Материалы:NC 009446

Вы находитесь в Инкубаторе

Это исходный материал (как правило загружен ботом)

Эта статья — часть материалов: лаборатории Биоинформатика, исследовательского проекта «Геном прокариот»

   LOCUS       NC_009446            1389350 bp    DNA     circular BCT 25-JUN-2007
   DEFINITION  Dichelobacter nodosus VCS1703A, complete genome.
   ACCESSION   NC_009446
   VERSION     NC_009446.1  GI:146328629
   KEYWORDS    .
   SOURCE      Dichelobacter nodosus VCS1703A
     ORGANISM  Dichelobacter nodosus VCS1703A
               Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Cardiobacteriales;
               Cardiobacteriaceae; Dichelobacter.
   REFERENCE   1  (bases 1 to 1389350)
     AUTHORS   Myers,G.S., Parker,D., Al-Hasani,K., Kennan,R.M., Seemann,T.,
               Ren,Q., Badger,J.H., Selengut,J.D., Deboy,R.T., Tettelin,H.,
               Boyce,J.D., McCarl,V.P., Han,X., Nelson,W.C., Madupu,R.,
               Mohamoud,Y., Holley,T., Fedorova,N., Khouri,H., Bottomley,S.P.,
               Whittington,R.J., Adler,B., Songer,J.G., Rood,J.I. and Paulsen,I.T.
     TITLE     Genome sequence and identification of candidate vaccine antigens
               from the animal pathogen Dichelobacter nodosus
     JOURNAL   (er) Nat. Biotechnol. (2007) In press
      PUBMED   17468768
   REFERENCE   2  (bases 1 to 1389350)
     AUTHORS   Myers,G.S., Parker,D., Al-Hasani,K., Kennan,R.M., Seemann,T.,
               Ren,Q., Badger,J.H., Selengut,J., DeBoy,R.T., Tettelin,H.,
               Boyce,J.D., McCarl,V.P., Nelson,W.C., Madupu,R., Mohamoud,Y.,
               Holley,T., Fedorova,N.B., Khouri,H.M., Bottomley,S.P.,
               Whittington,R.J., Adler,B., Songer,J.G., Rood,J.I. and Paulsen,I.T.
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (17-NOV-2006) The Institute for Genomic Research, 9712
               Medical Center Dr, Rockville, MD 20850, USA
   REFERENCE   3  (bases 1 to 1389350)
     CONSRTM   NCBI Genome Project
     TITLE     Direct Submission
     JOURNAL   Submitted (12-MAR-2004) National Center for Biotechnology
               Information, NIH, Bethesda, MD 20894, USA
   COMMENT     PROVISIONAL REFSEQ: This record has not yet been subject to final
               NCBI review. The reference sequence was derived from CP000513.
               COMPLETENESS: full length.

Расположение РНК[править]

