Материалы:NC 008570

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_008570            4744448 bp    DNA     circular BCT 14-AUG-2007
   DEFINITION  Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966, complete genome.
   ACCESSION   NC_008570
   VERSION     NC_008570.1  GI:117617447
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
     ORGANISM  Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Aeromonadales;
               Aeromonadaceae; Aeromonas.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 4744448)
     AUTHORS   Seshadri,R., Joseph,S.W., Chopra,A.K., Sha,J., Shaw,J., Graf,J.,
               Haft,D., Wu,M., Ren,Q., Rosovitz,M., Madupu,R., Tallon,L., Kim,M.,
               Jin,S., Vuong,H., Stine,O.C., Ali,A., Horneman,A.J. and
               Heidelberg,J.F.
     TITLE     Genome Sequence of Aeromonas hydrophila ATCC 7966T: The Jack of All
               Trades
     JOURNAL   (er) J. Bacteriol. (2006) In press
      PUBMED   16980456
   REFERENCE   2  (bases 1 to 4744448)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (08-NOV-2006) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 4744448)
     AUTHORS   Seshadri,R., Joseph,S.W., Chopra,A.K., Shaw,J., Graf,J., Haft,D.,
               Wu,M., Rosovitz,M., Madupu,R., Tallon,L., Kim,M., Jin,S., Vuong,H.,
               Stine,O.C., Ali,A., Horneman,A.J. and Heidelberg,J.F.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (06-SEP-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr., Rockville, MD 20850, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000462.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
29246	29322	+	77	117617447	AHA_0024	-	^{11 Arg tRNA}
29373	29448	+	76	117617447	AHA_0025	-	^{09 His tRNA}
29469	29554	+	86	117617447	AHA_0026	-	^{15 Leu tRNA}
29628	29704	+	77	117617447	AHA_0027	-	^{03 Pro tRNA}
85174	86723	+	1550	117617447	AHA_0077	-	16S ribosomal RNA
86944	87019	+	76	117617447	AHA_0078	-	^{04 Glu tRNA}
87259	90147	+	2889	117617447	AHA_0079	-	23S ribosomal RNA
90259	90389	+	131	117617447	AHA_0080	-	5S ribosomal RNA
90487	90562	+	76	117617447	AHA_0081	-	^{12 Thr tRNA}
163372	164921	+	1550	117617447	AHA_0145	-	16S ribosomal RNA
165116	165191	+	76	117617447	AHA_0146	-	^{04 Glu tRNA}
165428	168316	+	2889	117617447	AHA_0147	-	23S ribosomal RNA
168426	168556	+	131	117617447	AHA_0148	-	5S ribosomal RNA
214907	216456	+	1550	117617447	AHA_0198	-	16S ribosomal RNA
216523	216599	+	77	117617447	AHA_0199	-	^{14 Ile tRNA}
216610	216685	+	76	117617447	AHA_0200	-	^{02 Ala tRNA}
216926	219814	+	2889	117617447	AHA_0201	-	23S ribosomal RNA
219923	220053	+	131	117617447	AHA_0201a	-	5S ribosomal RNA
220152	220227	+	76	117617447	AHA_0202	-	^{12 Thr tRNA}
