2889 117617447 AHA_4244 - 23S ribosomal RNA
4701054 4701129 - 76 117617447 AHA_4245 - 04 Glu tRNA
4701326 4702875 - 1550 117617447 AHA_4246 - 16S ribosomal RNA