FoldIt Wiki/Гидрофобность

Материал из Викиверситета
Перейти к навигации Перейти к поиску

Гидрофобность является одним из компонентов игры, влияющих на количество очков при моделировании структуры белка.

Введение[править]

Белки содержат гидрофобные и гидрофильные боковые цепи. Две гидрофобные цепи изображены в центре белка (с оранжевым ореолом); остальные боковые цепи гидрофильные (с синим ореолом).

Аминокислоты бывают гидрофобными или гидрофильными. Гидрофобные боковые цепи аминокислот имеют оранжевый цвет, а гидрофильные боковые цепи аминокислот имеют синий цвет.

Пояснения:

  • гидро означает "вода"
  • фобный означает "который боится"
  • фильный означает "который любит"

Итак, гидрофобные боятся воды, тогда как гидрофильные любят воду.

Как знание этого может помочь игроку:

Белки во всех клетках погружены в воду. Итак:

  • все "гидрофобные" аминокислоты предпочитают находиться внутри белка (там, где они не могут соприкасаться с окружающей водой),
  • все "гидрофильный" аминокислоты предпочитают находиться снаружи белка (там, где они могут соприкасаться с окружающей водой).

При сворачивании белка, Вы должны попытаться получить как можно больше гидрофобных боковых связей внутри белка, и как можно больше гидрофильных боковых связей снаружи белка. Однако исключения из правил почти всегда будут. Хотя скрытие гидрофобных боковых связей является хороший стратегией, но почти никогда не удается разместить каждую гидрофобную боковую связь внутри белка. Часто, по факту, биологические функции белка требуют нахождения гидрофобных боковых связей на внешней стороне белка.

Исключения[править]

Белки не всегда находятся в воде. Многие из них в действительности находятся в клеточной мембране. Клеточная мембрана состоит из липидов, которые создают эффект, противоположный воде:

  • "гидрофобные" аминокислоты любят липиды,
  • "гидрофильные" аминокислоты боятся липидов.

Некоторые виды белков в действительности могут быть внутри мембраны, а также некоторых другие частично снаружи.

См. также[править]


При создании этой страницы использовались материалы страницы Hydrophobicity согласно лицензии Creative Commons Attribution/Share-Alike 3.0