220249	220368	+	120	117617447	AHA_0203	-	5S ribosomal RNA
349946	351495	+	1550	117617447	AHA_0335	-	16S ribosomal RNA
351690	351765	+	76	117617447	AHA_0336	-	^{04 Glu tRNA}
352002	354890	+	2889	117617447	AHA_0337	-	23S ribosomal RNA
354966	355085	+	120	117617447	AHA_0338	-	5S ribosomal RNA
355180	355256	+	77	117617447	AHA_0339	-	^{06 Asp tRNA}
803843	805392	+	1550	117617447	AHA_0752	-	16S ribosomal RNA
805590	805665	+	76	117617447	AHA_0753	-	^{04 Glu tRNA}
805904	808792	+	2889	117617447	AHA_0754	-	23S ribosomal RNA
808907	809026	+	120	117617447	AHA_0755	-	5S ribosomal RNA
809122	809198	+	77	117617447	AHA_0756	-	^{06 Asp tRNA}
897169	897245	+	77	117617447	AHA_0836	-	^{16 Met tRNA}
933020	934569	+	1550	117617447	AHA_0865	-	16S ribosomal RNA
934767	934842	+	76	117617447	AHA_0866	-	^{04 Glu tRNA}
935081	937969	+	2889	117617447	AHA_0867	-	23S ribosomal RNA
938079	938209	+	131	117617447	AHA_0868	-	5S ribosomal RNA
1108232	1108316	-	85	117617447	AHA_1026	-	^{18 Tyr tRNA}
1108348	1108432	-	85	117617447	AHA_1027	-	^{18 Tyr tRNA}
1108464	1108548	-	85	117617447	AHA_1028	-	^{18 Tyr tRNA}
1187027	1187103	-	77	117617447	AHA_1088	-	^{11 Arg tRNA}
1210105	1210192	+	88	117617447	AHA_1116	-	^{08 Ser tRNA}
1432952	1433041	+	90	117617447	AHA_1319	-	^{08 Ser tRNA}
1457945	1458020	-	76	117617447	AHA_1343	-	^{12 Thr tRNA}
1577701	1578060	-	360	117617447	AHA_1442	-	10Sa RNA (tmRNA)
1702438	1702522	-	85	117617447	AHA_1555	-	^{18 Tyr tRNA}
1702574	1702658	-	85	117617447	AHA_1556	-	^{18 Tyr tRNA}
1955468	1955555	-	88	117617447	AHA_1785	-	^{08 Ser tRNA}
1989214	1989301	+	88	117617447	AHA_1825	-	^{08 Ser tRNA}
2026838	2026913	-	76	117617447	AHA_1851	-	^{09 His tRNA}
2026963	2027039	-	77	117617447	AHA_1852	-	^{11 Arg tRNA}
2027076	2027152	-	77	117617447	AHA_1853	-	^{03 Pro tRNA}
2322629	2322705	-	77	117617447	AHA_2108	-	^{13 Val tRNA}
2322743	2322819	-	77	117617447	AHA_2109	-	^{13 Val tRNA}
2322825	2322902	-	78	117617447	AHA_2110	-	Xaa tRNA
2322941	2323017	-	77	117617447	AHA_2111	-	^{13 Val tRNA}
2323035	2323111	-	77	117617447	AHA_2112	-	^{13 Val tRNA}
2323124	2323200	-	77	117617447	AHA_2113	-	^{13 Val tRNA}
2639183	2639259	-	77	117617447	AHA_2387	-	^{16 Met tRNA}
2639357	2639433	-	77	117617447	AHA_2388	-	^{16 Met tRNA}
2639530	2639606	-	77	117617447	AHA_2389	-	^{16 Met tRNA}
2639703	2639779	-	77	117617447	AHA_2390	-	^{16 Met tRNA}
2639876	2639952	-	77	117617447	AHA_2391	-	^{16 Met tRNA}
2640049	2640125	-	77	117617447	AHA_2392	-	^{16 Met tRNA}
2640222	2640298	-	77	117617447	AHA_2393	-	^{16 Met tRNA}
2640391	2640467	-	77	117617447	AHA_2394	-	^{16 Met tRNA}
2702867	2702942	+	76	117617447	AHA_2449	-	^{07 Asn tRNA}
2791529	2791616	+	88	117617447	AHA_2507	-	Sec tRNA