Начало	Конец	Направление	Длина	PID	Ген	COG	Комментарий
9418	9494	-	77	146328629	DNO_0008	-	^{03 Pro tRNA}
18822	18898	-	77	146328629	DNO_0016	-	^{11 Arg tRNA}
38279	38355	-	77	146328629	DNO_0032	-	^{16 Met tRNA}
59791	59867	+	77	146328629	DNO_0054	-	^{03 Pro tRNA}
59891	59967	+	77	146328629	DNO_0055	-	^{11 Arg tRNA}
59993	60069	+	77	146328629	DNO_0056	-	^{09 His tRNA}
60492	60578	-	87	146328629	DNO_0058	-	^{15 Leu tRNA}
60862	60937	+	76	146328629	DNO_0059	-	^{17 Phe tRNA}
64967	65041	-	75	146328629	DNO_0066	-	^{05 Gln tRNA}
173433	173509	+	77	146328629	DNO_0165	-	^{16 Met tRNA}
208388	208739	-	352	146328629	DNO_0193	-	10Sa RNA (tmRNA)
251602	251686	-	85	146328629	DNO_0231	-	^{15 Leu tRNA}
251974	252050	-	77	146328629	DNO_0233	-	^{13 Val tRNA}
301398	301490	-	93	146328629	DNO_0283	-	^{08 Ser tRNA}
452642	452717	+	76	146328629	DNO_0409	-	^{13 Val tRNA}
452722	452798	+	77	146328629	DNO_0410	-	^{06 Asp tRNA}
452851	452927	+	77	146328629	DNO_0411	-	^{06 Asp tRNA}
502770	502859	-	90	146328629	DNO_0463	-	^{08 Ser tRNA}
657102	657178	-	77	146328629	DNO_0613	-	^{16 Met tRNA}
784217	784292	-	76	146328629	DNO_0731	-	^{04 Glu tRNA}
784324	784399	-	76	146328629	DNO_0732	-	^{04 Glu tRNA}
784416	784491	-	76	146328629	DNO_0733	-	^{02 Ala tRNA}
836029	836101	-	73	146328629	DNO_0793	-	^{11 Arg tRNA}
855026	855111	-	86	146328629	DNO_0812	-	^{15 Leu tRNA}
886311	886385	+	75	146328629	DNO_0845	-	^{10 Lys tRNA}
886435	886509	+	75	146328629	DNO_0846	-	^{10 Lys tRNA}
924031	924150	-	120	146328629	DNO_0883	-	5S ribosomal RNA
924218	927073	-	2856	146328629	DNO_0884	-	23S ribosomal RNA
927393	927468	-	76	146328629	DNO_0885	-	^{02 Ala tRNA}
927486	927562	-	77	146328629	DNO_0886	-	^{14 Ile tRNA}
927599	929146	-	1548	146328629	DNO_0887	-	16S ribosomal RNA
986200	986276	+	77	146328629	DNO_0943	-	^{03 Pro tRNA}
988296	988371	-	76	146328629	DNO_0946	-	^{07 Asn tRNA}
988410	988485	-	76	146328629	DNO_0947	-	^{07 Asn tRNA}
1082481	1082571	-	91	146328629	DNO_1046	-	^{08 Ser tRNA}
1127819	1127895	-	77	146328629	DNO_1087	-	^{11 Arg tRNA}
1128960	1129035	+	76	146328629	DNO_1089	-	^{12 Thr tRNA}
1129044	1129129	+	86	146328629	DNO_1090	-	^{15 Leu tRNA}
1242886	1242972	-	87	146328629	DNO_1193	-	^{15 Leu tRNA}
1264651	1264724	-	74	146328629	DNO_1220	-	^{19 Cys tRNA}
1264767	1264841	-	75	146328629	DNO_1221	-	^{01 Gly tRNA}
1272458	1272577	-	120	146328629	DNO_1231	-	5S ribosomal RNA
1272645	1275500	-	2856	146328629	DNO_1232	-	23S ribosomal RNA
1275820	1275895	-	76	146328629	DNO_1233	-	^{02 Ala tRNA}
1275913	1275989	-	77	146328629	DNO_1234	-	^{14 Ile tRNA}
1276026	1277573	-	1548	146328629	DNO_1235	-	16S ribosomal RNA
1320369	1320444	-	76	146328629	DNO_1289	-	^{20 Trp tRNA}
1321748	1321823	-	76	146328629	DNO_1291	-	^{12 Thr tRNA}
1321841	1321914	-	74	146328629	DNO_1292	-	^{01 Gly tRNA}
1321918	1322002	-	85	146328629	DNO_1293	-	^{18 Tyr tRNA}
1332428	1332547	-	120	146328629	DNO_1305	-	5S ribosomal RNA
1332615	1335470	-	2856	146328629	DNO_1306	-	23S ribosomal RNA
1335790	1335865	-	76	146328629	DNO_1307	-	^{02 Ala tRNA}
1335883	1335959	-	77	146328629	DNO_1308	-	^{14 Ile tRNA}
1335996	1337543	-	1548	146328629	DNO_1309	-	16S ribosomal RNA