2826979	2827066	-	88	117617447	AHA_2539	-	^{08 Ser tRNA}
2829543	2829618	+	76	117617447	AHA_2541	-	^{07 Asn tRNA}
2829621	2829696	+	76	117617447	AHA_2542	-	^{07 Asn tRNA}
2900868	2900944	+	77	117617447	AHA_2603	-	^{03 Pro tRNA}
2983700	2983787	-	88	117617447	AHA_2673	-	^{08 Ser tRNA}
3111150	3111236	-	87	117617447	AHA_2769	-	^{15 Leu tRNA}
3111278	3111351	-	74	117617447	AHA_2770	-	^{19 Cys tRNA}
3111386	3111461	-	76	117617447	AHA_2771	-	^{01 Gly tRNA}
3162154	3162230	+	77	117617447	AHA_2815	-	^{03 Pro tRNA}
3414420	3414494	-	75	117617447	AHA_3027	-	^{01 Gly tRNA}
3414589	3414662	-	74	117617447	AHA_3028	-	^{01 Gly tRNA}
3487450	3487523	-	74	117617447	AHA_3090	-	^{19 Cys tRNA}
3487579	3487654	-	76	117617447	AHA_3091	-	^{01 Gly tRNA}
3566154	3566228	+	75	117617447	AHA_3153	-	^{05 Gln tRNA}
3571935	3572011	+	77	117617447	AHA_3158	-	^{16 Met tRNA}
3572020	3572094	+	75	117617447	AHA_3159	-	^{05 Gln tRNA}
3572241	3572315	+	75	117617447	AHA_3160	-	^{05 Gln tRNA}
3572357	3572431	+	75	117617447	AHA_3161	-	^{05 Gln tRNA}
3572470	3572546	+	77	117617447	AHA_3162	-	^{16 Met tRNA}
3572592	3572666	+	75	117617447	AHA_3163	-	^{05 Gln tRNA}
3572703	3572779	+	77	117617447	AHA_3164	-	^{16 Met tRNA}
3572788	3572871	+	84	117617447	AHA_3165	-	^{15 Leu tRNA}
3727432	3727508	-	77	117617447	AHA_3306	-	^{16 Met tRNA}
3727601	3727685	-	85	117617447	AHA_3307	-	^{15 Leu tRNA}
3875715	3875790	-	76	117617447	AHA_3442	-	^{02 Ala tRNA}
3875825	3875900	-	76	117617447	AHA_3443	-	^{02 Ala tRNA}
3875949	3876024	-	76	117617447	AHA_3444	-	^{02 Ala tRNA}
3876088	3876163	-	76	117617447	AHA_3445	-	^{02 Ala tRNA}
3876192	3876267	-	76	117617447	AHA_3446	-	^{02 Ala tRNA}
3881802	3881881	-	80	117617447	AHA_3451	-	Xaa tRNA
3881945	3882020	-	76	117617447	AHA_3452	-	^{01 Gly tRNA}
3882045	3882120	-	76	117617447	AHA_3453	-	^{01 Gly tRNA}
3882145	3882220	-	76	117617447	AHA_3454	-	^{01 Gly tRNA}
3882245	3882320	-	76	117617447	AHA_3455	-	^{01 Gly tRNA}
3882345	3882420	-	76	117617447	AHA_3456	-	^{01 Gly tRNA}
3882454	3882529	-	76	117617447	AHA_3457	-	^{01 Gly tRNA}
3882555	3882630	-	76	117617447	AHA_3458	-	^{01 Gly tRNA}
3894370	3894445	+	76	117617447	AHA_3472	-	^{17 Phe tRNA}
3894450	3894525	+	76	117617447	AHA_3473	-	^{07 Asn tRNA}
3951574	3951693	-	120	117617447	AHA_3513	-	5S ribosomal RNA
3951808	3954696	-	2889	117617447	AHA_3514	-	23S ribosomal RNA
3954933	3955008	-	76	117617447	AHA_3515	-	^{04 Glu tRNA}
3955208	3956757	-	1550	117617447	AHA_3516	-	16S ribosomal RNA
4068512	4068587	-	76	117617447	AHA_3622	-	^{13 Val tRNA}
4068605	4068680	-	76	117617447	AHA_3623	-	^{10 Lys tRNA}
4068703	4068778	-	76	117617447	AHA_3624	-	^{13 Val tRNA}
4068796	4068871	-	76	117617447	AHA_3625	-	^{10 Lys tRNA}
4068895	4068970	-	76	117617447	AHA_3626	-	^{13 Val tRNA}
4068987	4069062	-	76	117617447	AHA_3627	-	^{10 Lys tRNA}
4069087	4069162	-	76	117617447	AHA_3628	-	^{13 Val tRNA}
4069179	4069254	-	76	117617447	AHA_3629	-	^{10 Lys tRNA}
4069277	4069352	-	76	117617447	AHA_3630	-	^{13 Val tRNA}
4069370	4069445	-	76	117617447	AHA_3631	-	^{10 Lys tRNA}
4069469	4069544	-	76	117617447	AHA_3632	-	^{13 Val tRNA}
4069566	4069641	-	76	117617447	AHA_3633	-	^{10 Lys tRNA}
4069690	4069765	-	76	117617447	AHA_3634	-	^{13 Val tRNA}
4069797	4069872	-	76	117617447	AHA_3635	-	^{10 Lys tRNA}
4129664	4129749	-	86	117617447	AHA_3696	-	^{15 Leu tRNA}
4141607	4141683	-	77	117617447	AHA_3706	-	^{11 Arg tRNA}
4141712	4141788	-	77	117617447	AHA_3707	-	^{11 Arg tRNA}
4141817	4141893	-	77	117617447	AHA_3708	-	^{11 Arg tRNA}
4141920	4141996	-	77	117617447	AHA_3709	-	^{11 Arg tRNA}
4142096	4142172	-	77	117617447	AHA_3710	-	^{11 Arg tRNA}
4142176	4142268	-	93	117617447	AHA_3711	-	^{08 Ser tRNA}
4234485	4234570	+	86	117617447	AHA_3805	-	^{15 Leu tRNA}
4234626	4234711	+	86	117617447	AHA_3806	-	^{15 Leu tRNA}
4234756	4234841	+	86	117617447	AHA_3807	-	^{15 Leu tRNA}
4234887	4234972	+	86	117617447	AHA_3808	-	^{15 Leu tRNA}
4235044	4235129	+	86	117617447	AHA_3809	-	^{15 Leu tRNA}
4268521	4268596	-	76	117617447	AHA_3842	-	^{07 Asn tRNA}
4268642	4268717	-	76	117617447	AHA_3843	-	^{17 Phe tRNA}
4268721	4268796	-	76	117617447	AHA_3844	-	^{12 Thr tRNA}
4268849	4268924	-	76	117617447	AHA_3845	-	^{17 Phe tRNA}
4366322	4366441	-	120	117617447	AHA_3940	-	5S ribosomal RNA
4366517	4369405	-	2889	117617447	AHA_3941	-	23S ribosomal RNA
4369644	4369719	-	76	117617447	AHA_3942	-	^{02 Ala tRNA}
4369730	4369806	-	77	117617447	AHA_3943	-	^{14 Ile tRNA}
4369875	4371424	-	1550	117617447	AHA_3944	-	16S ribosomal RNA
4449170	4449246	-	77	117617447	AHA_4011	-	^{06 Asp tRNA}
4449344	4449463	-	120	117617447	AHA_4012	-	5S ribosomal RNA
4449539	4452427	-	2889	117617447	AHA_4013	-	23S ribosomal RNA
4452666	4452741	-	76	117617447	AHA_4014	-	^{02 Ala tRNA}
4452752	4452828	-	77	117617447	AHA_4015	-	^{14 Ile tRNA}
4452897	4454446	-	1550	117617447	AHA_4016	-	16S ribosomal RNA
4474578	4474654	-	77	117617447	AHA_4035	-	^{20 Trp tRNA}
4476064	4476138	-	75	117617447	AHA_4037	-	^{01 Gly tRNA}
4476177	4476261	-	85	117617447	AHA_4038	-	^{18 Tyr tRNA}
4526310	4526386	-	77	117617447	AHA_4085	-	^{20 Trp tRNA}
4579858	4579934	-	77	117617447	AHA_4132	-	^{03 Pro tRNA}
4697520	4697596	-	77	117617447	AHA_4242	-	^{06 Asp tRNA}
4697694	4697813	-	120	117617447	AHA_4243	-	5S ribosomal RNA
4697928	4700816	-	2889	117617447	AHA_4244	-	23S ribosomal RNA
4701054	4701129	-	76	117617447	AHA_4245	-	^{04 Glu tRNA}
4701326	4702875	-	1550	117617447	AHA_4246	-	16S ribosomal RNA